關于基因功能分析的內容介紹
基因功能分析,是指利用生物信息學和不同表達系統對基因的功能進行的預測、鑒定和驗證。基因功能是在細胞組成的多層次復雜生命體中實現的,因此對基因功能的研究將極大程度上依賴于對模式生物的研究。基因功能研究的方法有:基因的生物信息學分析,基因的時空表達譜分析(mRNA水平的表達譜分析和蛋白質水平的表達譜分析),基因的功能預測(利用生物信息學進行功能學上的預測和從結構學方面預測基因的功能),基因功能的實驗學鑒定和驗證(基因敲除和敲入技術、人工染色體的轉導、反義技術、基因誘捕技術和微陣列分析)等。......閱讀全文
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹mTOR基因
雷帕霉素(mTOR)的哺乳動物靶標,也稱為雷帕霉素和FK506結合蛋白12-雷帕霉素相關蛋白1(FRAP1)的機制靶標,是人類中由MTOR基因編碼的激酶。 mTOR是蛋白激酶的磷脂酰肌醇3-激酶相關激酶家族的成員。 mTOR與其他蛋白質結合,并作為兩種不同蛋白質復合物的核心成分,mTOR復合物1和m
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹EGFR基因
EGFR編碼的蛋白是一種跨膜糖蛋白,也是表皮生長因子受體家族中的一員,該家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(erbB3)及HER4(erbB4),也屬于受體酪氨酸激酶家族。EGFR作為細胞表面蛋白可與配體如表皮生長因子(EGF)結合,EGFR可被激活,
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹CREBBP基因
該基因廣泛表達,參與多種不同轉錄因子的轉錄共激活。首先作為一種結合cAMP反應元件結合蛋白(creb)的核蛋白被分離出來,該基因通過將染色質重塑與轉錄因子識別結合,在胚胎發育、生長控制和體內平衡中發揮關鍵作用。該基因編碼的蛋白質具有固有的組蛋白乙酰轉移酶活性,也作為支架穩定與轉錄復合物的額外蛋白質相
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹MYC基因
該基因編碼的蛋白質是一種多功能的核磷蛋白,在細胞周期進展、凋亡和細胞轉化中起到作用。作為調節特定靶基因轉錄的轉錄因子發揮作用。這種基因的突變、過度表達、重排和易位與多種造血腫瘤、白血病和淋巴瘤,包括伯基特淋巴瘤有關。有證據表明,來自上游、非aug(cug)幀和下游aug起始位點的選擇性翻譯起始導致兩
《Cell》:世界首張小鼠微型“擾動圖譜”,解密基因功能
7月22日,上海科技大學生命學院池天課題組在《細胞》(Cell)雜志在線發表論文,報道了一種嶄新的小鼠基因打靶技術iMAP(inducible Mosaic Animal for Perturbation),快速鑒定了90個基因在39種組織的基本功能,構建了世界首張小鼠微型“擾動圖譜”。早在2001
斑馬魚——CRISPR高通量基因功能研究新平臺
近日,來自美國NIH的研究人員進行了一項研究,他們利用CRISPR-CAS9技術靶向斑馬魚特定DNA序列進行基因功能探索和人類治病基因的發現研究,相關研究成果在線發表在國際學術期刊genome research。 在這項研究中,研究人員發現利用基因編輯技術CRISPR-CAS9進行斑馬魚基因靶
Sci-Rep:揭秘新基因功能及癌癥療法靶點
弗吉尼亞聯邦大學醫學院的研究人員最新發現,精子相關抗原6(SPAG6) 有了某些新的功能, 以前這種基因被認為只對纖毛的能動性有重要作用。該基因的缺陷與男性不育相關,盡管新的發現可能會對某些癌癥的診斷和治療有影響。 “精子抗原6調節成纖維細胞的生長、形態、遷移和纖毛發生。”該研究發表在11月
SORBS2基因功能缺失導致心臟結構畸形發生
先天性心臟病是最常見的出生缺陷,是當前面臨的公共衛生問題之一。 記者9日獲悉,國家兒童醫學中心(上海)、上海交通大學醫學院附屬上海兒童醫學中心傅啟華教授團隊和張臻研究員團隊的合作研究闡明了SORBS2基因功能缺失導致心臟結構畸形發生的分子機制。 據介紹,先天性心臟病是多基因疾病,個案的發病原
復旦大學最新綜述:基因功能富集分析研究
“核心刊物”迎來了新期刊:科學通報,中國科學C輯:生命科學,這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的,我國學術期刊中的知名品牌,被國內外各主要檢索系統收錄,如國內的《中國科學論文與引文數據庫》(CSTPCD)、《中國科學引文數據庫》(CSCD)等;美國的SCI、CA、EI,英
