| 實驗步驟 | 1. 準備下列溶液：
TBE 緩沖液：Tris 堿 54 g，硼酸 27.5 g，0.5 mol/L EDTA ( pH 8.0) 20 ml，溶解并加水至 1000 ml。當發現貯存液有白色沉淀時應予拋棄。
丙烯酰銨溶液：丙烯酰胺 77.3 g，N,N'-亞甲雙丙烯酰胺 27 g，尿素 420 g，5xTSE 200 ml，加水至 1000 ml 充分攪拌溶解固體成分，用 Whatman 3MM 濾紙或微孔濾器過濾。該溶液在棕色瓶中可穩定保存幾個月。
10% 過硫酸銨水溶液：TEMED (可從 Sigma 購得）
2X RNA 染色液（10ml)：二甲苯腈藍 10 mg，溴酚藍 10 mg，EDTA (二鈉鹽） 35 mg，甲酰胺 6 ml，5xTBE 4 ml。
2. 分別取一塊平整的和一塊有凹口的玻璃板，在它們中間放一條 0.5 mm 厚的分隔條并將它們夾緊。用黏膠帶封住底部。
3. 往 10 ml 8% 丙烯酰胺溶液中加 100 μl 過硫酸銨及 10 μl TEMED，混勻，倒入兩塊玻璃板之間至 3 cm 高，讓丙烯酰胺溶液聚合。
4. 往 50 ml 8% 丙烯酰胺溶液中加 500 μl 過硫酸銨及 50 μl TEMED，混勻，倒入兩塊玻璃板之間，確保不要留有氣泡。
5. 往凝膠中插入合適的梳子，使之聚合。
6. 凝膠聚合后，將之插入配套的凝膠電泳裝置，加 1xTBE，于 200 V 電泳 3 小時，以去除未聚合的丙烯酰胺與過剩的催化劑。
7. 用 TE 溶解 RNA，取 5~10 μl RNA 溶液與等量染色液混合。
8. 于 65℃ 加熱 RNA 樣品 2 分鐘，輕微離心以沉淀不溶物質。
9. 將可溶的 RNA 樣品與染料標記物加入凝膠電泳孔。
10. 先用低壓（100V) 開始電泳，一旦藍色與綠色染料分開后，將電壓升至 500~700 V。
RNA帶負電，向陽極遷移。
11. 于 50℃ 電泳約 3 小時直至綠色染料跑到凝膠底部。
12. 電泳結束后，用刮刀撬起一塊玻璃板，拿開，讓凝膠留在第二塊玻璃板上。
13. 用吸水紙擦去殘留液體，用一塊塑料薄膜將整個凝膠蓋住。
確保凝膠于與塑料薄膜之間沒有氣泡。
14. 貼上兩張黏的帶有放射件墨水的斑點標簽，以便下一步安放凝膠與 X 射線片。
15. 在暗室里將 X 射線片放到凝膠上面，在 X 射線片上再依次放一張增感屏與一塊玻璃板，最后用鋁箔將整個裝置包起來。
16. 如果 RNA 不用作進一步分析，則將凝膠轉移到一張 Whatman 3MM 濾紙上，用商用凝膠干燥器抽干。
17. 于室溫、4℃ 或 -70℃ 曝光一段合適的時間，然后顯影。 展開 |
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