日前,長牡蠣和櫛孔扇貝全基因組框架圖繪制完成,并篩查得到與重要性狀相關的基因或信號通路,在國際上填補了冠輪動物基因組學研究空白。
這是在國家863計劃支持下,由中國海洋大學、中國科學院海洋研究所、中國水產科學研究院黃海水產研究所、中國科學院南海海洋研究所、威海長青海洋科技股份有限公司、大連獐子島漁業集團股份有限公司完成的“基于全基因組信息的貝類遺傳選育”課題的重要成果。
長牡蠣基因組圖譜發表于生物學權威期刊《Nature》上。課題組在全基因組規模系統篩查了動物基因組中常見的一種分子標記——單核苷酸多態性,對重要基因多態性進行了深入研究。
該課題組還研發了一種新型高通量、低成本的全基因組基因分型技術——2bRAD,突破了依賴已知基因組信息和昂貴芯片技術的瓶頸,為非模式生物全基因組范圍內解析遺傳變異與性狀關系提供了核心技術手段,開發了無參照基因組的精準分型新算法和軟件,與國際日前主流算法相比,準確率提高20%以上。
這些技術方法突破使大規模開發水生生物分子標記、開展全基因組選擇育種成為可能,標志著我國的分子育種方法學研究已躍居國際前沿。
課題組完成了櫛孔扇貝和長牡蠣的高密度遺傳圖譜構建,精細定位了經濟性狀相關的重要候選基因。其中,櫛孔扇貝圖譜標為目前已知水產生物上精度最高的圖譜。建立了國際上首個貝類全基因組選擇育種分析評估系統,研發了全基因組基因型效應評估算法,提高了貝類全基因組選育的效率和水平。
該課題組成功培育了兩個國家審定的貝類新品種。其中,“蓬萊紅2號”兩齡貝較普通生產用種增產53.5%,是國內外第一個采用全基因組選擇育種技術育成的良種,在山東推廣創收達4700余萬元;“海大1號”15月齡平均殼高較普通商品苗種養殖提高16.2%,總濕重提高24.6%,出肉率提高18.7%,在山東、遼寧等地中試,平均畝增產24.6%,課題執行期內新增產值1700多萬元。
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