發酵工業的應用研究

隨著有關學科的發展和生產工藝的改進，人們對微生物的利用本領越來越高。以微生物為原料進行生產的新產品如雨后春筍，層出不窮。　　 在我們已經講述過的生物技術的內容中已多次提到了微生物的功績，事實上，生物技術的諸多成果，最易通過微生物轉化為生產力了。如果說，現代生物技術已成功地應用于工業生產的話，那么，主要應歸功于利用和改造微生物的功績。　　 現今的微生物發酵工程已逐漸趨于成熟，并在工業生產中創造出了巨大的經濟效益。創立了劃時代的發酵工業。現代微生物發酵工藝與我們民間延續了幾千年的傳統的發酵技術有著很大的不同，主要表現在；所使用的微生物是經過選育的優良菌種并經過純化，具有更強的生產能力；發酵條件的選用更加合理，并加以自動控制等條件，生產效率更高；生產規律模大，產品種類繁多。　　 讓我們再進一步來看看微生物發酵和發酵工程的涵義吧。我們可以簡單地把微生物發酵比喻成給微生物提供食品和適宜的生長條件，讓它們生長繁殖、并各顯其能，用它們的身體、它們的功能，為人類提供產品和服務。隨著科學和技術的發展，發酵所包含的含義也越來越廣。發酵及其產品的獲得，是一個包含生物化學反應的工業過程，主角有兩個，一個是微生物，一個是發酵底物，即微生物賴以生存的營養條件。　　 現代微生物發酵工程主要包括以下一些內容：　　 ⑴利用現代化的手段對微生物加以篩選和改造，以形成更符合工業生產需要的新菌種的工業微生物育種技術、其中滲透了基因工程、細胞工程的一些內容，經過改造的、滿足人們需要的微生物菌種通常被稱之為工程菌；　　 ⑵微生物菌體的生產，即利用先進的生產工藝高速地對某種微生物進行大量的純培養，即工程菌的克隆；　　 ⑶從微生物中分離有用物質，如利用微生物以一些廉價的廢棄物做底物生產單細胞蛋白質等；　　⑷微生物初級和次級代謝產物的發酵生產，如生產氨基酸，抗生素等生理活性物質；　　 ⑸發酵產物的分離純化和加工后處理；　　 ⑹利用微生物控制或參與工業生產，如采礦、冶金等；以及微生物生物反應器的研究開發，新型發酵裝置、生物傳感器和使用電子計算機控制的自動化連續發酵的技術等等。　　 盡管我們今天享用的許多產品還離不開傳統的發酵工業，但現代微生物工程已沖擊到包括傳統食品發酵業、制藥業、有機酸制造業、飼料業等各個產業。人們已經感受到了集現代科學技術之大成，運用基因工程，細胞工程和酶工程改良菌種，采用高產工程菌并利用現代工業手段從多方面對舊工藝實行改造所帶來的實惠。　　 通過菌種和工藝的改進，世界微生物工程產品稅業在整個世界經濟中爭得了一席之地，總產量較傳統產業提高了五倍以上，其中重要的醫藥產品——抗生素的產量增加達１０倍以上，飼料酵母達十幾倍。現代微生物發酵工程首先給制藥業帶來了可喜的變化，重要藥品的產量大幅度增長。　　 其次，微生物工程對沿用傳統技術的食品行業形成了猛烈的沖擊，許多國家正致力于用現代生物技術改造舊工藝人們已經從又臟又累，衛生條件又差的作坊式的生產中解放出來，代之而起的是大型的、自動化的生產設備。我們所食用的醬油之類的普通食品已將被賦與極具現代化的色彩（用細胞融合技術育成的高產菌株制造醬油等先進手段頗具成效）。　　 此外，現代發酵技術還給我們帶來了一些以前不曾存在的新型產品，比如說一種被稱作單細胞蛋白的新型動物飼料，就是利用發酵工程以農作物秸桿、造紙廢液等廢棄物培養藻類、放線菌、細菌、酵母等單細胞生物而獲得的高產產品，經不僅含有高蛋白，而且含有豐富的維生素和脂類等，既是家禽家畜的良好飼料，又可用來生產高營養的人造蛋白食品。　　 