開啟2020年科研新熱點的染色體外環狀DNA（eccDNA）
近期，Nature與Cell相繼發表文章討論染色體外環狀DNA（eccDNA），這位超級明星在各家媒體、宣傳號上紛紛閃亮登場。一時間eccDNA走在了生物醫學研究舞臺的最中央，云序生物已經帶您領略過eccDNA在這兩篇重量級文章中的迷人風采（點擊鏈接：顛覆性發現：癌基因竟不在染色體上---環狀DNA連登Nature，Cell!），它極大的豐富了腫瘤異質性的研究內容，為液體活檢、腫瘤耐藥以及腫瘤微環境討論指明了新的方向。eccDNA在腫瘤環境中可以借助多樣的成環方式、開放的高級結構以及多個調控元件的輔助，強有力的推動原癌基因的轉錄，顛覆了科研人員對原癌基因在腫瘤發生發展當中的傳統認知。染色質是動態的！eccDNA也是動態的！ 雖然eccDNA的討論內容多數圍繞腫瘤環境，那eccDNA是否是腫瘤學的專屬明星分子？并非如此，非疾病狀態下的細胞核同樣擁有豐富的eccDNA。云序生物今天帶來的文章將讓大家感受到，eccDNA在正......閱讀全文
Science盤點2013科研熱點
一年一度的Science年度十大科學突破與明年科研熱點預測已經公布了，在今年Science預測2013年的生物類科研熱點中，排在首位的就是單細胞測序技術，Science認為這一技術將能用于促進癌癥和產前診斷等方面的臨床診斷技術發展。除此之外還有人類連接組項目(Human Connectome
環狀RNA，飛速發展的新前沿
生物學家們幾十年前就知道存在一種不尋常的分子，環狀RNA（circRNA）。與線性RNA相比，circRNA受到的關注比較少，也比較難于研究。舉例來說，circRNA很難與其它RNA區分開，擴增或片段化會破壞RNA環，而且早期RNA測序的分析算法會過濾掉circRNA的標志性序列。因為技術和方法
簡述共價閉合環狀DNA（cccDNA）的檢測意義
乙肝病毒不僅僅是一種嗜肝病毒，一些肝外組織中也可檢測到乙肝病毒DNA，如腎臟、胰腺以及外周血單個核細胞（peripheralblood mononuclearcell,PBMC）等。早就有人發現乙肝病毒可以感染白細胞,而這種免疫細胞的感染似乎有利于病毒逃避免疫反應，從而導致機體清除乙肝病毒的能力
關于共價閉合環狀DNA（cccDNA）的展望介紹
我們對HBVcccDNA的認識有待提高。在檢測技術上有許多問題需要解決，比如，如何進一步提高靈敏度，如何避免rcDNA同時被擴增（國內有些文獻報告的結果可能忽視了這一問題），如何簡化操作步驟，從而能夠被廣泛應用等。檢測或監測cccDNA的臨床意義也有待挖掘，比如，可以通過細胞和動物模型，來評判新
中方參與Science熱點文章：導航DNA的GPS
全面地確定生殖細胞系和體細胞DNA中的遺傳和表觀遺傳學變異為了解從細菌中的氫生成到人體內葡萄糖動態平衡等基因和表型之間的因果關系提供了一份藍圖。檢測小核苷酸的差異、結構變化(例如復制)，以及一系列的核酸的化學修飾已經揭示了許多潛在于疾病風險、疾病嚴重程度以及對特定疾病治療反應之下的變異。然而，這
核酸染色實驗——DNA
核酸是細胞內的一種大分子化合物，核酸不僅存在于細胞核內，也存在于細胞質中，動物、植物和微生物等都含有核酸。核酸可分為核糖核酸（RNA）和脫氧核糖核酸（DNA）。經過染料和化學試劑，能夠清楚地顯示 DNA 和核仁組成區嗜銀蛋白（AgNOR）物質。實驗方法原理在一般情況下，通過鹽酸水解后使 DNA 殘基
體外連接DNA片段的方式有哪些？
第一種方法是，用DNA連接酶連接具有互補粘性末端的DNA片段;第二種方法是，用T4DNA連接酶直接將平末端的DNA片段連接起來，或是用末端脫氧核苷酸轉移酶給具平末端的DNA片段加上poly(dA)-poly(dT)尾巴之后，再用DNA連接酶將它們連接起來;第三種方法是，先在DNA片段末端加上化學合成
體外連接DNA片段的具體方式介紹
平末端DNA片段的連接常用的平末端DNA片段連接法，主要有同聚物加尾法、銜接物連接法及接頭連接法。同聚物加尾法這種方法的核心部分是，利用末端脫氧核苷酸轉移酶轉移核苷酸的特殊功能。末端脫氧核苷酸轉移酶是從動物組織中分離出來的一種異常的DNA聚合酶，它能夠將核苷酸(通過脫氧核苷三磷酸前體)加到DNA分子
