自身抗體是指針對自身組織，器官、細胞及細胞成分的抗體。人體的生長、發育和生存有完整的自身免疫耐受機制的維持，正常的免疫反應有保護性防御作用，即對自身組織、成分不發生反應。—旦自身耐受的完整性遭到破壞，則機體視自身組織、成分為“異物”，而發生自身免疫反應，產生自身抗體。正常人體血液中可以有低滴度的自身抗體，但不會發生疾病，但如果自身抗體的滴度超過某—水平，就可能對身體產生損傷，誘發疾病。
自身免疫性疾病中有許多自身抗體，其中最重要的是抗核抗體。另外，抗心磷脂抗體、中性粒細胞胞漿抗體、抗線粒體抗體、抗紅細胞抗體、抗血小板抗體、抗內皮細胞抗體、抗神經原抗體、類風濕因子、抗甲狀腺球蛋白抗體、抗胰島素體抗體等也都是自身抗體。