余永國:測序技術如何實現“精準”的疾病診斷?
為人父母,經常為孩子們的身體和智力發育落后而擔憂,尤其當遇到傳統醫學無法檢測的“罕見病”病因時,父母倍感焦急甚至亂投醫。隨著現代生物技術的迅猛發展,上海交通大學醫學院附屬新華醫院正在采取一些新型的診斷方法,使得原來的“試錯模式”向“精準診斷”轉變,患兒也不用因未知病因而被延誤治療。 這些新型的技術適合于哪些人群?它是如何對兒童疾病進行早期篩查和診斷的?它采用的是什么技術和平臺?它可以用于產前診斷嗎?父母們如何在第一時間接觸到這些技術? 針對上述疑問,生物探索記者有幸采訪到了新華醫院兒童內分泌/遺傳科的余永國醫師。余博士早年在美國哈佛大學醫學院進修分子診斷多年,在遺傳性罕見病的分子診斷方面有著極其豐富的經驗,回國后成功搭建了基因芯片和二代測序研究與診斷平臺;并將全基因組高分辨芯片和二代測序應用于臨床診斷,為提高孤獨癥、智力落后、多發畸形、罕見病等疾病的遺傳診斷率與轉化研究做出了重要成績。 以下是生物探索對余博士的采訪實錄......閱讀全文
遺傳病的基因診斷
根據出生缺陷監測和殘疾兒調查結果顯示,我國是出生缺陷高發國家,每年有近100萬出生缺陷兒發生,30%在出生前后死亡,40%造成終生殘疾,只有30%可以治愈或糾正。在這些出生缺陷兒中,80%是由于遺傳因素造成的。如果能對這些患兒進行癥狀前診斷或產前診斷,給予及時而適當的治療和預防,其經濟和社會效益是不
基因缺失型遺傳的診斷(1)α地貧的基因診斷
α地貧主要是由于基因缺失引起的,缺失的基因可以由1-4個。正常基因組用BamHⅠ切割,可以得到一個14kb的片段,而缺失一個α基因時切點向5’端移位,得到一條10kb的片段。因此,當用α基因探針與基因組DNA進行Southern雜交時(圖13-8),在α地貧2可見一條14kb和一條10kb的帶,在正
基因缺失型遺傳的診斷方法
(1)α地貧的基因診斷:α地貧主要是由于基因缺失引起的,缺失的基因可以由1-4個。正常基因組用BamHⅠ切割,可以得到一個14kb的片段,而缺失一個α基因時切點向5’端移位,得到一條10kb的片段。因此,當用α基因探針與基因組DNA進行Southern雜交時(圖13-8),在α地貧2可見一條14kb
遺傳病的基因診斷選擇
? 一、直接診斷和間接診斷 基因診斷可分為兩類:一類是直接檢查致病基因本身的異常。它通常使用基因本身或緊鄰的DNA序列作為探針,或通過PCR擴增產物,以探查基因無突變、缺失等異常及其性質,這稱為直接基因診斷,它適用已知基因異常的疾病;另一類是基因間接診斷。當致病基因雖然已知但其異常尚屬未知時,或致
遺傳病與腫瘤的基因診斷
從DNA水平上尋找確診遺傳病的指標或探討遺傳病和腫瘤的病因等方面,已取得很大成績,這對產前診斷,早期確診和突變基因攜帶者的檢出等都有重要意義。所用的方法大體有以下幾種。 一、分離基因進行結構分析 利用DNA離體轉化,制備探針,制備基因文庫進行篩檢,最后鑒定載體中插入DNA片段的特性等一系列技術,
遺傳病與腫瘤的基因診斷
從DNA水平上尋找確診遺傳病的指標或探討遺傳病和腫瘤的病因等方面,已取得很大成績,對產前診斷,早期確診和突變基因攜帶者的檢出等都有重要意義。所用的方法大體有以下幾種。 一、分離基因進行結構分析 利用DNA離體轉化,制備探針,制備基因文庫進行篩檢,最后鑒定載體中插入DNA片段的特性等一系
基因檢測:盡早診斷兒童遺傳性疾病
“我國開展兒童遺傳病的研究正是最好的時候,由于基因測序技術蓬勃發展,為新生兒遺傳病的檢測提供了簡便有效的手段”。日前,來自復旦大學附屬兒科醫院兒童發育與疾病轉化醫學研究中心、上海市出生缺陷防治重點實驗室的王慧君副研究員在接受科技日報采訪時告訴記者。 為兒童遺傳病提供有效手段 1990年,住在
基因異常不明的遺傳病的診斷方法
基因異常不明的遺傳病的診斷 成年型多囊腎病(adult polycystic kidney disease,APKD)是一種常染色體顯性遺傳病,發病率高,約1000人中有1名致病基因的攜帶者,起病較晚,多在30歲以后,主要為腎和肝中出現多發性囊腫,臨床表現為腰疼、蛋白尿、血尿、高血壓、腎盂腎炎、腎結
上海兒童醫院與浪潮合作推進罕見病基因診斷