體外連接DNA片段的具體方式介紹
平末端DNA片段的連接常用的平末端DNA片段連接法，主要有同聚物加尾法、銜接物連接法及接頭連接法。同聚物加尾法這種方法的核心部分是，利用末端脫氧核苷酸轉移酶轉移核苷酸的特殊功能。末端脫氧核苷酸轉移酶是從動物組織中分離出來的一種異常的DNA聚合酶，它能夠將核苷酸(通過脫氧核苷三磷酸前體)加到DNA分子
《自然》與《科學》梳理今年全球科研熱點
2016年到來之際，兩大國際權威學術刊物《自然》和《科學》相繼刊發文章，梳理今年全球科研熱點。 中國科研受關注 《自然》雜志認為，中國“科學”系列衛星和500米口徑球面射電望遠鏡（FAST）值得關注。 《自然》說，中國于去年12月成功發射了5顆“科學”系列衛星中的首發星——暗物質粒子探測
《科學》預測2010年科研熱點
阿爾法磁譜儀 最新一期的美國《科學》雜志對2010年的科研熱點進行了預測，包括癌細胞代謝、細胞染色體外顯子測序與疾病、多功能干細胞研究、阿爾法磁譜儀，以及人類太空飛行的未來等領域。 多功能干細胞。位于2008年《科學》雜志十大科學進展之首的細胞重編程能把成人皮膚細胞重新編程為誘導多能
我國科研人員在DNA存儲領域取得新突破
近日，東南大學師生團隊成功將該校校訓“止于至善”存入一段DNA序列，實現了DNA存儲技術的新突破。相關成果發表在國際學術期刊《科學·進展》上。 據東南大學生物電子學國家重點實驗室劉宏教授介紹，大數據時代對更大容量、更快速度的數據存儲形式提出了更高要求，DNA存儲技術就是將生物DNA分子進行編碼
我國科研人員在DNA存儲領域取得新突破
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/12/469998.shtm 新華社南京12月1日電（記者陳席元）近日，東南大學師生團隊成功將該校校訓“止于至善”存入一段DNA序列，實現了DNA存儲技術的新突破。相關成果發表在國際學術期刊《科學·進展》上
細胞化學詞匯共價閉和環狀DNA
中文名稱：共價閉和環狀DNA英文名稱：covalently closed circular DNA;cccDNA定 義：兩條多核苷酸鏈是完全連續的環狀雙鏈DNA分子。由于鏈上沒有裂隙可以釋放內部張力，所以可以形成超螺旋結構。天然狀態下某些病毒、細菌的染色體DNA，質粒、線粒體和葉綠體的DNA具有這
科學家發現功能增強子導致染色體外致癌基因擴增
近日，美國克利夫蘭凱斯綜合癌癥中心等科研機構的科研人員在Cell上發表了題為“Functional Enhancers Shape Extrachromosomal Oncogene Amplifications”的文章，發現功能增強子導致染色體外致癌基因擴增 跨越致癌基因邊界的非編碼區擴增一
DNA體外轉染試劑_如何準備轉染所需的質粒DNA
轉染效率受到諸多因素的影響，除了細胞、培養基和載體等影響因素外，另外一項非常重要的因素便是DNA的質量。為了比較不同廠家的轉染效率，我們分別從三家不同的供應商購買了質粒制備試劑盒來制備pEGFP-N3質粒DNA，并通過不同的方法將制備的pEGFP-N3質粒轉運至NIH-3T3細胞。pEGFP-N3質
研究人員繪制出首張兒童癌癥環狀DNA圖譜
隨著時間推移，癌癥的發生往往與DNA缺陷的逐漸積累有關，因此，癌癥通常會被認為是一種年齡相關的疾病，那么為何兒童也會患癌呢？近日，一項刊登在國際雜志Nature Genetics上的研究報告中，來自德國夏洛蒂—洪堡大學和柏林自由大學附屬醫學中心等機構的科學家們通過研究發現，染色體外環狀DNA或會
兒童的年輕細胞如何轉化為癌細胞
一般認為，多數癌癥的發展與DNA缺陷隨時間逐漸積累有關。但是為什么孩子也會發展為癌癥呢？科學家們繪制了第一張環狀DNA的詳細地圖，對癌癥遺傳學領域長期存在的問題提出了新的意料之外的見解。這項工作已經發表在《 Nature Genetics》雜志上。 由Charité Universit?tsm
DNA的Feulgen染色法
1.目的與原理實驗目的： 學習DNA的Feulgen染色方法，觀察染色結果，了解反應原理。實驗原理： DNA經弱酸(1mol／L HCl)水解，其上的嘌呤堿和脫氧核糖之間的鍵打開，使脫氧核糖的一端形成游離的醛基，這些醛基在原位與Schiff試劑(無色品紅亞硫酸溶液)反應，形成紫紅色的化合物，
