法莫替丁的劑量因不同情況而異。以成人為例，口服的常規劑量為每次20mg，一日2次，早餐后、晚餐后或臨睡前服用，療程一般為4到6周。潰瘍愈合后維持量減半，睡前服用。對于腎功能不全的患者，應調整劑量。
對于兒童，用法用量如下：
胃食管反流病：口服，一日0.6～0.8mg/kg（一日最大劑量40mg），每12小時一次或睡前一次，療程4～8周。
消化性潰瘍：口服，一日0.9mg/kg（一日最大劑量40mg），睡前一次服用，療程2～4周。
靜脈滴注：一次不能超過20mg，應將本品溶解于5%葡萄糖溶液250ml中，滴注時間不少于30分鐘，每12小時一次。
在使用法莫替丁時，請注意：
腎衰竭或肝病患者、有藥物過敏史的患者應慎用；
妊娠期婦女慎用，哺乳期婦女使用時應停止哺乳；
對小兒的安全性尚未確立；
應在排除腫瘤和食管、胃底靜脈曲張后再給藥。