作分析實驗相對來說主要的危害在于所處的環境，實驗室環境危害比較大，主要是前處理階段，酸堿鹽、有機溶劑接觸比較多，加上室內通風以便都比較差，帶來很大危害，也是有職業病：有機溶劑主要危害肝臟、肺。
操作氣相色譜危害小點，但ecd注意最好少用，懷孕或生小孩子哺乳的不要用分析儀器，畢竟污染多，做完實驗離開實驗室環境，辦公室與實驗室要分開；液相色譜主要是溶劑污染，一般都有空調的空氣環境不好，不用空調實驗室環境溫度有變化比較大影響實驗。
