大腸菌群并非細菌學分類命名，而是衛生細菌領域的用語，它不代表某一個或某一屬細菌，而指的是具有某些特性的一組與糞便污染有關的細菌，需氧及兼性厭氧、在37℃能分解乳糖產酸產氣的革蘭氏陰性無芽胞桿菌。
腸埃希氏菌(E. coli)通常稱為大腸桿菌，根據不同的生物學特性將致病性大腸桿菌分為5類：致病性大腸桿菌(EPEC)、腸產毒性大腸桿菌(ETEC)、腸侵襲性大腸桿菌(EIEC)、腸性大腸桿菌(EHEC)、腸黏附性大腸桿菌(EAEC)。
糞大腸菌群是大腸菌群的一種，又名耐熱大腸菌群，糞大腸菌群是生長于人和溫血動物腸道中的一組腸道細菌,隨糞便排出體外,約占糞便干重的1/3以上,故稱為糞大腸菌群。