基因簇少則可以是由重復產生的兩個相鄰相關基因所組成,多則可以是幾百個相同基因串聯排列而成。它們屬于同一個祖先的基因擴增產物,也有一些基因家族的成員在染色體上排列并不緊密,中間還含有一些無關序列,但總體是分布在染色體上相對集中的區域。