一、優點
（1）成本低，根據Photon 的預測，預計到2012 年下降到2.08 美元/w；預計薄膜電池的平均價格能夠從2.65 美元/w 降至1.11 美元/w，與晶體硅相比優勢明顯；而相關薄膜電池制造商的預測更加樂觀，EPV 估計到2011 年，薄膜組件的成本將大大低于1 美元/w；Oerlikon 更估計2011 年GW 級別的電站其組件成本將降低于0.7 美元/w，這主要是由轉化率提高和規模化帶來的。
（2）弱光性好
（3）適合與建筑結合的光伏發電組件(BIPV)，不銹鋼和聚合物襯底的柔性薄膜太陽能電池適用于建筑屋頂等，根據需要制作成不同的透光率，代替玻璃幕墻。
二、缺點
（1）效率低，單晶硅太陽能電池，單體效率為14%-17%(AMO)，而柔性基體非晶硅太陽電池組件（約1000平方厘米）的效率為10-12%，還存在一定差距。
（2）穩定性差，其不穩定性集中體現在其能量轉換效率隨輻照時間的延長而變化，直到數百或數千小時后才穩定。這個問題一定程度上影響了這種低成本太陽能電池的應用。
（3）相同的輸出電量所需太陽能電池面積增加，與晶體硅電池相比，每瓦的電池面積會增加約一倍，在安裝空間和光照面積有限的情況下限制了它的應用。