當宏基因組遇上單細胞測序
日前，科學家們通過宏基因組測序和單細胞測序鑒定了一類新細菌。 16S rRNA基因序列的保守性和普遍性，使其成為了微生物檢測和分類鑒定的強有力工具。這種方法為科學家們揭示了微生物群體的高度復雜性，但它還是有所遺漏。美國能源部聯合基因組研究所上周的一次會議上，研究者人員向人們展示了在四個溫泉樣本（北美和亞洲）中發現的一類新細菌Candidatus Kryptonia。這項研究共測序了22個Kryptonia基因組。 基因組分析顯示，Kryptonia屬于擬桿菌門。擬桿菌門的成員一般生存在腸道或海洋中，而Kryptonia是其中首個極端嗜熱菌。研究人員指出，Kryptonia可能是通過水平基因轉移從古生菌獲得這種能力的。 16s rRNA檢測無法發現這種細菌，這是因為在通用引物的結合處發生了刪除事件。Nikos Kyrpides領導團隊通過宏基因組測序和單細胞測序證實了這種細菌的存在，并將其命名為Kryptonia。 研......閱讀全文
研究人員繪出蘋果基因組草圖
一個國際科研小組8月29日在英國《自然—遺傳學》（Nature Genetics）雜志上報告說，他們繪出了蘋果的基因組草圖，這將有助于從基因水平上分析蘋果性狀，培育更多蘋果新品種。 意大利、美國、新西蘭等國研究人員報告說，他們繪出的是廣受人們喜愛的“金冠蘋果”的基因組草圖。結果
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
研究人員破譯香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/11/512730.shtm廣東省農業科學院研究員易干軍領銜的香蕉遺傳改良團隊與廣西大學教授陳玲玲團隊合作，破譯了香蕉“美食蕉”品種香蕉基因組，首次在國際上組裝染色體級別的異源三倍體香蕉栽培種（AAB）參考基因
研究人員成功構建首個圭亞那柱花草基因組
在國家自然科學基金等項目的資助下，華南農業大學副教授陳曙團隊成功完成首個圭亞那柱花草染色體水平基因組組裝，從基因組、轉錄組及表觀遺傳組多維度解析其抗逆分子機制，為熱帶牧草分子育種與抗逆研究提供關鍵理論支撐與基因資源。相關成果近日發表于《植物雜志》（The Plant Journal）。圭亞那柱花草比
研究人員發現：霍亂正改變人類基因組
生命演化到今天，人類似乎已經進入最完美的狀態。我們的基因組是否已經穩定?改變是否還在發生?科學家們一直在尋找答案。一項新研究表明，當代人類也在進化，而引發這種進化的，竟然是霍亂。研究人員發現的證據證明：在霍亂流行的孟加拉國，人們的基因已經找到了對抗霍亂的辦法。這是發生在當代的人類進化案
研究人員首次破譯艾滋病病毒完整基因組
新華網華盛頓8月6日電 美國北卡羅來納大學6日報告說，該校的一個科研小組成功破譯了艾滋病病毒的完整基因組。這對于人類理解艾滋病病毒感染人體的機制，尋找抗“艾”新療法提供了有力幫助。 相關論文發表在6日出版的英國《自然》雜志上。研究小組負責人凱文·威克斯介紹說，艾滋病病毒的遺傳信息由單鏈核糖
研究人員構建人類陰道微生物基因組庫
6月21日，深圳市寶安中醫院（集團）副院長黃鏈莎、轉化醫學中心助理研究員孫文與大連醫科大學副教授鄢秋龍等課題組的最新合作成果發表于《自然—微生物學》。人類女性陰道是一個包括細菌、真菌和病毒在內的復雜微生態系統，各微生物之間是相互制約、相互作用、相互依賴、對立統一的關系，其間的平衡關乎女性生殖健康及胎
研究人員發布最新版樹鼩基因組注釋
樹鼩是一種與實驗大鼠差不多大小的小型哺乳動物，是靈長類的近親。由于其繁殖周期短（約6周），飼養成本低，單胎產仔數較高（每胎2-5只）等特點，在某些方面有望替代非人靈長類用于生物醫學研究和應用。目前，樹鼩已被用于多種感染性疾病模型創建，是研究視覺系統與功能的很好的動物。中國科學院昆明動物研究所研究
日本研究人員首次成功繪制日本人基因組圖譜
據日本共同社報道，日本理化學研究所基因組醫科學研究中心日前通過新一代DNA測序儀成功繪制出首份日本人基因組圖譜。該成果10月24日發表在美國《自然—遺傳學》雜志網絡版上。 DNA一共有4種堿基排列組合，人類大約有30億對堿基對。新一代測序儀可將DNA進行極其精細的切片，對大量切片同時
