自從20多年前科學家首次讀取果蠅的遺傳密碼草圖以來,基因組學領域開始在理解生物學基本問題方面取得重大飛躍。
現在,來自50家機構的150多名研究人員在最新一期《科學》雜志特刊上發表了11篇不同的論文,帶來了“人畜共患病項目”的新見解。
這11篇論文,是人類利用新遺傳數據開展研究的一個范本,它們展示了此類大型聯盟和基礎數據集的真正重要性。
此次有兩篇論文展示了在單個物種(例如瀕臨滅絕物種)甚至個體DNA的基因組中,科學家能發掘到的最大價值。其中一個研究對象——雪橇犬巴爾托更是廣為人知,它在書籍影視作品中已成為不朽形象:巴爾托在1925年的冬天穿越了阿拉斯加荒野,正是這次史詩般的旅程,將拯救人類生命的白喉血清成功帶到了阿拉斯加的諾姆。
僅用一只雪橇犬,完成一個大項目
巴爾托項目的起源實際上可追溯至幾年前。美國康奈爾大學動物遺傳學家希瑟·休森在一次會議上發表演講時,聽眾想知道是否有可能從保存下來的獸皮中提取和分析DNA,他們想到一個潛在的研究對象——巴爾托,它的標本陳列在克利夫蘭自然歷史博物館中。
休森在貝絲·夏皮羅——一位曾經揭示乳齒象等已滅絕生物遺傳秘密的先驅的幫助下,成功拿到了巴爾托皮膚樣本并提取了DNA,隨后通過復雜的遺傳分析“閱讀”了巴爾托的DNA片段代碼,次數足以覆蓋它的整個基因組40次。
通常,科學家要通過分析不同個體之間的遺傳變異,才能真正了解一個物種的遺傳秘密。但巴爾托只是單一個體,因此這次的挑戰就在于:如何僅用一只狗就完成一個基因項目。
研究團隊有一張王牌:除了能將雪橇犬的基因組與“人畜共患病項目”中的240種哺乳動物進行比較外,他們還可利用到一個基因庫,該庫擁有來自各品種的682只狗的完整基因組。
巴爾托項目成為一個將這兩個數據集結合在一起的機會。
基因學描繪出更真實的肖像
使用巴爾托基因中的信息,馬薩諸塞大學醫學院卡爾森實驗室科學家重建了它的精確外貌,基因預測出這只狗的精準身高,判斷出它的黑色皮毛邊緣有棕褐色斑點的事實,而這些細節不會出現在以往圖片中。
這只狗狗離世將近100年了,現在,它證實了科學家可使用基因組學,準確描繪那些已長期滅絕且沒有圖片的物種的真實面貌。
巴爾托的DNA中還有許多待挖掘的科學寶藏。這只狗于1919年出生,是從西伯利亞進口的犬種的后代,與一些現代純品種相比,它的有害基因更少,其組織發育基因顯示了肌肉、新陳代謝和耗氧方面的特點,這些促成了它在惡劣環境中的適應性。
同時,遺傳學分析也能揭示巴爾托的局限性。它韌性十足,有很強的耐力,但無法跑得很快。
巴爾托和多哥共譜傳奇
諾姆這座小鎮位于北極圈以南約2度的位置。上世紀20年代雖然已有飛機和火車,但能覆蓋的地方比較有限,在當地,很多物資都要靠雪橇隊運送。
1925年1月24日,諾姆小鎮的兒童遭遇流行病白喉的襲擊。當時已有5名兒童因病去世,還有20多名染病兒童處于生死一線。拯救孩子們的希望就是血清,但諾姆沒有,最近的血清位于1000多公里外。雪上加霜的是,一場巨大的暴風雪讓飛機和火車都派不上用場。
20名雪橇手和150只雪橇犬組成了20支隊伍,決定用接力的方式傳遞血清。血清保質期只有6天,這場接力不但緊急且面臨各種天災磨難,但最終,他們拯救了孩子們的生命,一場白喉大暴發被扼殺在了搖籃里。
事實上,雪橇犬專家們也知道,巴爾托并不是這次偉大“救生之旅”的唯一英雄。
這一榮譽還應屬于一只名叫“多哥”的犬,是它帶領著隊伍完成了全程1085公里長途跋涉中最長的一段接力——驚人的425公里,而巴爾托在風雪中人類無法辨別方向的情況下,帶領著隊伍跑完了最后一段的85公里。
因此研究人員建議,接下來應從諾姆保存的多哥遺骸中獲取樣本,為這部犬類遺傳大劇的下一章節揭幕。
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