通過ＤＮＡ重組技術可獲得高產的菌株，使單細胞蛋白生產業如虎添翼。全世界僅此一項的總產值就達幾十億美元。微生物發酵工程給我們未來的食品業將注入無限的生機和希望，不僅可通過微生物工廠大量生產我們所需的食品，而且將形成無污染的食品，并朝著低投入、高效的方向發展。給人類帶來巨大的好處。除了醫藥和食品工業這外，微生物發酵工程還在能源開發、礦產開發和環境保護方面大顯身手。　　 無所不包的微生物發酵工程雖然材料并不起眼，但它卻是工程浩大的、生物技術向著產業化進軍的開路先鋒，上聯龐大的工業體系，下聯生物領域的生物基礎研究，歷史淵源流長，應用前景無限廣闊。 21世紀生物化工發展及對策 眾所周知，21世紀最具發展潛力的兩大產業是信息技術（IT）和生物技術。信息技術發展迅猛，并已滲透到社會生活的各個角落。有關信息技術的報道——多媒體、互聯網、信息全球化等，不但頻頻亮相于媒體，而且與我們的日常生活息息相關。而與IT的轟轟烈烈相比，生物技術看起來卻平平淡淡，雖然基因、克隆、人類基因組計劃、生物多樣性等字眼經常見諸報端，但離我們的生活似乎還很遙遠。所以，也有專家這樣評論：20世紀不是生物技術的世紀，而是生物工程蓄勢待發的世紀，21世紀才是生物工程的世紀。克隆羊多利的誕生，人類基因組90％測序工作的完成，歐美、日本等發達國家對生物技術產業投資的逐年加大，世界各大公司生命科學產業的合并浪潮一浪高過一浪，所有這一切，都使我們相信，21世紀的的確確是生物技術的時代。 生物化學工程（又叫生化工程或生物化工）是化學工程與生物技術相結合的產物。生物化工是生物技術的重要分支。與傳統化學工業相比，生物化工有某些突出特點：①主要以可再生資源作原料；②反應條件溫和，多為常溫、常壓、能耗低、選擇性好、效率高的生產過程；③環境污染較少；④投資較小；⑤能生產目前不能生產的或用化學法生產較困難的性能優異的產品。由于這些特點，生物化工已成為化工領域重點發展的行業。 1. 世界生物化工行業的現狀 生物化工發展至今已經歷了半個多世紀，最早主要是生產抗生素；隨后，是為氨基酸發酵、舀體激素的生物轉化、維生素的生物法生產、單細胞蛋白生產及淀粉糖生產等工業化服務。自20世紀80年代起，隨著現代生物技術的興起，生物化工又利用重組微生物、動植物細胞大規模培養等手段生產藥用多肽、蛋白、疫苗、干擾素等。而且，生物化工的應用已涉及到人民生活的方方面面，包括農業生產、化輕原料生產、醫藥衛生、食品、環境保護、資源和能源的開發等各領域。隨著生物化工上游技術——生物工程技術的進步以及化學工程、信息技術（IT）和生物信息學（bioinformatics）等學科技術的發展，生物化工將迎來又一個嶄新的發展時期。 生物化工行業經過50多年的發展，已形成了一個完整的工業體系，整個行業也出現了一些新的發展態勢。下面簡要描述生物化工行業的現狀。 1．1工業結構 由于生物化工涉及面廣，涉及的行業多，所以從事生物化工的企業較多。據報道，90年代中期，美國生物化工企業有：000多家，西歐有580多家，日本有300多家。近年來，雖然由于行業競爭日趨激烈，生物化工企業有較大幅度減少，但與生命科學（主要指醫藥和農業生化技術）諸侯割據的局面相比，生物化工行業依然是百花齊放，百家爭鳴。既有象諾華、捷利康等從事生命科學的世界性大公司，也有象DSM、諾和諾德等大型的精細化工公司，當然也有在某一方面有專長的小公司如Altus等。而且，由于世界大公司正把注意力向生命科學部分轉移，生物化工行業百花齊放的局面在很長一段時間內不會有什么改變。 