研究人員成功測序蒙特莫朗西酸櫻桃基因組
密歇根州的酸櫻桃產量在全美名列前茅，密歇根州立大學的一個研究小組啟動了一個項目，旨在確定與酸櫻桃樹晚開有關的基因，以滿足不斷變化的氣候的需要。他們首先將晚開的櫻桃樹的DNA序列與一個相關物種--桃子的基因組測序進行了比較。他們首先將開花遲緩的酸櫻桃樹的DNA序列與它們的親戚桃子的基因組序列進行比較。
安捷倫授予臨床基因組研究人員Peter－Robinson“思想領袖獎”
分析測試百科網訊 2016年11月29日，安捷倫科技宣布將安捷倫思想領袖獎授予給Peter Robinson, M.D., MSC，以表彰其對臨床基因組學和計算生物學的貢獻。在今年早些時候，中國中醫科學院中藥研究所所長陳士林（詳見本網報道：中藥研究所所長陳士林獲得“安捷倫思想領袖獎”）和癌癥研究
研究人員完成棗和酸棗單倍型基因組組裝
近日，西北農林科技大學林學院紅棗團隊黃建研究員課題組以我國制干棗主栽品種‘駿棗’和著名“秦藥”代表清澗酸棗為研究材料，整合了PacBio HiFi、ONT ultra-long和Hi-C等多種先進測序技術以及多種組裝策略完成了棗和酸棗T2T gap-free和T2T gap-free單倍型基因組的組
研究人員解析人類基因組計劃的贏利奧秘
人類基因組計劃(genome project)為美帶來1萬億美元經濟增長。 美國巴特爾紀念研究所6月12日發布的一份頗具爭議的報告指出，解碼人類基因組項目的經濟收益持續增長。該項目結束10年后，目前其帶來的收益已接近1萬億美元。 1988~2003 年進行的人類基因組計劃(genom
研究人員觀測到人類基因組新的“暗物質”
人類對基因組變異的認識又向前推進一大步：西安交通大學日前傳出消息，該校葉凱青年科學家工作室團隊與荷蘭、美國、德國的20個科研機構，通過開發新的計算機算法和分析處理流程，分析并報道了在250個健康家庭的基因組中的所有類型變異，其中包括以前從未觀測到的大量復雜型變異，即基因組中的“暗物質”。 據介
研究人員提出基因組結構變異檢測和分型新方法
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519653.shtm
全球研究人員致力于創造首個合成真核生物基因組
10年前，當遺傳學家Ronald Davis首次提出，他的同事正在嘗試創造人工酵母染色體，并將其放入活細胞時，Jef Boeke并沒有太多想法。Davis就職于美國加州斯坦福大學醫學院，是一個有遠見的人。他提出，實驗室酵母是當時合成生物學領域的下一個發展方向。不過，Boeke并不理
研究人員發布全基因組單核苷酸變異數據庫
10月22日，國際學術期刊Genome Biology 以PGG.SNV： understanding the evolutionary and medical implications of human single nucleotide variations in diverse popul
研究人員從從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜，但這些研究的分辨率比較低，尚沒有深入到精細的核苷酸水平，也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
科研人員完成血吸蟲基因組測序
新華網倫敦7月16日電 兩個國際科研小組16日在英國《自然》雜志上發表了兩篇論文，分別報告其研究人員完成了對亞洲血吸蟲和非洲血吸蟲的基因組測序，這些成果將有助于研發相關藥物。 在16日最新一期《自然》雜志的封面上，是曾讓人視為“瘟神”的血吸蟲的圖像，但這一次它引起注意卻是因為其基因組被完全
中外科研人員繪出老虎基因組圖譜
一個國際科研團隊最近報告說，他們完成了對一只東北虎的基因組測序。這是人類首次獲得老虎的全基因組圖譜，有助研究大型貓科動物的遺傳多樣性和保護瀕危動物。 這項研究由韓國、中國、俄羅斯、蒙古國等國科研人員共同完成，測序目標是韓國首爾一家動物園中一只9歲的雄性東北虎，歷時三年繪制出它的完整基因組圖
科研人員獲取首個純種綠孔雀基因組
