離子阱質譜和三級四極桿液質聯用系統的區別

　　1.對于多級質譜儀來講，二者都可實現多級，可做真正的MS/MS。

　　2.構造上講：三級四極桿質譜原理上很簡單，它把三個四極桿在空間上串聯起來。但由于離子從第一個四極桿傳輸向下一個四極桿時會有損失，所以最多只能做MS/MS。離子阱質譜的設計獲得了質譜界唯一的Nobel獎，因為它改變了傳統的觀念，在同一個阱中調節RF電壓，來實現時間上的串聯。由于沒有離子空間傳輸的損失，所以它可以實現MS/MS、MS3、…MS10。在結構解析、確認中，它的優越性顯而易見。

　　3.離子阱質譜和三級四極桿質譜主要的區別是：三級四極桿質譜的動態線形范圍更寬，約10的5次方;離子阱質譜的動態線形動態范圍為約10的4次方。

　　4.在做定量、做低檢測限時，以前，許多人用三級四極桿質譜，目前，很多人將方法移植到離子阱質譜(比如美國FDA做氯霉素，比利時、香港、新加坡、瑞士等獸藥殘留監測組織，所用質譜都是Finnigan的LCQ系列產品)上，對許多化合物都可以獲得<1ppb的檢測限和很好的定量結果。

　　5. 在功能上，有時僅用MS2無法確證某些化合物，必須使用MS3、MS4、…,所以，離子阱的功能更多，應用范圍更廣。

　　6. 由于構造上的原因，離子阱相對三級四極桿質譜，儀器調諧、使用和維護都更加容易，這也是目前大多數用戶選擇離子阱質譜的原因之一。