1、中毒型菌痢的抗菌治療： 首選黃連素聯合諾氟沙星，或氧氟沙星，或環丙沙星。口服，療程3～5d。
(1) 黃連素：成人每次0.5g，2/d。小兒30mg/(kg·d)。
(2) 諾氟沙星：成人每次0.4g，2/d。小兒15～20mg/(kg·d)。
(3) 氧氟沙星：成人每次0.3g，2/d。小兒10～20mg/(kg·d)。
(4) 環丙沙星：成人每次0.4g，2/d。小兒10～20mg/(kg·d)。
(5) 重癥及6月齡以下嬰兒可選用下列藥物：①頭孢氨噻肟，成人每次1g，1/12h，肌注；兒童50～100mg/(kg·d)。②頭孢去甲噻肟及頭孢曲松，劑量同①。③對青霉素過敏者，可選用阿米卡星，成人每次80mg，1/12h，肌注。小兒2～5mg/(kg·d)。妥布霉素，成人每次80mg(8萬U)，每8～12h一次，小兒4mg/(kg·d)，分2次肌注或靜滴。
(6) 其他：尚可選用磷霉素、口服慶大霉素、SMZ-TMP等。
2、山莨菪堿 預防劑量為0.5～lmg/kg，一次靜注。治療劑量為成人40～60mg/次，小兒每次l～5mg/kg，3～15min 1次，靜注。待面色好轉、四肢暖、呼吸循環衰竭糾正即可停藥。及時和短程足量是治療成功與否的關鍵。藥量必需高度個體化。
3、中毒型菌痢的液體療法：
(1) 控制液體量：對于腦型、肺型，控制液體入量為生理需要量之80%，使患者處于輕度脫水狀態。
(2) 擴容：對于休克型毒痢，足量擴容為搶救的關鍵措施。原則是先晶體液后膠體液，晶膠比例為3∶1。常用晶體液為醋酸鈉平衡鹽，或2∶1液(2份生理鹽水、1份1.4%碳酸氫鈉)；膠體液為低分子右旋糖酐，低右之用量為成人每次500ml，小兒10～15ml/kg，快速靜滴或靜注。所需液體總量隨病情輕重及個體全身臟器功能不同而有很大差異。通常初速5ml/min或更多，小兒減半，待血壓升至正常及有尿后減速。初期快速擴容，所需液體總量少，效果好。成人患者不伴脫水之毒痢所需液體量大致為：第1h，2∶1液500～1000ml，低右500ml，總量1000～1500ml，最初12h為2000～2500ml，24h為2500～3500ml。小兒酌減。
(3) 脫水：靜注甘露醇，用于腦型毒痢。
(4) 糾正酸中毒：采用等滲碳酸氫鈉溶液糾酸。
(5) 糾正電解質及糖代謝紊亂：注意補鉀。重癥可出現高血糖，合并嚴重酸中毒與低血鉀，應及時糾正之。
4、中毒型菌痢的亞冬眠療法： 適用于腦型。
5、改善肺換氣功能 對于肺型，采用呼吸道持續正壓給氧(CPAP)，或呼氣末正壓給氧(PEEP)，或高頻通氣(HFOV)。積極糾正低氧血癥。
6、激素 靜滴地塞米松，或氫化可的松，或甲基強的松龍。
7、其他 積極降溫。必要時用鎮靜劑、強心藥。中藥生脈散、參附湯有助于休克之恢復。出現DIC時，可考慮肝素治療。