嬰兒分娩時咽下母親產道的污血或吸入母乳頭部出血，作Apt試驗可鑒別母血與新生兒自身的血。以及口，鼻腔損傷后出血，咽入消化道都可以新生兒嘔血和便血。
新生兒出血癥系維生素K缺乏所致，多在生后2～3天出現嘔血和便血，嚴重時可發生其他部位出血，晚發性維生素K缺乏癥，也可出現嘔血，便血。其他較少見的全身性出血性疾病，如DIC，新生兒血小板減少性紫癜及各種先天性凝血因子缺乏癥等都可引起出。
(1)反流性食管炎：臨床表現為頑固性嘔吐，可有嘔血或便血，常伴有營養不良和生長發育落后。(2)應激性潰瘍：缺氧，顱內高壓，嚴重感染時可引起應激性潰瘍，消化道出血。(3)急性胃腸炎：多數病原引起的急性胃腸道炎癥，除表現為發熱，嘔吐，腹瀉外，嚴重者可出現便血和嘔血。(4)腸梗阻：臨床表現為嘔吐，腹脹，嘔血或便血。(5)乙狀結腸，直腸及肛門疾病：多為息肉，肛門直腸瘺，肛裂引起血便。