由于過敏性鼻咽炎屬于免疫系統疾病，因此，在治療的過程當中不可簡單的等同于普通病菌感染類型的咽炎，美國CBH專家認為，增強機體細胞免疫力，改善過敏體質，是防治過敏性咽炎的核心環節，然而，還是有許多過敏性咽炎患者因為始發時以為是著涼或小感冒，沒有引起足夠重視，從而延誤了治療時機，還有部分患者反復上醫院治療，可能因為診斷失誤，沒有及時針對過敏癥狀進行施治，用藥的過程當中常常與普通的支氣管炎、肺炎等一并對待，這也難怪許多過敏性咽炎患者總是遷延不愈。
雖然說引起過敏性咽炎的最重要因素的當屬免疫系統較差，但是生活當中還有許許多多外部因素會直接加重過敏性咽炎。比如說天氣突然變寒冷、飲用刺激性飲品、大量食用海鮮、嗜好抽煙喝酒、情緒長期低落、生活工作過度緊張勞累等等都會直接影響到咽炎的發作程度，因此，對于過敏性咽炎患者，采取積極有效的防治措施增強細胞免疫力、盡快脫敏是必不可少的關鍵環節，其次就是針對咽炎的某些癥狀進行對癥治療，比如說針對咽喉紅腫、發癢等炎癥癥狀，脫敏的同時消除炎癥、排除體內毒素等步驟也能夠盡快緩解過敏性咽炎感官上的痛苦。