紅外相機在恐龍河自然保護區拍到的綠孔雀。受訪者供圖2021年，吳飛在高黎貢山進行鳥類考察。受訪者供圖 《生物多樣性公約》締約方大會第十五次會議（COP15）海報近日發布，和亞洲象、大熊貓等明星動物一起亮相的，還有漂亮的綠孔雀。 與大家經常在動物園中看到的藍孔雀不同，綠孔雀是原生在中國境內的孔雀，
北京基因組研究所Plant－cell基因組研究新成果
來自中科院北京基因組研究所、荷蘭瓦赫寧根大學和中科院/馬普學會等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組，通過測序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因組提供了關于十字花科植物繁殖性狀和基因組進化的新認識。相關研究發表在植物學權威期刊The Plant Cell雜志上
多國科研人員完成“珍珠鳥”基因組測序
測序結果將有助于研究人類語言的基因基礎 4月1日出版的英國《自然》雜志刊登報告說，一個國際科研小組已完成對別稱“珍珠鳥”的斑胸草雀的基因組測序，由于這種歌聲動聽的鳥兒學習鳴叫的過程與人類學習語言過程頗為相似，測序結果將有助于研究人類語言的基因基礎。 該科研小組由美國、英國、德國等多國
科研人員建立植物基因組引導編輯技術體系
基因組編輯技術可以定向修飾植物基因組，從而大大加速植物育種的進程，是實現作物精準育種的重要技術突破。然而，作物的許多重要農藝性狀是由基因組中的單個或少數核苷酸的改變或突變造成的。基于CRISPR/Cas系統的基因組編輯，可利用外源修復模板通過同源重組介導的修復方式（HDR）實現目標基因特定核苷酸
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現，作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白（C2H2-ZF）實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究，有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員，是規模最大的一種人類蛋白。然而，人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
荷蘭科研人員首次繪出女性個人基因組圖譜
荷蘭科研人員5月26日說，他們首次繪出女性的個人基因組圖譜，這將有助于深入研究人的遺傳多樣性。?荷蘭萊頓大學醫學中心發表的一份聲明說，科研人員已測定該中心一位女性臨床遺傳學家的基因組序列，她是基因組被完整測序的首位女性和首位歐洲人。?基因組是指包含在生物DNA（脫氧核糖核酸）中的全部遺傳信息。此前科
研究人員對蚊子蛋白探索
美國國立衛生研究院(NIH)的國家環境健康科學研究所(NIEHS)的科學家使用X射線晶體學解決了AEG12的結構。NIEHS核磁共振小組負責人，資深作者Geoffrey Mueller博士說，在分子水平上，AEG12可以將脂質或膜上的類似脂肪的部分分離出來，從而將病毒結合在一起。穆勒說：“仿佛AEG
研究人員呼吁男性接種疫苗
與人乳頭瘤病毒（HPV）相關的喉癌在全球范圍內驚人地上升，影響到的男性人數是女性的三倍。許多國家已經制定了疫苗接種計劃，以保護女性免受與HPV相關的宮頸癌的侵害；現在是否也是男性接種疫苗的時候了？ HPV是一種常見的、通常沒有癥狀的病毒，通過皮膚間的性接觸傳播。癥狀可能需要數年才能出現，因此人
研究人員成功改變腎臟血型
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2022/8/484572.shtm 目前的器官移植，除了組織相容性抗原要匹配外，還要考慮一個問題——血型匹配。如果能改造出通用血型器官，就能消除器官移植時的血型障礙，從而減少器官浪費、縮短等待時間，最終挽救更多生命
意大利研究人員集會捍衛科學
圖片來源: Italia Unita per la corretta informazione scientifica 旅游者在參觀羅馬著名的西班牙階梯時，同時還看到不同尋常的場面：大約30名科研人員突然出現，展開用不同語言書寫的橫幅和布告，靜止站立在臺階上數分鐘。他們的快閃行動是貫穿意大利的