臨床中需要與GPP相鑒別的疾病主要有急性泛發性發疹性膿皰病、IgA天皰瘡、角層下膿皰性皮病（Sneddon Wilkinson病）、嗜酸性膿皰性毛囊炎、反應性關節炎（Reiter病）等。對于兒童患者，則需與新生兒中毒性紅斑、新生兒暫時性膿皰性黑變病等相鑒別 [1] 。
急性泛發性發疹性膿皰病：為重癥藥疹的一種類型，一般有明確的用藥史，以水腫性紅斑基礎上的非毛囊性、泛發性、淺表性小膿皰為臨床特征，組織學上可表現為嗜酸性粒細胞增多，糖皮質激素治療有效，病程呈自限性。
IgA天皰瘡：表現為紅斑基礎上出現松弛性水皰或膿皰，直接免疫熒光示棘細胞間IgA沉積。
角層下膿皰性皮病（Sneddon Wilkinson病）：以環狀皮損為臨床特征，屈側分布居多，表現為表淺的無菌性膿皰，一般無海綿狀膿皰 。
嗜酸性膿皰性毛囊炎：以毛囊性丘疹、膿皰為臨床特征，組織學上表現為毛囊周圍嗜酸性粒細胞浸潤 。
反應性關節炎（Reiter病）：常與膿皰型銀屑病重疊，伴有關節炎和尿道炎，皮損滲出明顯，表面有黃褐色結痂。
新生兒中毒性紅斑：新生兒起病，以丘疹、膿皰、水皰和點狀紅斑為臨床特征，組織學上表現為嗜酸性粒細胞組成的膿皰。
新生兒暫時性膿皰性黑變病：新生兒起病，以不伴有紅斑的膿皰，且膿皰破裂后遺留色素沉著為臨床特征，組織學上表現為角層下中性粒細胞浸潤。