1、嚴格控制進水水質，保證裝置在符合進水指標要求的水質條件下進行。進水水質不符合要求，極容易造成反滲透膜的污堵，使得耗材很快失效，嚴重影響出水水質。
2、反滲透的總進水量由RO進水調節閥來控制，如果反滲透進水量沒有變化，不要調整RO進水調節閥，嚴禁全開或全閉。RO排水調節閥用來調整系統回收率，如回收率沒有變化，也不要亂動濃排調節閥，絕對禁止全開或全閉。
3、裝置不能長時間停運，每天至少運行2小時，如準備停機72小時以上，應用化學清洗裝置向組件內充裝1%嚴硫酸氫納和18%甘油實施保護。
4、反滲透裝置每次停機后啟動都應讓裝置在進水壓力小0.4Mpa條件下沖洗10分鐘。
5、操作壓力控制，應在滿足產水量與水質的前提下，取盡量低的壓力值，這樣有利于降低膜的水通量衰減，減少膜的更換率。
6、操作工應在每小時對運行參數進行記錄，檢測純水設備的使用情況和出水水質。
主要記錄內容如下：
（1）進水：
PH值，電導率，壓力，SDI，水溫。
（2）產水：
電導率，流量，PH值；
（3）濃水：
流量，壓力以及各段進水壓力。
7、當反滲透裝置發生高低壓報警時，先檢查保安過濾器至高壓泵之間的手動閥開度是否太小，然后檢查RO進水調節閥及濃排閥是否正常，再按高低壓報警復位按鈕，重新啟動純凈水生產設備。
8、進水溫度控制，應根據實際用水量，取臨界壓力（進水壓力低于該值脫鹽率產生明顯下降的壓力值）不能滿足產水與水質要求的最低溫度作為該時間段內的進水溫度，這樣可以降低膜水量的衰減。