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹MPL基因
MPL基因編碼的蛋白為促血小板生成素受體,與NF-κB以及JAK/STAT信號通路相關。
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹SRC基因
SRC基因編碼的蛋白屬于SRC家族激酶(SFKs),該家族由9個成員組成,分別是SCR、LYN、FYN、LCK、HCK、FGR、BLK、YRK和YES,其中SRC是目前研究最多的成員,也是與人類疾病聯系最為密切的蛋白。SRC蛋白是非受體酪氨酸激酶,可被多條信號轉導途徑所激活,而激活后的SRC激酶又通
-Nat-Commun:科學家成功繪就大鼠基因功能圖譜
11種器官和4個發育階段的大鼠基因功能圖譜被成功繪制??????? 記者從復旦大學獲悉,該校藥學院石樂明課題組與美國食品藥品監督管理局國家毒理學研究中心、洛馬林達大學等單位合作,成功繪制出涵蓋11種器官和4個發育階段的大鼠基因功能圖譜。相關成果日前發表于《自然—通訊》雜志。 據介紹,大鼠是一種
想高效分析人類基因功能?試試“反向遺傳學”
一項最新遺傳學研究使用了反向遺傳學方法來探索基因功能,讓研究人員得以評估人類基因功能喪失性突變的表型。研究發表在12日的英國《自然》雜志上,該成果標志著我們開始向大規模研究人類基因功能這一目標出發,并已為其奠定了基礎。 一直以來,科學家們通過敲除模型動物的關鍵基因,再去研究敲除之后發生的變化,
蓖麻磷脂酶PLDζ2同源基因功能研究獲進展
蓖麻油的主要成分(約90%)是羥基化的脂肪酸(HFA)-蓖麻油酸(順式-12-羥基十八碳-9-烯酸),這是一種非常特殊的油脂,具有粘度高、酸度低、耐高溫、不易氧化、不易凝固等特點,具有在500~600℃高溫下不變質、不燃燒,零下18℃ 低溫下不凝固等特殊性能,是一種重要的工業原料。蓖麻(Rici
科學家利用天然基因“敲除”人類探索未知基因功能
人類有大約20000個基因,但實際上大多數基因的功能還未得到了解。了解基因功能的一種方式就是找到缺失特定基因的人,觀察一下他們是否存在健康問題。但在大眾群體中這樣的人很罕見。最近一項新研究指出發現基因功能的一種更加有效的方法:在近親結婚情況比較常見的人群中進行DNA篩查。 這項研究的基因組數據
973首席科學家發現基因功能新起源
來自中科院昆明動物所的研究人員發現在哺乳動物的一個重要轉錄抑制因子CDYL基因中,新外顯子反復在不同哺乳動物譜系中發生,而且這些新外顯子能給該基因帶來很大的功能改變,這說明基因中新外顯子的出現也是增加蛋白多樣性和新功能起源的一種重要方式。這一研究成果公布在國際著名遺傳學刊物《Trends in Ge
怎樣用david數據庫進行基因功能分析
Pathway功能分析及顯著性判斷對差異表達基因進行Pathway功能分析,并計算Pvalue進行顯著性判斷,Pvalue越小,表明該pathway變化越顯著,并可對每條Pathway通路圖進行展示,同時在相應的位置標注差異表達基因。2. Pathway中基因相關性分析根據每兩個基因共出現在同一pa
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹CCND2基因
該基因編碼的蛋白質屬于高度保守的細胞周期蛋白家族,其成員在細胞周期內具有顯著的蛋白質豐度周期性。細胞周期蛋白起著調節CDK激酶的作用。不同的細胞周期蛋白表現出不同的表達和降解模式,這有助于每個有絲分裂事件的時間協調。該細胞周期蛋白與CDK4或CDK6形成復合物,并作為該復合物的調節亞單位發揮作用,其
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹CXCR4基因
該基因編碼基質細胞衍生因子-1特有的CXC趨化因子受體。該蛋白有7個跨膜區,位于細胞表面。它與CD4蛋白一起作用,支持HIV進入細胞,并在乳腺癌細胞中高度表達。該基因突變與突發性(疣、低丙種球蛋白血癥、感染和骨髓增生)綜合征有關。編碼不同亞型的替代轉錄剪接變異體已經被描述。This gene enc
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹HOXB13基因
該基因編碼屬于同源盒基因家族的轉錄因子。該家族的基因在脊椎動物中高度保守,對脊椎動物胚胎發育至關重要。該基因與胎兒皮膚發育和皮膚再生有關。在小鼠體內,一個類似的基因在胚胎的主軸上表現出時間和空間的共線性,但沒有在第二軸上表達,這表明了在沿著主軸的身體模式中的功能。這個基因和其他hoxb基因在染色體1
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹EP300基因
