超聲提取主要是運用了超聲波的原理，由于超聲波自身所具有的性質空化作用，機械效應及熱效應，由于自身的這幾個特點決定了它對中藥提取的得天獨厚的優勢，它利用自己的空化效應和機械效應能迅速作用于中藥材植物細胞的細胞壁，使得纖維素分子和果膠分子發生分離，細胞壁的架構發生破壞，細胞內容物比如多糖類、黃酮類、生物堿類、淀粉等生物大分子就能沖破細胞壁這個屏障，溶出到提取溶劑中，在經過離心、過濾排除掉一些大分子雜志物質，通過大孔樹脂吸附、離心、醇沉等方法分離得到我們想要的物質。總體來說最大的優點就是收率比傳統方式有大幅提高，能耗少，提取時間短，經濟效益高等優點。
而熱回流提取是在索式提取的基礎上演變而來，在中藥提取的過程中起著很大的作用，在有機溶劑提取比如酒精做為提取溶劑的時候具有一些優勢，酒精沸點低，在提取罐煮沸后，酒精蒸發，遇冷后再回流到提取罐內，能重復利用，但是自身還是有一些不可忽視的缺點，煮沸時間長，能后高，對一些熱敏物質有所破壞，還有一個是提取時間長，人工多，效率低下。
綜合上述特點對比，超聲提取及熱回流提取各有千秋，但是選擇一款適合自己提取工藝的設備這個才是最重要的。