(1)消化系統：在系統損害中消化道癥狀最多見，表現為腹脹、食欲降低、消化與吸收不良、便秘或腹瀉。近1/3的患者有吞咽困難，主要是吞咽固體食物困難；在平臥位時行食管鋇餐造影，2/3的患者可發現異常，如食管擴張、蠕動差、造影劑通過緩慢和梨狀窩鋇劑滯留。JDM還可因血管炎而引起腸壞死，發生胃腸潰瘍和出血。肝功能異常在疾病活動時多見。個別患者可有膽囊硬化、膽汁淤積性肝炎，此時可檢測到抗線粒體抗體。
(2)呼吸系統：常見的肺部病變是：間質性肺炎(ILD)，發生率＞40%；肺泡炎(＞30%)和支氣管肺炎引起的通氣障礙(20%左右)。多呈緩慢發展，可有不同程度的呼吸困難，易繼發感染。據國外統計，以上3種肺部病變在DM/PM的發生率為40%，死亡率為27%；并認為血清中高水平的谷草轉氨酶(AST)和鐵蛋白、抗Jo-1抗體陽性和特征性的微血管病變有助于判斷肺部病變和估計預后。以上肺部病變的非創傷性的早期檢查可憑借高分辨率CT(HRCT)和肺功能檢查，比X線攝片更能發現無癥狀的肺纖維化患者。肺功能檢查中以一氧化碳彌散功能(DLCO)檢查最為敏感，可檢出影像學尚無改變的早期患者，尤其是肺泡炎，HRCT亦無法檢出。
少數患者的肺間質病變以急性型出現，可發生于任何階段，表現為急性發熱、呼吸困難、發紺、干咳，而肌無力癥狀可不明顯，較快出現呼吸衰竭，預后差。此類患者血清中磷酸肌酸(CK)往往為正常水平，而AST明顯升高，CK與AST比值降低；外周血白細胞減少，淋巴細胞絕對計數低；支氣管灌洗液中淋巴細胞顯著增多；咽喉肌受累的患者還可發生吸入性肺炎；胸膜炎有時也可發生；個別還可出現氣胸、縱隔積氣甚至廣泛的皮下氣腫。
(3)心臟：心臟病變較多，約50%可發現異常，但大多較輕微，僅心電圖示ST-T改變。其他還有心律失常及不同程度的傳導阻滯，二尖瓣脫垂也較多見。極少數患者因心肌病變而出現心力衰竭、嚴重的心律失常，此時則預后較差，此類患者多合并有系統性硬皮病。多數患者對皮質類固醇治療敏感，心電圖異常可隨肌肉/皮膚癥狀好轉而恢復。
(4)腎臟：腎臟病變輕而少見(合并其他CTD者除外)，可有少量蛋白尿、管型尿及血尿。