電噴霧（四極桿）質譜儀（ESI-MS）
基質輔助激光解吸電離飛行時間質譜儀（MALDI-TOF-MS）。
離子阱（ion trap,IT）質譜和傅里葉變換離子回旋共振（Fourier transform ion cyclotron resonance,FTICR）質譜
液相色譜-電噴霧-四極桿飛行時間串聯質譜儀（LC-ESI-MS-MS）
串聯質譜功能的MALDI-TOF質譜儀
