①直接法：用標記抗體與抗體中的相應抗原直接結合，操作方法簡便，特異性高，但敏感性較差，此法可用于檢定未知抗原；
②間接法：先用未標記的具有特異性的第一抗體與樣品中的相應抗原結合，然后再以標記的第二抗體與特異性的第一抗體結合；
第二抗體是用第一抗體作為抗原注入另一動物體內誘導產生的抗體，然后再結合以標記物。通過這樣的放大作用，使抗原分子上的標記物大大增多，故間接法較直接法的敏感性大為增高，約高5～10倍，故應用更為廣泛。間接法中較常用的，如過氧化物酶-抗過氧化物酶復合物法(peroxidase anti-peroxidase complexmethod， 標記方法PAP法)，該法除需一抗和二抗外，還需要制備HRP標記的抗酶抗體,即以HRP作為抗原免疫動物，制成抗HRP抗體，再以HRP對標記該抗體，制成穩定的環形PAP復合物。標本先后經一抗、二抗和PAP復合物處理后再以DAB顯色抗原存在部位可見棕黃色產物。免疫細胞學技術有了很大進展，各種新方法相繼建立。
單克隆抗體 （monoclonal antibody）制備技術極大地提高抗體的特異性與免疫組化染色的精確性。繼PAP法之后由于生物素-親合素等試劑的應用，為檢測微量抗原、受體、抗體提供了更精確的技術。