氨基酸序列是氨基酸相互連接形成肽鏈(或多肽)的順序。如果肽鏈是一個蛋白質,氨基酸序列就經常被叫做蛋白質主要結構。根據氨基酸的結構和它們連接在一起的方式,氨基酸序列只能按照一個方向讀取,并且以特定形式形成肽。
氨基酸有100多種不同類型,其中20種常用于生產蛋白質。所有氨基酸都具有一個常規結構,包含一個碳,和分別位于兩側的一個氨基NH3及羧基COOH。氨基是堿性(具有正電荷),而羧基是酸性(攜帶負電荷)。大多數氨基酸只有一個氨基和羧基,因此電荷是平衡的。氨基酸是由連接在中央碳的R基團分化變形。
一個氨基酸的R基團是特定于每個氨基酸的側鏈,這意味著具有不同的化學結構。最基本的形式是R基團被一個氫原子替代,并產生氨基酸甘氨酸。很多更高級的化學結構可以替換R基團。在酪氨酸中,一個環形結構是用碳替代了R基團。而賴氨酸則是用一個長烴鏈替代–分子由一個碳骨干與氫原子連接。
一個氨基酸的氨基和另一個羧基之間形成肽鍵,才可以形成氨基酸序列。典型的例子是兩個氨基酸結合在一起使水分子縮合反應丟失。為了延長序列產生多肽,新的氨基酸總是添加到已經存在肽鏈的羧基末端。形成一個蛋白質,需要成千上百個氨基酸相互連接。
轉變過程中蛋白質在細胞內形成。每個蛋白質需要氨基酸序列,并且取決于細胞核中的DNA。在轉換過程中,相關基因被轉變制成鏈的信使 mRNA(信使核糖核酸)。 mRNA移出細胞核進入細胞的細胞質變成核糖體,到此轉變完成。
這種mRNA作為氨基酸相互連接的模板。每個氨基酸都有一個特殊的核苷酸三聯體密碼。基于這個密碼,信使核糖核酸把自由氨基酸從細胞質攜帶到核糖體,與存在的鏈結合在一起。在mRNA傳輸完后,這個氨基酸加入到為蛋白質而形成的特定氨基酸序列。
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