來自第二軍醫大學和中國醫學科學院的研究人員,采用深度測序檢測了小鼠骨髓造血干細胞(HSCs)和各種樹突狀細胞(DCs)亞型的miRNA組(miRNomes),并揭示出了免疫反應的一個負調控因子:miR-30b。這些研究結果為深入了解miRNAs在干細胞生物學以及DC亞型發育和功能調控中的作用提供了一個寶貴資源。該研究在線發表在12月6日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。
領導這一研究的是我國著名的免疫學家曹雪濤(Xuetao Cao)院士。其現任職第二軍醫大學、中國醫學科學院和浙江大學醫學院,主要從事腫瘤免疫治療和分子免疫學方面的研究,曾在樹突狀細胞的免疫學和腫瘤的免疫與基因治療研究方面獲得重要成果,以通訊作者的身份在Nature Immunology、Immunity、Blood、J Immunol等國內外知名雜志發表論文200多篇。
DCs作為目前已知功能最強的抗原遞呈細胞,不僅對于啟動先天和適應性免疫反應至關重要,也在對自身組織的免疫耐受中起重要作用。DCs起源于 HSCs,HSCs具有終身自我更新能力,并且可以生成一系列的前體細胞,后者逐漸定向分化為特異的細胞譜系。在大多數情況下,骨髓前體細胞是生成DCs 的主要來源。各種DC亞型生成依賴于免疫微環境刺激,且它們在定位、遷移通路、免疫功能方面均存在差異,從而給免疫反應協調添加了深一層的復雜性。引導 HSCs分化為不同DC亞型的發育信號通路非常的重要,了解這一發育過程中潛在的基因調控機制對于增進我們對細胞分化的了解,以及開發臨床相關的以DC為基礎的免疫治療均具有重要的意義。
MicroRNA(miRNAs)是一類進化保守的非編碼小分子RNAs,它們通過靶向mRNAs導致其降解或翻譯抑制對基因表達進行轉錄后控制,在生物功能中發揮著各種功能作用。研究表明內源表達的miRNAs在包括免疫發育和免疫反應在內許多生理和病例過程中起重要作用。miRNAs通過調節單核/巨噬細胞、DCs、NK細胞、T細胞和B細胞在免疫反應中發揮必不可少的作用,并調控了它們對于病原體以及TLR配體刺激的反應。盡管已有一些研究報道少數miRNAs促成了HSCs和DCs的發育或功能,然而到目前為止對于在DCs發育和分化中起作用的miRNAs仍知之甚少。
對miRNAs進行大規模平行測序(massively parallel signature sequencing, MPSS),是一種深度鑒別miRNome的強有力的方法,可以揭示在特定生物條件下,尤其是在明確的分化或功能階段特異的組織或細胞類型中miRNA的表達差異以及個別miRNA的豐度。除了可以揭示已知miRNAs的表達譜,大量的測序數據還使得探索新型miRNA成為可能。
為了獲得不同發育階段小鼠骨髓源性DCs的miRNAs的綜合定量表達譜,在這項新研究中研究人員利用Illumina平臺的新一代測序檢測了骨髓 HSCs,未成熟DCs、成熟DCs和調節性DCs(DCreg)的miRNomes。由此證實了在DC分化過程中大約有391種miRNAs差異性表達,在不同的階段許多階段特異性miRNAs受到組蛋白修飾的調控。體內外實驗證實在DC分化過程中總共有121種miRNAs具有相同的變化模式。此外,還發現了53個新型候選miRNA。
研究人員發現在Dcreg中通過TGF-beta/Smad3介導的表觀遺傳信號通路miR-30b顯著上調,其通過靶向Notch1促進了IL- 10和NO生成,表明miR-30b是免疫反應的一個負調控因子。研究人員還將體內鑒別的DCs和Dcreg的miRNomes,與體外培養的DCs進行了比較。
新研究為更深入地探究miRNAs在DC發育、分化和功能中的作用提供了一個重要資源。此外,小鼠骨髓HSCs的miRNome也為未來開展干細胞生物學研究提供了一些線索。
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