DNA的Feulgen染色法
1.目的與原理實驗目的：學習DNA的Feulgen染色方法，觀察染色結果，了解反應原理。實驗原理：DNA經弱酸(1mol／L HCl)水解，其上的嘌呤堿和脫氧核糖之間的鍵打開，使脫氧核糖的一端形成游離的醛基，這些醛基在原位與Schiff試劑(無色品紅亞硫酸溶液)反應，形成紫紅色的化合物，使細胞內含有
DNA熒光染色的樣品制備
試劑、試劑盒 PBS儀器、耗材 DNA熒光染料 流式細胞儀實驗步驟 DNA是細胞內含量比較恒定的參量，隨著細胞增殖周期的各時相而發生變化。熒光染料（如PI）可選擇性地定量嵌入核酸（DNA/RNA）的雙螺旋堿基之間，與細胞特異性結合，DNA含量與熒光染料的結合量成正比，因此通過測定熒光強度可獲知細胞的
DNA的Feulgen染色法
1.目的與原理 實驗目的： 學習DNA的Feulgen染色方法，觀察染色結果，了解反應原理。 實驗原理： DNA經弱酸(1mol／L HCl)水解，其上的嘌呤堿和脫氧核糖之間的鍵打開，使脫氧核糖的一端形成游離的醛基，這些醛基在原位與Schiff試劑(無色品紅亞
染色體DNA的提取
一、實驗目的與原理DNA是遺傳信息的載體，是最重要的生物信息分子，是分子生物學研究的主要對象。DNA的提取是分子生物學實驗技術中的最重要、最基本的操作。本實驗通過植物樣品在液氮下研磨以粉碎組織，通過裂解液裂解細胞，有機溶劑反復抽提，使DNA進入水相與蛋白質成分分開，在RNase作用下，降解RNA以純
關于共價閉合環狀DNA（cccDNA）的定量檢測介紹
在定性檢測的基礎上，可以進一步對共價閉合環狀DNA（cccDNA）進行定量檢測。仍以PCR定量分析技術中，尤其是競爭PCR技術的敏感性和精確度高。方法是在PCR反應管中加入一種已知量的、能與野生模板等效擴增的內參照，內參照是經過突變處理的，其兩端尤其是引物退火區的序列與野生模板相同。PCR擴增后
關于共價閉合環狀DNA（cccDNA）的檢測方法介紹
共價閉合環狀DNA（cccDNA）和rcDNA在結構和理化特性上有三點不同： ①rcDNA在正鏈與負鏈上均有缺口或缺刻，只是部分區域互補故能形成環狀結構，但非超螺旋結構；而cccDNA兩條鏈均是完整的，二者共價互補，形成超螺旋結構。 ②rcDNA能與蛋白質共價結合，cccDNA則不能。 ③
上科大：孕育新動能－開啟新征程
近日，教育部、財政部、國家發展改革委正式公布第二輪“雙一流”建設高校及建設學科名單。上海科技大學（以下簡稱上科大）首次入圍“雙一流”建設，“材料科學與工程”學科列入一流學科建設名單。 上科大是一所近年來廣受矚目的新型研究型大學。學校創辦于2013年，由上海市人民政
上科大：孕育新動能－開啟新征程
近日，教育部、財政部、國家發展改革委正式公布第二輪“雙一流”建設高校及建設學科名單。上海科技大學（以下簡稱上科大）首次入圍“雙一流”建設，“材料科學與工程”學科列入一流學科建設名單。 上科大是一所近年來廣受矚目的新型研究型大學。學校創辦于2013年，由上海市人民政
“一稿成”的項目開啟科研生涯
“這種事情大概率不會再有了。” 從豐厚人生積淀中拾起這個35年前的記憶片段時，中山大學中山醫學院教授顏光美依然特別興奮。 1987年，中山醫科大學（現中山大學中山醫學院）青年講師顏光美開始著手撰寫自己的第一份國家自然科學基金項目申請書時，已經是學校報送項目截止日期的前一天了。他熬了個通宵，一
體外培養細胞的染色體標本制備實驗
實驗材料細胞實驗步驟1． 體外培養的細胞，在倒置鏡下觀察到有較多的分裂細胞（傳代后24h，圓形發亮的細胞）時，加入秋水仙素溶液，終濃度為0.3μg/ml培養液；?2． 繼續培養3h；?3． 胰酶消化收集細胞至離心管；?4． 離心1000轉/min，離心10min，去上清；?5． Hanks液洗，離心
體外培養細胞的染色體標本制備實驗
實驗材料?細胞實驗步驟?1． 體外培養的細胞，在倒置鏡下觀察到有較多的分裂細胞（傳代后24h，圓形發亮的細胞）時，加入秋水仙素溶液，終濃度為0.3μg/ml培養液；?2． 繼續培養3h；?3． 胰酶消化收集細胞至離心管；?4． 離心1000轉/min，離心10min，去上清；?5． Hanks液洗，