SPE柱的使用最為普遍，簡單的SPE柱就是一根直徑為數毫米的小玻璃柱，或用聚丙烯、聚乙烯、聚四氟乙烯等塑料或不銹鋼制成的柱子。柱下端有一孔徑為20μm的燒結篩板，用以支撐吸附劑。在篩板上填裝一定量的吸附劑，然后在吸附劑上再加一塊篩板，以防止加樣品時破壞柱床。基于對純度的考慮，一般選用無添加劑且含有微量雜質的醫用聚丙烯作為柱體材料，以免在萃取過程中污染試樣。為了降低SPE空白中的雜質，可選用玻璃、純聚四氟乙烯作為柱體材料。篩板材料是另一可能的雜質來源，制作篩板的材料有聚丙烯、純聚四氟乙烯、不銹鋼和鈦等。金屬篩板不含有機雜質，但易受酸的腐蝕。由于柱體、篩板和填料都可能向試樣中引進雜質，因此在建立和驗證SPE方法時，必須做空白萃取實驗。
SPE的另一種形式是SPE盤，外觀上與膜過濾器十分相似。盤式萃取器是含有填料的純聚四氟乙烯圓片，或載有填料的玻璃纖維片。填料占SPE盤總量的60％～90％，盤的厚度約1mm。SPE柱和盤式萃取器的主要區別在于床厚度與直徑之比，對于等重的填料，盤式萃取的截面積比柱式萃取大10倍左右，因而允許液體樣品以較高的流量流過。