免疫性腎炎還缺少特效療法，因此強調綜合治療。治療的目的在于保護腎功能，使病人在長期慢性的過程中延緩出現腎功能衰竭。
一、一般性治療
有水腫、高血壓或腎功能不全者,應注意適當休息,避免劇烈活動。若不存在失鹽性腎炎,飲食中鹽的攝入量應加以限制，強調給予高熱量。蛋白質的攝入量根據腎功能的情況調整。有腎功能不全時，采用低蛋白飲食，要求蛋白質量少而精，即食用富含必需氨基酸的優質
蛋白質(如雞蛋白、牛奶、瘦肉等)；若腎功能正常而尿蛋白量較多，則應增加蛋白質的攝入量。免疫性腎炎病人抵抗力低,容易發生繼發感染,如感冒、病毒感染等，導致病情波動，甚至誘發急性發作，應注意防范。應盡量避免應用有腎毒性的藥物。
二、對癥治療
利尿消腫可應用各種利尿劑，如雙氫克尿塞、速尿、丁脲胺、安體舒通、氨苯喋啶等。若水腫嚴重，血漿蛋白甚低，常規利尿藥效果不佳時，可適當輸入血漿或白蛋白、右旋糖酐，通過增加血漿膠體滲透壓，提高血容量，加強利尿，中藥也有較好的利尿效果。
三、高血壓的并存
可加劇免疫性腎炎的病情，因此適當有效的控制血壓，對減緩病情有重要意義。降壓藥的使用與原發性高血壓的用藥基本相同，區別在于有腎功能不全時對腎血流量有影響的降壓藥如交感神經阻滯劑等不宜使用。血管緊張素轉換酶抑制劑如巰甲丙脯酸及鈣拮抗劑如心痛定可作為首選藥物。
四、鑒于免疫性腎炎是一種免疫反應性疾病
根據其發病機理可采用下列治療方法：腎上腺皮質激素；細胞毒類藥物；雷公藤多甙或總萜片；抑制血小板凝聚藥如潘生丁；抗凝劑如肝素、華法令；血漿置換療法。這些療法的效果在很大程度上取決于組織病理學改變。由于激素及免疫抑制劑都可能帶來嚴重的副作用，因此在治療中力求有病理學診斷，以減少盲目用藥所帶來的藥物副作用。已發生腎功能不全和有嚴重高血壓者，通常不宜用激素或細胞毒藥物。
五、免疫性腎炎是自身免疫性疾病，如果人體內這些免疫反應被抑制，便可避免抗原抗體復合物的形成及其在腎臟內的沉積，從而切斷了免疫反應引起的炎癥反應。上述藥物主要作用是抑制細胞內脫氧核糖核酸(DNA)、核糖核酸(RNA)以及蛋白質的生物合成，干擾它們的功能，所以這些藥物都是細胞毒藥物。簡單介紹如下：
1、環磷酰胺：常用方法為成人50毫克，每日2～3次；或200毫克稀釋后，每日或隔日靜脈注射；總量為6～12克，療程2～3個月。近年來主張用沖擊療法，即大劑量(400～800毫克)靜脈注射，每周或隔周或隔月一次。治療期間，應多飲水或靜脈補液，保持尿量在2000毫升以上，預防出血性膀胱炎。本藥不宜單獨使用，常須與激素聯合治療腎炎。但因該藥有抑制精子發育的副作用，于停藥后還會持續5年以上，放青年末育男性盡量不用此藥。
2、氮芥：因為其副作用較大，而且只能靜脈給藥，不如口服方便，所以應用不夠廣泛。在靜脈給藥時，要嚴格防止漏出到皮下，以免造成局部組織壞死。每日劑量為1～3毫克，總劑量為每千克體重1～2毫克。
3、苯丁酸氮芥 ；可以口服，易被胃腸道吸收，但作用較慢，副作用比環磷酰胺小，亦可與激素合用。常用劑量為每日每千克體重0.1～0.2毫克，總療程6～8周。
4、硫唑瞟吟：每日劑量為100～500毫克，口服，2～4周見效后改為維持量，減到25～50毫克。臨床較常用。