1.實驗室檢查
可見紅細胞沉降率升高，RF和ANA一般陰性，血小板升高。
2.影像學檢查
脊柱和骶髂關節的X線或CT表現和脊柱關節炎類似，但似乎腸病性關節炎患者的病變更輕。在骶髂關節炎中，多數腸病性關節炎患者表現為單側病變。少數患者可出現脊柱椎體骨橋、恥骨聯合增寬和髖關節間隙變窄及骨侵蝕等改變。
3.腸鏡檢查
潰瘍性結腸炎，結腸檢查見病變部位腸管彌漫性充血、水腫糜爛、淺小潰瘍，附有膿苔，或可見腸管增厚、狹窄、假息肉。鋇灌腸可見黏膜皺襞粗亂或細顆粒改變，多發性淺龕影或小的充盈缺損，腸管縮短，結腸袋消失可呈管狀。克羅恩病病變范圍廣，臨床表現可酷似潰瘍性結腸炎，但往往無血便，以腹痛、黏液便為多見，也可出現腸梗阻。病變呈節段性，病灶間的黏膜正常。