1．2產品結構 傳統的生物化工行業主要是指抗生素（如青霉素等）、食品（如酒精、味精等）等行業，而在目前，它已幾乎滲透到人民生活的各方面如醫藥、保健、農業、環境、能源、材料等。同時，生物化工產品也得到了極大的拓展：醫藥方面有各種新型抗生素、干擾素、胰島素、生長激素、各種生長因子、疫苗等；氨基酸和多肽方面有賴氨酸、天冬氨酸、丙氨酸、蘇氨酸、脯氨酸等以及各種多肽；酶制劑有160多種，主要有糖化酶、淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纖維素酶、青霉素酶、過氧化氫酶等；生物農藥有Bt、春日霉素、多氧霉素、井崗霉素等；有機酸有檸檬酸、乳酸、蘋果酸、衣康酸、延胡索酸、已二酸、脂肪酸、卜酮戊二酸、l亞麻酸、透明質酸等。還有微生物法1，3．丙二醇、丙烯酞胺等。 目前，全球生物化工年銷售額在400億美元左右，每年約以7％～8％的速率增長。從產品結構來看，生物化工領域生產規模范圍極廣，市場年需求量僅為千克級的干擾素、促紅細胞生長素等昂貴產品（價格可達數萬美元／g）與年需求量逾萬噸的抗生素、酶、食品與飼料添加劑、日用與農業生化制品等低價位產品（部分價格不到：美元／g）幾乎平分秋色。高價位的產品市場份額在50％～60％，低價位的產品市場份額在40％～50％。而且，根據近年來生物化工的發展趨勢及人們對醫藥衛生的重視來看，高價位產品的發展速率高于低價位產品。 1．3技術水平 生物化工經過80年代以后的蓬勃發展，不僅整個行業技術水平有大幅度提高，而且許多新技術也得到廣泛應用。 1．3．1發酵工程技術已見成效 據估計，全球發酵產品的市場有120～130億美元，其中抗生素占46％，氨基酸占16.3％，有機酸占13．2％，酶占10％，其它占14．5％。發酵產品市場的增大與發酵技術的進步分不開。現代生物技術的進展推動了發酵工業的發展，發酵工業的收率和純度都比過去有了極大的提高。目前世界最大的串聯發酵裝置已達75 m＼許多公司對發酵工藝進行了調整，從而降低了生產成本。如ADM（Archer Danie1s Mid1and）和Cargill公司在20世紀90年代初對其發酵裝置進行改造，將以碳水化合物為原料的生產工藝改為以玉米粉為原料，從而降低了生產成本，ADM公司生產的賴氨酸成本比原先降低了一半。 1．3．2酶工程技術有了長足的進步 酶工程技術包括酶源開發、酶制劑生產、酶分離提純和固定化技術、酶反應器與酶的應用。目前世界酶制劑從酶源開發到酶的應用都已進入了良性發展階段，各階段生產企業和用戶關系密切，合作廣泛。據報道，1998年全球工業酶制劑的銷售額為13億美元，預計到2010年將增長到30億美元，每年以6．5％的速率增長。其中食用酶占40％，洗滌用酶占33％，其它（主要是紡織、造紙和飼料等用酶）占27％。 1．3．3分離與純化技術也有很大進步 影響生化產品價格的因素，首當其沖的是分離與純化過程，其費用通常占生產成本的50％～70％，有的甚至高達90％。分離步驟多、耗時長，往往成為制約生產的"瓶頸"。尋求經濟適用的分離純化技術，已成為生物化工領域的熱點。已大規模應用的分離純化技術有：雙水相革取、新型電泳分離、大規模制備色譜、膜分離等。 1．3．4上游技術廣泛應用于下游生產 利用基因工程技術，不但成倍地提高了酶的活力，而且還可以將生物酶基因克隆到微生物中，構建基因菌產生酶。