（1）局部用藥：可制成油劑、霜劑、粉劑、溶液等，濃度為含制霉菌素10萬U/g或/ml基質，依患者具體情況援用一種劑量一型局部涂擦，每日2—4次。
（2）口服：腸道念珠菌病可給予制霉菌素口服，新生兒每日20—40萬U，2歲以下每日40—80萬U，2歲以上每日100—200萬U，分3—4次飯前服用，療程7—10日。口服不易吸收，全部由糞便排出。不良反應有惡心、嘔吐、輕瀉。
（3）霧化吸入：適用于呼吸系統念珠菌病，制霉菌素5萬U溶于2ml0.9%氯化鈉溶液中霧化吸入。
