溶酶體與腫瘤的關系日益引起人們的關注，一般有以下幾種觀點：
(1)致癌物質引起細胞分裂調節機能的障阻及染色體畸變，可能與溶酶體釋放水解酶的作用有關；
(2)某些影響溶酶體膜通透性的物質，如巴豆油，某些去垢劑、高壓氧等，是促進致癌作用的輔助因子，也能引發細胞的異常分裂；
(3)在核膜殘缺的情況下，核膜對核的保護喪失，溶酶體可以溶解染色質，而引起細胞突變；
(4)溶酶體代謝過程中的某些產物是腫瘤細胞增殖的物質基礎；
(5)致癌物質進入細胞，在與染色體整合之前，總是先貯存在溶酶體中，這已為放射自顯影所證實。
總之，溶酶體與腫瘤發生是否有直接關系，尚待進一步探索 。