利用基因工程，使多種淀粉酶、蛋白酶、纖維素酶、氨基酸合成途徑的關鍵酶得到改造、克隆，使酶的催化活性、穩定性得到提高，氨基酸合成的代謝流得以拓寬，產量提高。隨著基因重組技術的發展，被稱為第二代基因工程的蛋白質工程發展迅速，顯示出巨大潛力和光輝前景。利用蛋白質工程，將可以生產具有特定氨基酸順序、高級結構、理化性質和生理功能的新型蛋白質，可以定向改造酶的性能，從而生產出新型生化產品。 1．3．5新技術在生物化工中也得到了極大的應用 比如，在超臨界液體狀態下進行酶反應，從而大大降低酶反應過程的傳質阻力，提高酶反應速率。超臨界C02無毒、不可燃、化學情性、易與反應底物分離。利用超臨界CO2取代有機溶劑進行酶反應，具有極大的發展潛力。又比如，微膠羹技術已被廣泛用于動物細胞的大規模培養、細胞和酶的固定化以及蛋白質等物質的分離方面。 2．世界生物化工行業的發展趨勢 2．1工業結構 行業與行業間的劃分將日趨模糊，企業間的合作將加大。目前，許多從事醫藥、農業、環境、能源等方面生產的企業，正在從事生物化工生產。特別是某些從事傳統化工行業的生產廠家，也紛紛涉足生物化工領域。如杜邦公司，長期以來主要從事有機化工和聚合材料的生產，現在正加大生物化工的開發力度，已開發成功了生物法生產1,3-丙二醇工藝，并正在開發用改性大腸桿菌生產己二酸工藝。DSM公司以前主要從事抗菌素方面的生產，現也加大了生物化工的投資力度。 由于生物化工涉及面廣，許多生化公司都有自己的專長，它們之間為了商業利益的合作也非常活躍。此外，隨著從事傳統行業的生產廠家的加入，由于技術與生產方面的原因，它們與從事生物化工開發與生產的企業合作也很頻繁。所有這一切，都使生物化工行業的合作越來越廣泛。如杜邦公司與杰寧科樂公司合作開發用生物法生產1，）丙二醇，進一步生產PTT樹脂。荷蘭的Purac公司與美國Cagill公司合資建設年產3．4萬tL。乳酸裝置，并計劃進一步發展到6．8萬V入DSM公司與美國Maxygen公司簽定了三年的研究合同，以利用Maxygen的DNA重排和分子培養技術，開發在7一ADCA和其它青霉素生產中使用的酶和菌種。 2．2產品結構 生物化工產品正向專業化、高科技含量、高附加值方向發展。傳統的低價位產品受到冷落，而高價位產品如生化藥物、保健品、生化催化劑等則備受青睞。許多公司為了追求較高利潤，都將低附加值的產品剝離。如日本武田藥品工業公司不再生產味精，轉而生產其它高附加值的調味品如肌甘酸二鈉（IMP）和鳥甘酸二鈉（GwtP）。另外，生物化工將涉足它以前很少涉足的領域如高分子材料和表面活性劑等。 生化藥物由于附加值高而成為今后生物化工領域發展的重點。1997年生化藥物市場銷售額達130億美元，其中細胞分裂素80億美元，激素30億美元，其它20億美元；就具體藥物而論，促紅細胞生長素35億美元，人胰島素18億美元，粒性白細胞克隆刺激因子16億美元，人生長激素15億美元，小干擾素11億美元。預計今后其市場銷售額還將以8％的速率增長。 在氨基酸方面，雖然用于藥物合成氨基酸的量相對較小，但其發展潛力很大。據報道，500種主要藥物中，有18％含有氨基酸或其衍生物的合成。在藥物合成中，使用最廣泛的是L。脯氨酸、r苯甘氨酸和r對羥基苯甘氨酸。L。脯氨酸用于血管緊張素轉化酶（ACE）的合成，匹苯甘氨酸和r對羥基苯甘氨酸用于抗生素的合成。另外，多肽也是今后的發展重點之一。多肽是指有2以上氨基酸用肽鍵組成的化合物，在臨床上使用非常廣泛，主要用于治療癌癥、HIV病毒和兔疫系統功能減退、對傳統抗生素產生抗體的感染以及疫苗等。