囊性纖維化是由囊性纖維化跨膜傳導調節因子(CFTR)突變引起的致命疾病。在過去的八十年中,醫學進步改善了囊性纖維化的治療。患者的平均生存年齡從20世紀30年代的早期嬰兒期延長至目前的47歲左右。大多數治療提供癥狀緩解,包括幫助消化的胰酶補充劑,預防和治療感染的抗生素,清除氣道的粘液稀釋藥物和肺移植。最近,已經開發出針對CFTR蛋白的療法。小分子CFTR調節劑包括增加細胞表面CFTR豐度的校正劑和增加突變CFTR離子通量的增效劑。目前,由Vertex制藥公司開發的兩種校正藥物(lumacaftor和tezacaftor)和一種增效劑(ivacaftor)可供患者使用。由于缺乏結構信息,合理的藥物發現是不可行的。
2019年6月21日,美國科學院院士陳覺(洛克菲勒大學)在Science 在線發表題為“Structural identification of a hotspot on CFTR for potentiation”的研究論文,該研究報告了與兩種不同增效劑復合的人CFTR的冷凍電子顯微鏡(EM)結構:Vertex公司開發的藥物ivacaftor和Galapagos開發的研究藥物GLPG1837,分辨率分別為3.3埃及3.2埃。
該研究發現:首先,盡管這兩種增效劑在化學上不相似,但它們都與CFTR的跨膜區內的相同位點結合;其次,因為藥物結合位點與參與門控的鉸鏈一致,該研究提出“口袋”中藥物的存在使孔相對于閉合的開放構型穩定;第三,這里確定的藥物結合口袋可能是CFTR增效劑作用的熱點。現在可以使用這些結合兩種不同增效劑分子的CFTR結構,連同計算,來鑒定新的增效劑。

囊性纖維化跨膜傳導調節因子(CFTR)是在不同器官(包括肺和腸)的上皮表面廣泛表達的陰離子通道。它屬于ATP結合盒(ABC)轉運蛋白的家族,但作為陰離子通道起作用。 CFTR由形成孔的兩個跨膜結構域(TMD),結合并水解腺苷5'-三磷酸(ATP)的兩個細胞質核苷酸結合結構域(NBD)和必須被磷酸化以允許其的調節(R)結構域組成。已發現300多種突變導致囊性纖維化(CF),最普遍的突變是單個氨基酸F508的缺失,這使得CFTR在到達細胞質膜之前易于降解。其他突變體,如R117H和G551D,在細胞膜上表達,但沒有正確的門控作用。
在過去的八十年中,醫學進步改善了囊性纖維化的治療。患者的平均生存年齡從20世紀30年代的早期嬰兒期延長至目前的47歲左右。大多數治療提供癥狀緩解,包括幫助消化的胰酶補充劑,預防和治療感染的抗生素,清除氣道的粘液稀釋藥物和肺移植。最近,已經開發出針對CFTR蛋白的療法。小分子CFTR調節劑包括增加細胞表面CFTR豐度的校正劑和增加突變CFTR離子通量的增效劑。目前,由Vertex制藥公司開發的兩種校正藥物(lumacaftor和tezacaftor)和一種增效劑(ivacaftor)可供患者使用。此外,許多其他增強CFTR功能的候選者都在藥物發現渠道中。所有這些CFTR調節劑都是通過強化高通量篩選和迭代藥物化學優化發現的。由于缺乏結構信息,合理的藥物發現是不可行的。為了解決這個問題,該研究在這里報告了與兩種不同增效劑復合的人CFTR的冷凍電子顯微鏡(EM)結構:Vertex公司開發的藥物ivacaftor和Galapagos開發的研究藥物GLPG1837,分辨率分別為3.3埃及3.2埃。

Ivacaftor結合膜內的CFTR
通過篩選增加G551D-CFTR表達細胞中陰離子通量的化合物發現了Ivacaftor。隨后的研究表明,ivacaftor增加了膜片,蛋白脂質體和平面脂質雙層中野生型(WT)和突變型CFTR的開放概率(Po)。 ivacaftor的增強需要蛋白激酶A(PKA)磷酸化CFTR,但不依賴于ATP。這些結果表明,ivacaftor直接作用于CFTR,而不是通過其他調節機制起作用。

不同的氨基酸殘基對ivacaftor結合的貢獻
這兩種藥物雖然在化學上不相似,但與跨膜區域內的相同位點結合。 誘變表明,在兩種情況下,蛋白質提供的氫鍵對于藥物識別是重要的。 ivacaftor和GLPG1837如何與CFTR相互作用的分子細節可以促進治療化合物的基于結構的優化。

GLPG1837與ivacaftor結合于同一位點
總而言之,該研究描述了具有兩個獨立增效劑的CFTR的結構。這些結構可以得出了幾個結論:首先,盡管這兩種增效劑在化學上不相似,但它們都與CFTR的跨膜區內的相同位點結合。這解釋了為什么ivacaftor和GLPG1837在電生理學和結合分析中具有競爭力;其次,因為藥物結合位點與參與門控的鉸鏈一致,該研究提出“口袋”中藥物的存在使孔相對于閉合的開放構型穩定;第三,這里確定的藥物結合口袋可能是CFTR增效劑作用的熱點。現在可以使用這些結合兩種不同增效劑分子的CFTR結構,連同計算,來鑒定新的增效劑。
參考信息:
https://science.sciencemag.org/content/364/6446/1184
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