對X線胸片上發現的問題，MRI可作出定性診斷。
(1) 腫塊：① 可鑒別腫塊性質：如囊性、實質性、脂肪性或血管性(動靜脈畸形)；② 明確腫塊的位置、大小和范圍，并能明確腫塊與縱隔的解剖關系。
(2) 縱隔增寬：① 可確定縱隔增寬是病理性或是解剖變異；② 可鑒別縱隔增寬是實質性、囊性和血管異常、動脈瘤或是脂肪組織的腫塊；③ 可觀察食管癌向管外侵犯的范圍；④ 可確診對纖維化或肉芽腫性縱隔炎診斷；⑤ 確定腫瘤對縱隔的侵犯范圍。
(3) 肺門增大：明確肺門增大的原因是肺血管疾病抑或實質性腫塊(包括腫大的淋巴結)，MRI優于CT良好的對比解析度，故可檢出直徑1cm的腫塊，而且MRI比CT更容易鑒別腫塊與血管。
(4) 明確腫瘤對胸膜、胸壁的侵犯范圍，對腫瘤的分期和制定治療方案十分重要。
(5) MRI能顯示診斷心肌梗死、心肌病、瓣膜病、心包病變、先天性心臟病以及心臟腫瘤等。
(6) 檢查心臟大血管病變首選MRI，這是因為：① 由于血流低信號或無信號，故在心臟內血液和心臟結構之間形成良好的對比；② 由于MRI的對比解析度高，故能清晰地分辨出心肌、心內膜、心包和心包外脂肪；③ 若用心電門控，可動態觀察心動周期心肌活動狀態；④ 無創傷、無需造影劑，即可顯示心房、心室和大血管腔，檢查十分安全；⑤無需改變患者體位，即可獲得任意的斷層圖像；⑥快速成像序列已能對心臟、大血管的運動狀態進行觀察，對心臟功能作出定量分析；若輔以超聲心動圖，則可使大多數復雜的心血管疾病確診。