麥膠性腸病患者血中可檢出抗麩質抗體，與抗肌內膜自身抗體(IgA-EmA)相比，抗麩質抗體檢測的敏感性明顯提高(100%)，但特異性卻較低，僅為60%左右。此外，抗麩質抗體的滴度隨著飲食中麩質的存在或去除而變化，且其變化速度遠較抗肌內膜自身抗體為迅速。
慢性肝病患者常有抗肌內膜自身抗體和(或)抗麩質抗體陽性。自身免疫性肝炎患者可并發乳糜瀉，而且常因缺乏典型的臨床表現而被漏診。慢性肝病患者血清抗麩質抗體陽性率明顯高于普通人群。血清抗麩質抗體陽性率分別為酒精性肝病20%、慢性肝炎19%、丙型肝炎病毒感染者11%，均明顯高于正常人，有關機制及潛在的意義有待于進一步研究。