全球合成多肽原藥的產量在100kg左右，但銷售額達2．5億～3億美元，而做成制劑的銷售額則達25億～30億美元。多肽原藥需求量的年增長率在10％以上。 碳水化合物方面，用于臨床的碳水化合物受到人們越來越多的關注。但是，用于臨床的碳水化合物結構復雜，如一對單糖，其不同的化學鍵就多達22種。因此，用化學法合成復雜的碳水化合物比較困難，難以實現工業化，而用酶法合成則是一條切實可行的途徑。 作為生化催化劑的酶，也將是今后發展的重點。1997年，生化用催化劑銷售額約1．3億美元，在過去的3～5年間，每年增長速率在8％～9％，預計在未來的3～5年間，將以同樣速度增長。生化催化劑主要用于手性藥物的合成。當前，手性藥物已成為國際新藥研究與開發的新方向之一。 1997年手性藥物制劑世界市場的銷售額為879億美元，占藥品市場的28．3％，到2000年將達到900億美元。在未來的25年內，約有一半的手性藥物要通過生化催化合成，因此，生化催化劑無論從需求量和需求種類來看，都具有很大的發展潛力。 生化表面活性劑由于具有無毒、生物降解性好等優點，今后可能成為表面活性劑的升級換代產品，但目前還處于探索階段。 生物化工在高分子材料、特殊化學品、生物晶片、環保等方面也將有極大的發展潛力。 2．3技術水平 不斷提高菌株活力、發酵水平、生化反應過程、分離純化水平，依然是生物化工面臨的課題。 在菌種開發方面，由于從20世紀70年代以來從自然界中篩選菌種以獲得新的代謝產物的機會明顯減少，人們便考慮利用已知菌種經適當改變其代謝特性后生產新的產品。如日本協和發酵公司已成功地把生產谷氨酸的菌種改為生產色氨酸。 在生化反應器方面，反應器放大一直是一個老大難的問題。因此，利用計算機技術對整個生化反應過程進行數字化處理，從而優化反應過程，是今后的發展方向之一。 在分離純化方面，親和層析受到廣泛重視，并有人研制了一種綜合專家系統軟件包，可在幾分鐘內告知對方被分離物系的分離方法和順序，以便根據產品所需進行取舍。 另外，在生化過程的在線檢測和控制方面，利用生物傳感器和計算機監控，依然是今后的發展方向。 在酶催化反應中將發展有機溶劑中的催化反應。 生物上游技術的發展，將對生物化工產生深遠影響。人們對從病毒、細菌、植物、動物到人類基因組順序測定工作十分重視，并在此基礎上形成了基因許多產品一哄而上，盲目上馬，遍地開花，最終形成惡性競爭，許多企業破產倒閉。在競爭中生存下來的企業，也是元氣大傷，難以進一步組織技術改造。如僅江蘇省停產的發酵生產線就多達上百條。另外，行業內企業間的生產水平相差懸殊，企業技術裝備水平達到20世紀80年代以后國際先進水平的僅占20％～30％，多數處于20世紀60～70年代水平。 二是產品結構不合理，品種單一，低檔次產品重復生產，不能適應需求。在我國高檔的醫藥生化產品如激素、生長因子、干擾素、藥用多肽等，有的產量很小，有的沒有生產，因此每年都需進口。 三是在生產技術上，工藝、設備不配套，上下游技術不配套，產物的收得率低。我國雖然某些產品如檸檬酸、乳酸等發酵水平較高，但大多數產品的收率都低于國外，酶制劑的活力也明顯低于國外，生化反應器和分離純化技術更是落后國外15～20年。每年都要花費大量資金從國外進口生物反應器、細胞破碎機、分離純化設備及分離介質、生物傳感器和計算機監控設備。 四是有些產品投入產出比達15／＝以上，造成嚴重的資源浪費和環境污染。 五是基礎研究薄弱，技術創新能力不強，企業的技術開發、技術吸收能力差，生產發展多數依靠傳統的夕蜒型、粗放型擴大投資的增長模式，效益低、市場競爭力低。 