免疫共沉淀（coIP）實驗案例分享

發布時間：2019-08-13 10:21 原文鏈接：免疫共沉淀（coIP）實驗案例分享

—— co-IP 檢測 Hsp90 與 Cdc37 結合情況

1、實驗材料

SKBR3 細胞，PMSF（Amresco，cat:329-98-6），cocktail（上海晶萊生物），脫脂奶粉（cat:66196131T），β-actin（上海晶萊生物）。Anti-Hsp90(santa,cat:sc-69703)、Anti-Cdc37(santa,cat:sc-13129)、Protein A+G agrose(Beyotime)，細胞刮，4 度離心機（eppendorf，centrifuge 5415R），搖床（ORBITAL SHAKER，TS-1000），電泳儀（Tanon EPS300）。低速離心機（cat:TDZ4B-WS）。

2、實驗方法

制樣：

細胞裂解液配制：基礎裂解液中加入 PMSF，cocktail 和 DTT

實驗分組：Control 組、化合物 11（10μM）、化合物 11（20μM)、化合物 11（40μM），給藥時間 24 h。
棄培養上清，PBS 洗一遍，冰上加入 150ul/孔裂解液。
于冰上裂解 30 min，為使細胞充分裂解培養瓶要經常來回搖動。
裂解完后，于 4℃ 下 12000rpm 離心 15 min。
收集蛋白上清，取少許裂解液用于后續檢測各蛋白表達情況。
剩余的裂解液加入 Anti-Cdc37，4℃ 緩慢搖晃孵育過夜。
用適量裂解緩沖液預處理 ProteinA+G，20uL/管加入各抗體孵育過夜的細胞裂解液中，4℃ 緩慢搖晃孵育 2~4 h。
免疫沉淀反應后，4℃，3000rpm，3 min，小心吸取上清，瓊脂糖珠用 1 mL 裂解液沖洗 3-4 次，最后加入 15uL 2*SDS 上樣緩沖液，100℃，5 min。
Laemmli-SDS-PAGE

電泳：

電泳時根據情況每塊膠 15mA 恒流電源；根據預染 Marker 和目的蛋白的分子量大小的相對位置判斷最佳跑膠時間，以使目的蛋白處于分離膠面的下 1/3 的最佳分辯位置。

轉膜：

將 PVDF 膜放到甲醇中浸泡 2 min
將轉膜夾打開，在代表負極的黑色面鋪上一塊濕潤的海綿墊，再添加 2 層濕潤的濾紙，將 SDS-PAGE 膠小心地鋪在濾紙上，表面再覆蓋大小合適的 PVDF 膜；然后再覆蓋兩層濕潤濾紙，再墊上濕潤的海綿墊，將紅色的正極板合上，夾好，插入轉膜槽相應的位置。
轉膜過程在 4℃ 進行，采用 100V/100mA。
麗春紅染色：轉膜過程完成后，將膜從轉膜夾中取出，立即投入麗春紅染液中染色，大約染色 5 分鐘后將膜由麗春紅中取出，用清水輕輕沖洗膜，注意觀察膜上的紅色條帶，當條帶足夠清晰后停止水洗，根據染色條帶把膜適當剪小，留出目的蛋白所在的范圍。然后用清水徹底沖洗膜，盡可能洗去殘留的麗春紅，使得條帶消失。

封閉：

一般抗體采用 5% 脫脂奶粉+TBST 封閉；封閉時間為室溫下一個小時，在搖床上進行。

一抗雜交：

在一個 1.5 ml 的 EP 管中加入 1 ml 的封閉液（5% 脫脂奶粉+TBST），再加入適量的一抗，置于 4℃ 冰箱中過夜。

洗膜：

將過夜雜交的膜從塑料袋中取出，投入含有足量體積 TBST 的洗膜盒中，于搖床上清洗，每次 10 分鐘，連續 3 次。

二抗雜交：

處理步驟類似一抗雜交步驟，不同之處在于二抗雜交可在常溫下，1 小時內完成。二抗比例控制在 1:2000～1:5000。

洗膜：

見步驟 7。

顯影：

將膜平放于干燥的平面上，將新鮮配置好的 ECL Reagent 滴加到有鉛筆記號標注的膜面上，反應 5 分鐘后用濾紙在膜的邊緣盡量吸去多余的 ECL Reagent，將膜放到化學發光儀中收集信號。