該基因編碼腺病毒E1A相關的細胞p300轉錄輔激活蛋白。作為組蛋白乙酰轉移酶,通過染色質重塑調節轉錄,在細胞增殖和分化過程中起重要作用。通過與磷酸化CREB蛋白特異性結合來介導cAMP基因調控。該基因也被鑒定為HIF1A(缺氧誘導因子1α)的共激活物,因此在缺氧誘導基因如VEGF的刺激中起到作用。這
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹AKT2基因
這個基因是一個假定的癌基因,編碼一個屬于絲氨酸/蘇氨酸激酶亞家族的蛋白質,包含sh2樣(SRC同源2樣)結構域。該基因在8個卵巢癌細胞系中的2個和15個原發性卵巢腫瘤中的2個被擴增和過度表達。過度表達導致人導管胰腺癌亞群的惡性表型。編碼蛋白是一種普通的蛋白激酶,能夠對幾種已知的蛋白進行磷酸化。Thi
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹AKT1基因
AKT1基因編碼的是絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,可通過磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)依賴的機制被胞外信號激活,目前發現AKT家族有三個成員,分別為AKT1/PKBα、AKT2/PKBβ和AKT3/PKBγ。,AKT則是PI3K/AKT信號通路中核心因子,PI3Ks能特異性磷酸化磷脂酰肌醇(PI)的3位羥基
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹EP300基因
該基因編碼腺病毒E1A相關的細胞p300轉錄輔激活蛋白。作為組蛋白乙酰轉移酶,通過染色質重塑調節轉錄,在細胞增殖和分化過程中起重要作用。通過與磷酸化CREB蛋白特異性結合來介導cAMP基因調控。該基因也被鑒定為HIF1A(缺氧誘導因子1α)的共激活物,因此在缺氧誘導基因如VEGF的刺激中起到作用。這
中科院:基因功能分化或致人類腦容量急劇擴增
記者5月28日從中科院昆明動物所獲悉,該所研究人員近期發現,導致人類大腦發育異常的MCPH1基因,在人類大腦進化和智力起源中起到關鍵作用,可能是人類大腦區別于其他非人靈長類大腦的重要遺傳因素之一。相關成果在線發表于《BMC生物學》雜志。 據該所研究員宿兵介紹,人類區別于非人靈長類最顯著的特
基因組所人類雙向成對基因功能網絡研究獲進展
近日,中國科學院北京基因組研究所于軍研究員和雷紅星研究員合作開展的人類雙向成對基因功能網絡研究取得階段性進展,其研究論文Functional Networking of Human Divergently Paired Genes (DPGs),于10月在PLoS ONE雜志上發表。該文
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹CRLF2基因
該基因編碼一個I型細胞因子受體家族成員。編碼蛋白是胸腺基質淋巴生成素(TSLP)的受體。與白細胞介素7受體(IL7R)一起,編碼蛋白和tslp激活Stat3、Stat5和Jak2途徑,這些途徑控制細胞增殖和造血系統發育等過程。該基因與14號染色體上的免疫球蛋白重鏈基因(igh)或同一X或Y染色體上的
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹PTPN11基因
PTPN11基因編碼的是酪氨酸磷酸酶Shp2,是酪氨酸磷酸酶(PTPs)家族中的重要成員。PTPs是重要的信號分子,在大多數組織中廣泛表達,調節多種細胞功能,如絲裂原活化、能量代謝調、基因轉錄以及細胞遷移,在這個基因的突變與努南綜合征(Noonan syndrome)以及急性髓細胞白血病相關。
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹BCL2基因
由BCL2基因在人體內編碼的Bcl-2(B細胞淋巴瘤2)是調節蛋白Bcl-2家族的創始成員,其通過誘導(促凋亡)或抑制(抗細胞凋亡)來調節細胞死亡(細胞凋亡)。 Bcl-2的名稱來源于B細胞淋巴瘤2,因為它是最初在染色體易位中描述的一系列蛋白質的第二個成員,涉及濾泡性淋巴瘤中的染色體14和18。 已
JakSTAT信號通路相關基因功能介紹STAT4基因
這個基因編碼的蛋白質是轉錄因子stat家族的一員。在對細胞因子和生長因子的反應中,stat家族成員被受體相關的激酶磷酸化,然后形成homo-或異二聚體,在那里它們作為轉錄激活因子轉移到細胞核。這種蛋白對于調節淋巴細胞對il12的反應和調節t輔助細胞的分化至關重要。該基因突變可能與系統性紅斑狼瘡和類風