1.尿常規 鏡檢白細胞增多，若見白細胞(或膿細胞)管型，則提示病變在上尿路。紅細胞也可增多，血尿型者甚至為肉眼血尿。尿蛋白可增多，但一般＜2.0g/d，多為小分子蛋白，腎小管功能受損時，可出現尿比重降低，晨尿pH增高。
尿白細胞排泄增加提示尿路炎癥，在診斷方面也具有重要意義。無癥狀菌尿癥時膿尿發生率約37%，白細胞排泄＞5個/mm3即屬異常。膿尿與菌尿有極顯著的相關性，可作為最初的篩選方法。白細胞酯酶試紙法對預測鏡下菌尿和陽性尿培養的敏感性均為100%，如再結合鏡下膿尿、菌尿，其特異性亦達100%。
用抗生素或化療藥物治療，不久即可呈現無菌性膿尿。無菌性膿尿也是腎結核、結石、鎮痛劑濫用、少數需氧菌和厭氧菌感染的表現。尿路損傷如衣原體尿道炎、腎小球腎炎和腎病等也可見無菌性膿尿。
不伴膿尿的尿路感染見于藥物和再生性障礙等引起的白細胞減少癥，腎臟集合系統遠端感染性病變(如腎皮質膿腫)，偶見于梗阻性尿路病。
白細胞尿不是尿路感染恒有的特點，連續幾次的尿標本白細胞計數變化不定。單次尿標本查不到白細胞不應視為無菌尿的證據。膿尿取決于尿液流量和尿pH值。一天之內尿細菌計數也可不同，一般來講，宜查晨尿標本。
白細胞管型是上尿路炎癥性疾病可靠的證據，但與顆粒管型一樣并非感染所特有。活動性腎盂腎炎時常見不到這些管型。做管型計數時須用新鮮尿標本。
鏡下血尿不是提示細菌感染的可靠證據。無蛋白尿不能排除尿路感染，大多數尿路感染病人尿蛋白排泄低于2.0g/24h。
2.尿細菌檢查 有意義菌尿是指徑直接取得(膀胱穿刺)的膀胱尿證實有細菌繁殖(不管計數多少)或取中段尿培養計數大于105/ml。當有尿路梗阻、頻繁排尿，標本采取不當以及使用抗生素時均可影響培養結果。但如連續3次均得到相同的結果時，其診斷價值將從單次的80%增加到95%以上。尿菌定量培養結果評定標準是尿含菌數大于105/ml為陽性，小于104/ml為污染，介于104～105/ml之間需復查或結合臨床綜合考慮作出診斷。但球菌繁殖速度較慢，尿含菌數達103～104/ml，已有診斷意義。根據臨床需要，除作普通菌培養外，高度懷疑原漿型菌株可作高滲培養，這可提高L型菌株培養陽性率。對多次尿普通菌培養陽性的慢性腎盂腎炎的診斷有重要意義。L型細菌是沒有固體細胞壁的細菌。細菌接觸到損傷其表面的物質，如抗生素或抗體-補體-溶菌酶后可轉變成L-型細菌。腎髓質的高張力狀態有利于其存活。L-型細菌毒力較低，轉為正常細菌后毒力可恢復正常。必要時尚可作厭氧菌培養，真菌培養。培養陽性時應作藥物敏感試驗，以指導臨床選擇抗菌藥物，不離心尿若直接鏡檢發現每個高倍鏡下有1個細菌，對判斷有意義菌尿也有100%的特異性和78%的敏感性。本法簡便，陽性率高，并可確定是桿菌抑或球菌，是革蘭陽性抑或陰性，這對及時選用有效藥物治療很有參考價值。
尿液標本留取的方法直接影響診斷的準確性，晨起第1次中段尿仍有首選方法，其次為導尿法和恥骨上膀胱穿刺取尿，但40%～60%的老年人存有輕重不一的尿失禁，可采用外套管收集標本，該方法與導尿法比較有100%的敏感性和94%的特異性。標本留取后不立即培養時應置入冰箱保存。尿標本在室溫放置2h以上細菌即可增殖。
3.尿細胞計數 近年多應用1h尿細胞計數法，其評判標準為白細胞30萬/h為陽性，小于20萬/h為陰性，介于20萬～30萬/h需結合臨床判斷。尿細胞計數常用于本病慢性期，尤其尿常規無明顯異常，多次尿培養無陽性結果，又無特異臨床表現者。
4.血常規檢查 急性期血白細胞計數和中性粒細胞可增高，慢性期紅細胞計數和血紅蛋白可輕度降低。
5.血清學檢查 較有臨床意義的為：①尿抗體包裹細菌檢查，在熒光鏡下觀察用熒光素標記的抗人體蛋白抗體處理的尿細菌，若表面有抗體包裹則大多屬于腎盂腎炎，有助于尿路感染的定位診斷；②鑒定尿細菌的血清型，有助于區分再發性腎盂腎炎的性質，若再發時與前次為同一血型則屬復發，而2次為不同血清型者為重新感染。
6.腎功能檢查 慢性期可出現持續性功能損害：①腎濃縮功能減退如夜尿量增多，晨尿滲透濃度降低；②腎酸化功能減退如晨尿pH增高，尿HCO3－增多，尿NH4＋減少等；③腎小球濾過功能減退如內生肌酐清除率降低，血尿素氮、肌酐增高等。