分離純化、壙增、獲取其中的蛋白質或DNA、RNA并用熒光標記, 才能與芯片進行反應。用DNA芯片做表達譜研究時,通常是將樣品先抽提MRNA,然后反轉錄成CDNA。同時摻入帶熒光標記的dCTP或dUTP。