蛋白質組學研究的策略和范圍
蛋白質組學一經出現,就有兩種研究策略。一種可稱為“竭澤法”,即采用高通量的蛋白質組研究技術分析生物體內盡可能多乃至接近所有的蛋白質,這種觀點從大規模、系統性的角度來看待蛋白質組學,也更符合蛋白質組學的本質。但是,由于蛋白質表達隨空間和時間不斷變化,要分析生物體內所有的蛋白質是一個難以實現的目標。另一種策略可稱為“功能法”,即研究不同時期細胞蛋白質組成的變化,如蛋白質在不同環境下的差異表達,以發現有差異的蛋白質種類為主要目標。這種觀點更傾向于把蛋白質組學作為研究生命現象的手段和方法。早期蛋白質組學的研究范圍主要是指蛋白質的表達模式(Expression profile),隨著學科的發展,蛋白質組學的研究范圍也在不斷完善和擴充。蛋白質翻譯后修飾研究已成為蛋白質組研究中的重要部分和巨大挑戰。蛋白質-蛋白質相互作用的研究也已被納入蛋白質組學的研究范疇。而蛋白質高級結構的解析即傳統的結構生物學,雖也有人試圖將其納入蛋白質組學研究范圍,但仍......閱讀全文
磷酸化蛋白質組學研究獲進展
中科院大連化物所生物技術部1809組封順、葉明亮、鄒漢法等人關于新型金屬離子固定化親和色譜固定相應用于磷酸化蛋白質組學的研究成果(Immobilized Zirconium Ion Affinity Chromatography for Specific Enrichment of Phosphop
我國蛋白質組學研究取得系列成果
由中國科學院院士賀福初領銜的北京蛋白質組研究中心/蛋白質組學國家重點實驗室,在國際學術刊物《分子與細胞蛋白質組學》(Molecular & Cellular Proteomics,MCP)2009年第三期上,同時發表了《亨廷頓疾病患者腦脊液的腦特異性蛋白含量下調》等3篇研究論文。3篇論文在該刊同
張麗華:搭建蛋白質組學研究平臺
分析測試百科網訊 自然科學研究,原則上應該是理性思辨能力更強的男性占優;而從屠呦呦獲得了諾貝爾獎可以推斷,女性從事科學研究同樣可以做得出色。在分析化學領域,有這樣一位女性。她曾榮獲2015年“中國青年女科學家獎”;在和男性同臺競爭的舞臺上,她2014年入選了中組部“萬人計劃”; 2017年獲得了
蛋白質組與蛋白質組學簡介1
一、蛋白質組概念:一個細胞、一個組織或一個機體全部基因所表達的全部蛋白質。 二、蛋白質組學研究范疇 1.蛋白質和蛋白質間 2.蛋白質和核酸之間 3.蛋白質及其組成質點的分離、分析、鑒定 4.蛋白質結構分析 5.生理、病理或不同發育狀態下蛋白質組表
蛋白質組與蛋白質組學簡介2
3 甲基化干擾實驗用來檢測蛋白質的結合位點。甲基化修飾的DNA探針可以干擾蛋白質的結合。結合位點上未被修飾的DNA片段才能與蛋白結合,然后將DNA從被修飾的堿基處切割,電泳分離,結合蛋白的DNA在結合位點上不能被修飾,不能切斷,可確定結合位點的位置。 4 Dnase I 足紋分析 蛋白
綜述:基于質譜技術的糖蛋白質組學與糖組學研究進展
糖是組成生命體的四大類重要分子之一,糖蛋白質是由糖鏈與肽鏈中的特定氨基酸殘基以糖苷鍵共價連接而成的蛋白質。糖蛋白質普遍存在于生物體內,在很多生命過程中起著重要作用,如蛋白質的折疊、細胞之間的相互識別、炎癥反應等。同時,糖基化修飾在疾病中,特別是腫瘤的發生、發展和轉移過程中也起到重要作用,許多疾
糖組學的概念、研究技術和應用
概念:醣體學(Glycomics)是生物學的一個學門,專門研究寡醣類(oligosaccharide)構造與功能。Glycomics一詞是從表示糖或甜味的「glyco-」與基因體學(genomics)和蛋白質體學(proteomics)之命名規律而來。此規律也導致了醣體(glycome)一字的出現,
魯克在-timsTOF-4D蛋白質組學和表觀蛋白質組學平臺上擴展
在蛋白質組論壇| EuPA 2022,布魯克公司(納斯達克股票代碼:BRKR)宣布擴展了更深層次的蛋白質組學和表觀蛋白質組學覆蓋的能力,包括使用創新的 TIMScore 算法增強磷酸肽分析,該算法現在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平臺的一部分。新的 TIMScore 算法利用機器學