3．2 建議針對我國生物化工行業存在的問題，筆者有以下建議： 3．2．1 擴大經濟規模，提高競爭力要鼓勵建設大型的生物化工企業集團公司，使之集科研、開發、生產、銷售干一體。尤其要培育一批科技創新型企業。同時，也要鼓勵在某些方面有一定特色的小型技術創新型生化公司的發展，并淘汰一批生產規模小、生產技術落后、沒有市場競爭力的企業，從整體上優化我國生物化工的產業結構。 3．2．2 調整產品結構要發展高檔產品，如高檔醫藥生化產品、功能性食品及添加劑（主要有低熱值、低膽固醇、低脂肪、提高免疫功能、抗炎、抗癌等產品）、生化催化劑等。另外，也應發展眾多精細化工產品及用化學法無法生產或很難生產的產品，如微生物多糖、生物色素、工業酶制劑、甜味劑、表面活性劑、高分子材料等。 3．2．3 節約有限資源，強化環境保護在生化生產組學（genomics）。近年來又在信息學（informatics）的基礎上建立了生物信息學（bioinformatics）。信息學的內容包括信息科學十生物技術十生物工程十生物動力學等的綜合信息系統。可以預見，基因組學和生物信息學在生物化工中應用的商業前景極為可觀。 另外，其它行業的新技術如分子蒸餾技術、組合化學（combinatorical chemistry）等，也將在生物化工中得到應用。 3. 我國生物化工的發層現狀及建議 3．1發展現狀 我國生物化工行業經過長期發展，已有一定基礎。特別是改革開放以后，生物化工的發展進入了一個嶄新的階段。目前生物化工產品也涉及醫藥、保健、農藥、食品與飼料、有機酸等各個方面。 在醫藥方面，抗生素得到迅猛發展61998年我國抗生素的產量達到33 486h青霉素的產量居世界首位。其它生化藥物中，初步形成產業化規模的有干擾素、白細胞介素。2、乙型肝炎工程疫苗。 在農藥方面，生物農藥品種達12種，主要有蘇云金桿菌、井崗霉素、赤霉素等。其中，井崗霉素的產量居世界第一位。 在食品與飼料方面，作為三大發酵制品的味精、檸檬酸、酶制劑的產量也有很大的增加／1998年味精產量從1990年的22．3萬、增加到56．4萬一檸檬酸產量從1990年的6．13萬、增加到56．4萬一酶制劑從1990年的8．5萬t增加到24萬t。酵母及淀粉糖的產量也有明顯增加。我國的味精生產和消費居世界第一，檸檬酸的生產和出口也居世界第一。另外，1998年乳酸的產量在1．5萬t左右，賴氨酸的產量在2萬t左右，卜蘋果酸的產量在6000t。 在有機酸方面，衣康酸的產量達5000乙我國開發的生物法長鏈二元酸工藝居世界領先地位，目前生產能力達500Va以上，并有數家企業有建設長鏈二元酸生產裝置的意向。 在保健品方面，我國已能用生物法生產多種氨基酸、維生素和核酸等。另外，我國生物法丙烯酞胺的生產能力達到2萬V山與日本同處于世界領先地位。 但是與發達國家相比，我國生物化工行業存在著許多問題： 一是我國的生物化工產業主要以醫藥、輕工、食品業為主。部分企業對生物化工產品大都是精細化工產品這一點了解不夠，加之行業規范也不夠，導致過程中，應選擇合適的原料，以降低成本與消耗，并加強廢物處理，減少環境污染。 3．2．4提高生產技術水平，特別是下游技術水平因為我國生物技術上游技術水平與國外相差僅3～5年，而下游技術水平則比國外相差15年以上，改造傳統發酵產品生產技術，不斷提高發酵法產品的生產技術水平，開發生物反應器，提高我國生物化工產品分離和提純技術，大規模開發生物化工裝備等應首先提上議事日程。