SCID是一類系統免疫缺陷病，體液與細胞免疫功能均明顯異常。通常，IgG、IgA與IgM很低，但少數病人可能有1～2項免疫球蛋白正常。病人幾乎普遍無抗體反應。部分病例血液和淋巴組織B淋巴細胞減少。所有細胞免疫試驗均異常，外周血T淋巴細胞數明顯減少。記憶抗原試驗和皮內植物血凝素試驗反應極差，體外T淋巴細胞功能試驗亦明顯異常，有絲分裂原增殖反應缺如。