布魯克:利用CCS檢測和深度學習研究4D蛋白質組學
近日,Matthias Mann教授團隊和Fabian Theis教授組*共同在《Nature Communication》上發表開創性成果,標題為“Deep learning the collisional cross sections of the peptide universe from
大熊貓乳汁蛋白質組學和代謝組學國際合作獲進展
國家國際科技合作專項項目“大熊貓乳蛋白的分析及人工乳的研制”承擔單位成都大熊貓繁育研究基地聯合英國格拉斯哥大學首次對大熊貓乳汁展開了蛋白質組學和代謝組學研究,取得了階段性進展。雙方研究人員通過非麻醉的方式采集馴化后的大熊貓母乳,連續采集至幼仔出生后180天,并對乳汁進行了蛋白組學和代謝組學的研
“Q-Exactive-蛋白質組學研究的綜合平臺”網絡講座
9月27日,賽默飛世爾科技借分析測試百科網這一平臺成功舉辦了“Q Exactive 蛋白質組學研究的綜合平臺”網絡講座。賽默飛世爾科技李靜工程師為大家介紹了Q Exactive高性能臺式四極桿—軌道阱系統的基本組成及特點,著重講解了Q Exactive 在蛋白質組學應用的優勢。 賽默飛世爾科技
生物質譜——蛋白質組學研究的肱股之臣
分析測試網訊 2017年11月29日,由北京大學,首都科技條件平臺主辦,安特百科(北京)技術發展有限公司(分析測試百科網)協辦的題為“生物質譜在蛋白質組學研究中的應用”的講座在北京大學化學與分子工程學院化學樓A201報告廳舉辦,來自蛋白質行業的專家學者參與了此次講座。北京大學分析測試中心、美國密
蛋白質組學在植物科學研究中的應用
1 植物群體遺傳蛋白質組學 1.l 遺傳多樣性蛋白質研究基于基因組學的一些遺傳標記,如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen
蛋白質組學牛人Cell發表病毒研究新工具
科學家們在質譜分析的基礎上,開發了一種全新的蛋白質組學技術——QTV(quantitative temporal viromics)。這一技術能夠在病毒感染的過程中,對宿主和病毒蛋白的實時動態進行系統性定量分析,展現病毒與宿主的具體互作過程。這一技術發表在六月五日的Cell雜志上。 在QTV技
APAF選擇TripleTOF-5600系統推進蛋白質組學研究
全球生命科學分析技術的 領導者AB SCIEX公司,今天宣布,澳大利亞的蛋白質組分析中心(APAF)選擇了AB SCIEX TripleTOF 5600系統,通過顯著增加蛋白質組覆蓋率來幫助推進蛋白質組學研究。TripleTOF 5600 系統是生命科學產業界最快、最靈敏的高分
新蛋白質組學方法引領蛋白功能研究革命
人類細胞是通過成千上萬個蛋白質的協同作用來控制它們生長和分化的。但是,到目前為止,大多數人類蛋白質的特定功能還不清楚。 疾病的發生常常是由于冠軍細胞蛋白質功能的失常。目前,世界各地已經啟動了大量大規模的研究計劃以了解所有人類蛋白質的功能。 現在,來自IRCM(Instiut de recherc
我國在單細胞蛋白質組學研究獲突破
浙江大學化學系微分析系統研究所方群教授團隊,聯合北京大學醫學部精準醫療多組學研究中心主任黃超蘭教授團隊,在單細胞蛋白質組學分析研究領域取得突破性進展。研究論文近日在線發表在美國《分析化學》雜志上。 黃超蘭介紹,近年來,基于細胞群體內的蛋白質組學研究,已越來越難以滿足對生命功能深入探究的需要。從
定量蛋白質組學的誕生
在現代研究技術,如熒光顯微鏡,流式細胞儀和蛋白質芯片技術中,抗體仍然扮演著非常重要的角色。但依賴于抗體的蛋白質檢測存在一些缺點,其中最大的限制就是,抗體的可用性和質量差別很大。一些大規模項目,比如人類蛋白質圖譜(Human Protein Atlas),Antibodypedia,以及美國NIH
蛋白質組學的樣品制備
