1、搞好環境衛生，加強廁所及糞便管理，消滅蒼蠅孳生地，發動群眾消滅蒼蠅。
2、加強飲食衛生及水源管理，尤其對個體及飲食攤販做好衛生監督檢查工作。
3、對集體單位及托幼機構的炊事員、保育員應定期檢查大便，做細菌培養。
4、加強衛生教育，人人做到飯前便后洗手，不引生水，不吃變質和腐爛食物，不吃被蒼蠅沾過的食物。
5、不要暴飲暴食，以免胃腸道抵抗力降低。
6、做好消毒隔離工作，食具要煮沸15分鐘消毒，病人的糞便要用1%漂白粉液浸泡后再到入下水道。
7、保護易感人群，近年來使用志賀菌依鏈株減毒活菌苗口服，可產生IgA，以防止痢菌菌毛貼附于腸上皮細胞，從而防止其侵襲和腸毒素的致瀉作用。
也有學者采用X線照射及氯霉素或亞硝胍誘變等不同方式獲得減毒變異株，用于主動免疫，已獲初步效果。但總的來說，由于痢疾桿菌的亞型比較多，因此，制成特異性的疫苗難度較大。另外，病愈后機體產生的特異性免疫持續時間也不長，因此，最重要的預防措施還是切斷傳播途徑。