熒光顯微鏡的調整主要是在光源的調整，目前熒光顯微鏡光源主要分為汞燈光源和LED燈光源，LED燈光源出廠時都會校正好，而且使用壽命長，很少需要自己更換。而汞燈使用壽命大概在100-200小時，使用過程中會經常遇到更換燈泡的問題，燈泡更換完成后需要調整中心位置，那如何調整呢？怎么可以保證光源在光路的中間位置呢？
調整方法如下：
1. 請準備一張白紙（約40mmX50mm），將小白紙置于載物臺上。
2. 取出其中一個物鏡，將轉換器無物鏡的安裝孔位轉入光路中。此時可以在白紙上呈現一個明亮的光斑，內部有呈蝴蝶結狀的燈絲像。
3. 如果燈絲像不清晰，可以調節落射器集光鏡調節手柄1，使燈絲像清晰。
4. 如果蝴蝶結狀的燈絲像偏離明亮光斑的中心或傾斜，則需要調節汞燈的中心。可以通過調節手輪2與3調節汞燈的中心，手輪2用于左右調節，手輪3用于上下調節。
5. 重新安裝物鏡并轉動轉換器，將物鏡轉入光路中,就可以利用本儀器進行熒光顯微觀察。
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