基因重組—層析法
| 實驗方法原理 |
攜帶有目標蛋白基因的質粒在大腸桿菌BL21中,在 37℃,IPTG誘導下,超量表達攜帶有6個連續組氨酸殘基的重組氯霉素酰基轉移酶蛋白,該蛋白可用一種通過共價偶連的次氨基三乙酸(NTA)使鎳離子(Ni2+)固相化的層析介質加以提純,實為金屬熬合親和層析(MCAC)。蛋白質的純化程度可通過聚丙烯酰胺凝膠電泳進行分析。 |
|---|---|
| 實驗材料 | 大腸桿菌BL21 |
| 試劑、試劑盒 | LB液體培養基 氨芐青霉素 Washing Buffer Elution Buffer IPTG 蒸餾水 胰蛋白胨 酵母粉 氯化鈉 |
| 儀器、耗材 | 搖床 離心機 層析柱 離心管 移液槍 槍頭盒 燒杯 玻璃棒 |
| 實驗步驟 |
一、試劑準備 1. LB液體培養基:Trytone 10 g, yeast extract 5 g,NaCl 10 g,用蒸餾水配至1000 mL。 2. 氨芐青霉素:100 mg/mL。 3. 上樣緩沖液:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8M Urea,10 mM 2-ME,pH8.0。 4. Washing Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mM Tris,8 M Urea,pH6.3。 5. Elution Buffer:100 mM NaH2PO4,10 mMTris,8M Urea, 500 mM Imidazole, pH8.0。 6. IPTG:100mM IPTG(異丙基硫代-β-D-半乳糖苷):2.38g IPTG溶于100ml ddH2O中,0.22 um濾膜抽濾,-20℃保存。 二、獲得目的基因
1. 通過PCR方法:以含目的基因的克隆質粒為模板,按基因序列設計一對引物(在上游和下游引物分別引入不同的酶切位點),PCR循環獲得所需基因片段。
2. 通過RT-PCR方法:用TRIzol法從細胞或組織中提取總RNA,以mRNA為模板,逆轉錄形成cDNA第一鏈,以逆轉錄產物為模板進行PCR循環獲得產物。
三、構建重組表達載體
1. 載體酶切:將表達質粒用限制性內切酶(同引物的酶切位點)進行雙酶切,酶切產物行瓊脂糖電泳后,用膠回收Kit或凍融法回收載體大片段。
2. PCR產物雙酶切后回收,在T4DNA連接酶作用下連接入載體。
四、獲得含重組表達質粒的表達菌種
1. 將連接產物轉化大腸桿菌DH5α,根據重組載體的標志(抗Amp或藍白斑)作篩選,挑取單斑,堿裂解法小量抽提質粒,雙酶切初步鑒定。
2. 測序驗證目的基因的插入方向及閱讀框架均正確,進入下步操作。否則應篩選更多克隆,重復亞克隆或亞克隆至不同酶切位點。
3. 以此重組質粒DNA轉化表達宿主菌的感受態細胞。 五、氯霉素酰基轉移酶重組蛋白的誘導 1. 接種含有重組氯霉素酰基轉移酶蛋白的大腸桿菌BL21菌株于5 mL LB液體培養基中(含100 ug/mL 氨芐青霉素),37℃震蕩培養過夜。 2. 按1∶50或1:100的比例稀釋過夜菌,一般轉接1 mL過夜培養物于100 mL(含100 ug/mL 氨芐青霉素)LB液體培養基中,37℃震蕩培養至OD600 = 0.6 - 0.8(最好0.6,大約需3 h)。取10 ul 樣品用于SDS-PAGE 分析。 3. 對照組不加誘導劑,實驗組加入IPTG至終濃度0.5 mmol/l,37℃繼續培養1-3h。 4. 12 000 rpm 離心10 min,棄上清,菌體沉淀保存于-20℃或-70℃冰箱中。 六、氯霉素酰基轉移酶重組蛋白的分離、純化 1. NTA層析柱的準備:在層析柱中加入1 mL NTA介質,并分別用8 mL 去離子水,8 mL上樣緩沖液洗滌。
2. 重組蛋白的變性裂解:在冰浴中凍融菌體沉淀,加入5 mL上樣緩沖液, 用吸管抽吸重懸,超聲波破裂菌體,用振蕩器等輕柔的混勻樣品60
min,4℃ 12000 rpm 離心 30 min,將上清吸至一個干凈的容器中,并棄沉淀。取10 ul 上清樣品用于SDS-PAGE 分析。 3. 上清樣品以10-15 mL/h 流速上Ni2+-NTA柱,收集流出液,取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。 4. 洗脫雜蛋白:用Washing Buffer以10-15 mL/h流速洗柱,直至OD280 = 0.01分步收集洗脫液,約3-4 h,取10 ul洗脫開始時的樣品用于SDS-PAGE 分析。 5. 洗脫目標蛋白:用Elution Buffer洗柱,收集每1 mL 級分,分別取10 ul樣品用于SDS-PAGE 分析。
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| 注意事項 |
1. 選擇表達載體時,要根據所表達蛋白的最終應用考慮。如為方便純化,可選擇融合表達;如為獲得天然蛋白,可選擇非融合表達。
2. 融合表達時在選擇外源DNA同載體分子連接反應時,對轉錄和轉譯過程中密碼結構的閱讀不能發生干擾。
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| 其他 |
一、原核表達
(1)易于生長和控制;
3. 原核表達載體
(1)選擇標志的編碼序列;
(2)可控轉錄的啟動子;
(3)轉錄調控序列(轉錄終止子,核糖體結合位點);
(4)一個多限制酶切位點接頭;
(5)宿主體內自主復制的序列。
4. 原核表達一般程序
獲得目的基因-準備表達載體-將目的基因插入表達載體中(測序驗證)-轉化表達宿主菌-誘導靶蛋白的表達-表達蛋白的分析-擴增、純化、進一步檢測
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