重點實驗室與中國農大聯合在NatureMicrobiology發表論文

　　2017年2月7日，中國農業大學動物醫學院沈建忠院士耐藥性研究團隊在我中心衛生部重點實驗室主任吳永寧研究員的參與下，在著名期刊《Nature Microbiology》上在線發表題為“Comprehensive resistome analysis reveals the prevalence of NDM and MCR-1 in Chinese poultry production”的研究文章，首次揭示了重要泛耐藥基因blaNDM和mcr-1在家禽產業鏈及家禽養殖環境中的傳播規律。

　　碳青霉烯類抗生素是臨床治療革蘭氏陰性菌多重耐藥感染最重要的抗菌藥物；而多肽類的黏菌素則是人醫臨床上治療這類細菌感染的最后一道防線，因而它們具有很重要的公共衛生意義。2009年在印度新德里發現的碳青霉烯耐藥基因blaNDM可介導耐藥菌對所有β-內酰胺類藥物耐藥，攜帶該基因的細菌稱為“超級細菌”；而可轉移的黏菌素耐藥基因mcr-1則是沈建忠院士主持的973項目“畜禽重要病原菌耐藥性的產生、傳播與控制技術”中，由我國科學家首先從食品動物、動物性食品和人的大腸桿菌中發現的又一個“超級耐藥”基因（于2015年11月在Lancet Infectious Disease雜志全文在線發表）。

　　該耐藥基因mcr-1可介導革蘭氏陰性菌對黏菌素耐藥，從而可導致臨床上腸桿菌科細菌感染治療最后一道防線的失守。因而這種耐藥基因的發現引起了全世界廣泛的關注，迅速成為耐藥研究領域的熱點。英國卡迪夫大學Timothy R. Walsh教授和吳永寧針對我國基于風險評估停止黏菌素作為飼料添加劑的使用，在Lancet Infectious Disease雜志發表了Comment，并被該雜志同期Editorial進行社評。

　　為了探明blaNDM和mcr-1在我國家禽產業鏈條及其養殖環境的流行傳播特征，沈建忠院士課題組通過對國內雞肉生產鏈“上游種雞場-商品雞場-屠宰場-超市”收集的1000多份樣本（家禽生產鏈樣本、鳥、蒼蠅、和狗等養殖環境樣本）進行碳青霉烯和多粘菌素耐藥性監測，并對耐藥菌株的流行傳播特征分析后發現：大腸桿菌能攜帶多粘菌素耐藥基因mcr-1從上游種雞場沿著雞肉生產鏈條一直傳播到超市，說明黏菌素作為抗菌促生長劑在家禽養殖業的大量、廣泛使用可能是導致該耐藥基因廣泛存在的主要原因；而碳青霉烯耐藥基因blaNDM雖在上游種雞場為陰性，但在商品雞場的雞、鳥、狗和蒼蠅，甚至飼養員攜帶的大腸桿菌中陽性率極高，并且能傳播至下游生產鏈條，這是首次揭示了兩種耐藥基因blaNDM和mcr-1在雞肉養殖鏈中的不同的傳播模式。分離的碳青霉烯耐藥大腸桿菌和澳大利亞、新加坡、挪威、美國、哥倫比亞以及中國人醫臨床分離的blaNDM耐藥大腸桿菌親緣關系極其相近，推測家禽產業鏈中流行的blaNDM基因來源于人，并可能通過侯鳥遷徙或者人員接觸進行擴散。該研究直接從糞便樣品所提的基因組檢測出耐藥基因blaNDM和mcr-1，并且檢出率遠遠高于樣品中產blaNDM和mcr-1的大腸桿菌的分離率，推測這兩種耐藥基因可存在于不可培養細菌中，并將這種現象命名為“Phantom Resistome（幽靈耐藥組）”。