想要研究蛋白質,首先要得到高度純化且具有生物活性的目的物質,因此,蛋白樣品的制備是重要前提。蛋白提取的質量和效果對后續的研究分析有重要影響。不同種類的樣本在制備過程中,存在一些差異,要根據樣本特征調整實驗方案和操作細節。基本原則樣品處理盡量簡單,減少蛋白損失;盡量避免蛋白的降解;盡可能提高樣品蛋白的
什么是蛋白質組學
(Marc Wilkins(1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的,它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前,在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的,它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前,在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
蛋白質組學+AI技術
人們在吞咽的時候,頸部有個器官會隨著吞咽動作上下活動,它就是甲狀腺。西湖歐米有望實現臨床轉化的第一個項目,就是基于蛋白質標志物的甲狀腺結節的良惡性診斷。甲狀腺很小,但它影響到五臟六腑。數據顯示,每5個成年人中就可能有1人患有甲狀腺結節。其中,約60%的甲狀腺結節都是良性的。但有10%的結節是惡性的,
什么是蛋白質組學
這個概念最早是在1995年提出的,它在本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征,包括蛋白質的表達水平,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識。目前,在蛋白質功能方面的研究是極其缺乏的。大部分通過基因組測序而新發現的基因編碼的蛋白質的
錢小紅:基于生物質譜進行蛋白質組定性和定量的策略
軍事醫學科學院 錢小紅研究員 2014年4月26日,首屆全國質譜分析學術研討會在北京西郊賓館盛大開幕。來自軍事醫學科學院的錢小紅研究員為大家帶來題為《Biological mass spectrometry based strategies for qu
頑拗性植物組織的蛋白質組學研究(苯酚法提取蛋白質...
頑拗性植物組織的蛋白質組學研究(苯酚法提取蛋白質)實驗實驗材料?植物組織試劑、試劑盒?苯酚提取緩沖液沉淀液等電聚焦緩沖液儀器、耗材?低溫粉碎機實驗步驟 3.1 蛋白質提取( 1 ) 新鮮植物組織在液氮中冷凍,然后在自動低溫粉碎機中預先冷卻的鋼杯中將材料研磨成細碎的粉末(見注釋 4) 。( 2 ) 在
頑拗性植物組織的蛋白質組學研究(苯酚法提取蛋白質)
實驗材料植物組織試劑、試劑盒苯酚提取緩沖液沉淀液等電聚焦緩沖液儀器、耗材低溫粉碎機實驗步驟3.1 蛋白質提取( 1 ) 新鮮植物組織在液氮中冷凍,然后在自動低溫粉碎機中預先冷卻的鋼杯中將材料研磨成細碎的粉末(見注釋 4) 。( 2 ) 在一個 15 ml 的離心管(falcon? tube) 中加入
頑拗性植物組織的蛋白質組學研究(苯酚法提取蛋白質)
1. 前言提取蛋白質是蛋白質組學研究的第一步。植物組織的蛋白質含量較低,并且存在多種非蛋白質成分,如細胞壁及貯藏多糖、脂質和酚類化合物,使蛋白質的提取難度增大 。植物蛋白質的可溶性與它們的細胞內定位關系密切,傳統的蛋白質提取方法是用水合緩沖液、去垢劑或直接沉淀法 [1] 。除了普遍使用的 TCA
蛋白質組研究中的樣品分離和分析
利用蛋白質的等電點和分子量通過雙向凝膠電泳的方法將各種蛋白質區分開來是一種很有效的手段。它在蛋白質組分離技術中起到了關鍵作用。如何提高雙向凝膠電泳的分離容量、靈敏度和分辨率以及對蛋白質差異表達的準確檢測是雙向凝膠電泳技術發展的關鍵問題。國外的主要趨勢有第一維電泳采用窄pH梯度膠分離以及開發與雙向凝膠
植物蛋白質組學和糖基化實驗
實驗材料鏈霉親和素-過氧化物酶 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? 牛胰核糖核酸酶 B ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?