另外，還應積極采用微生物法代替化學法，開發基礎化工新產品的工業化生產技術。 3．2．5加強產學研結合，注重上下游結合國內生物化工技術力量分散，為了做到優勢互補，應加強產學研結合。另外在生物化工生產過程中遇到的很多問題，都是由于上、下游結合不夠緊密而影響技術經濟指標。因此，在人力和財力的投入上，應考慮上下游結合，以加快生物化工產業的發展。 3．2．6提高從業人員素質生物化工屬高科技產業，從業人員素質尤其重要。我國目前從事生物化工生產的大都是傳統化工行業的從業人員，操作水平還比較低，加強人材培養，以提高生物化工行業人員素質是十分必要的。 3．2．7加強知識產權保護長期以來，我國對生化領域的知識產權保護不夠，挫傷了科研開發人員的積極性，造成大量人才外流。加強知識產權保護，不僅能夠激勵國內科研開發人員，而且能夠吸收一大批在國外發展的科研人員回國發展，從而加快我國生物化工產業的發展。 關于發酵工程的個人觀點 關于發酵工程的個人觀點： 1 該學科前途無量，需要發展：發酵工程作為最早從事微生物學的研究領域，在過去的3個世紀中為人類的生活、生存、社會的發展作出了重大的貢獻。但這些都是過去的成就。發酵工程與現在的生物工程（基因工程）相比，是處于劣勢，因為其是個老學科，在很多人看來，其沒有什么大的學問，通過一些操作過程的控制和菌種的篩選難以達到基因工程那樣迅捷的效果。但目前發酵工程不斷在發展自己，不斷整合其他學科的優點來發展自己：1 上游方面：在菌種選育方面與基因工程相結合，從源頭上來發展自己的優勢。但這一方面存在很大的問題，因為搞基因的人對發酵不很熟悉，使得許多基因工程菌難以發酵生產產品，而且基因工程菌發酵的乙酸問題到現在還沒有解決；另一方面，基因工程領域的專家對發酵工業具有很大應用價值的菌種還沒有做深入研究（我指的是國內情況），國內還沒有哪個基因中心對工業微生物進行基因測序，據我知道，華中農業大學已經在農業微生物方面已經與基因中心在進行農業微生物的測序工作，而工業微生物還沒有第一個吃螃蟹的人，主要是因為工業微生物這個菌種生產上不行了，換個就是了，舍不得花錢。當然哦，測序的費用也很大，需要基因工程進一步提高技術降低測序成本。2工藝方面： 在過程控制中，與微生物學、微生物生理學、計算機工程、控制工程、化工工程等學科相結合，將過程操作變數與微生物生理狀態結合起來。基于微生物反應原理的培養基組成優化；基于微生物代謝特性的分階段培養策略；基于代謝通量分析的發酵優化策略。等等策略的利用，華東理工大學的多尺度控制策略（葉勤教授等）就是將化工領域的策略運用到微生物學領域的典型范例，并取得很大的成就（華北制藥等等）。3 下游方面：也是我個人認為最薄弱、最需要發展的方面。從我所知道的情況，目前我們很多產品都能通過發酵工程發酵生產出來，但我們沒有辦法將其從發酵液中拿出來，這是我們發酵工程最需要解決的問題。為什么會出現這樣的問題呢？因為搞發酵工程的人大多是搞微生物學或者食品方向的，缺乏化學工程的學術背景，而發酵產品提取需要化工背景的人來做，但我們國家化學工程方面的人不屑于做這些事情，一方面是發酵工程方面的人搞不定產品的提取，一方面是化工背景的人不屑于做這樣的事情，才導致我們國家很多發酵產品雖然能發酵出來，但不能提出出來進入市場。 2 該學科在積極拓展自己的領域：最明顯的例子是交叉學科的出現，如發酵工程與環境工程的交叉形成了環境生物技術，與化工交叉的生物化工，與紡織工業交叉的紡織生物工程等的等。