上海市兒童醫院正利用浪潮基因一體機G100開展多個兒童罕見病研究項目,而這些項目將讓成千上萬名罹患罕見病的兒童從中獲益。 據了解,目前國際公認的罕見病有近7000種,但僅有不到5%的罕見病能被有效干預或治療。研究發現,約80%的罕見病由基因缺陷導致。因此,測序罕見病的基因組是預防與治療此類疾病
上海兒童醫院與浪潮合作推進罕見病基因診斷
上海市兒童醫院正利用浪潮基因一體機G100開展多個兒童罕見病研究項目,而這些項目將讓成千上萬名罹患罕見病的兒童從中獲益。 據了解,目前國際公認的罕見病有近7000種,但僅有不到5%的罕見病能被有效干預或治療。研究發現,約80%的罕見病由基因缺陷導致。因此,測序罕見病的基因組是預防與治療此類疾病
因美納與迪拜醫院合作,促進重癥兒童基因診斷
位于阿拉伯聯合酋長國迪拜的 Al Jalila 兒童專科醫院近日表示,它已與因美納簽署協議,合作進行快速全基因組測序以診斷重癥兒童。 根據協議條款,合作伙伴將合作開展一項為期兩年的臨床 rWGS 對新生兒和兒科護理單位影響的研究。該研究將包括 200 名 18 歲以下的兒童及其父母。 因美納將
最新遺傳性反復發熱基因診斷指南
圖為擬定的遺傳性反復發熱基因診斷報告模版。該圖以隱匿性疾病為例,顯示了最低限度的報告項目。理想報告應加亮標出主要結果且不超過1頁。HGVS:人類基因組變異學會??? 遺傳性反復發熱(HRF)是以發熱反復發作和漿膜炎為特征的一組單基因自身炎癥性疾病,這種疾病由參與重要自然免疫的調節基因發生致病性突
多基因遺傳與數量遺傳
? 多基因遺傳(polygenic inheritance)是指生物和人類的許多表型性狀由不同座位的較多基因協同決定,而非單一基因的作用,因而呈現數量變化的特征,故又稱為數量性狀遺傳。多基因遺傳時,每對基因的性狀效應是微小的,故稱微效基因(minor gene),但不同微效基因又稱為累加基因
多重PCR在遺傳病診斷方面的應用基因重排
免疫球蛋白( ?immunoglobulin,Ig)和T細胞受體( T cell ?receptor,TCR)位點包含很多不同的V、D、J基因片段,參與早期白細胞分化的重排過程。VDJ片段重排由重組酶復合體介導,其中RAG1和RAG2蛋白通過識別、切割DNA重組信號序列( ?recombinatio
中國制定單基因遺傳性心血管疾病基因診斷指南
由專家歷時一年半、多次修改制定的《單基因遺傳性心血管疾病基因診斷指南》24日在《中華心血管病》雜志發表,標志著心血管疾病診療向精準化、個體化方向邁出堅實一步。 《指南》由中華醫學會心血管病學分會精準心血管病學學組、中國醫療保健國際交流促進會精準心血管病分會組織專家制定。 單基因遺傳性心血管疾
賀林院士加盟廈門市第五醫院開展基因檢測診斷
昨日,廈門市第五醫院又迎來了一個喜人的時刻,在市衛生計生委的指導、支持下,聘請了中國科學院賀林院士、美國加州大學UCLA醫學部研究助理教授、廈門市“雙百人才”田曉麗博士擔任醫學顧問,并與賀林院士簽署了賀林院士新醫學臨床轉化工作站合作意向書,擬在院內建設第二個院士專家工作站。 隨著兩位頂級專家
淺談遺傳診斷的反例
在精準醫學的框架中,基因診斷是臨床診療的環節之一。跟其它的診斷檢測一樣,它自有其標準,馬虎倉促的診斷不但貽誤病情,嚴重的狀況就是草菅人命。今年9月15日,諸大美國媒體機構報道了LabCorp診斷公司與Wuth一家的5000萬美金的訴訟官司。盡管這一訴訟似乎已經塵埃落定,但對于我們診斷咨詢界,卻似乎不
多重PCR在遺傳病診斷方面的應用抗性基因檢測
抗生素的廣泛使用導致具有耐藥性微生物的增多,比如耐甲氧西林金黃色葡萄球菌( ?methi-cillin resistant Staphylococcus aureus,MRSA)、萬古霉素抗性腸球菌( ?vancomycin resistant enterococcl)和多重耐藥結核分枝桿菌( mu
基因“剪刀”可加速特定基因遺傳
? CRISPR可增加雌性實驗鼠將特定基因傳給后代的幾率。圖片來源:ISTOCK近日,研究人員首次使用被稱為基因“剪刀”的基因組技術CRISPR加快哺乳動物特定基因的遺傳。這種極具爭議的基因驅動策略幾年前在實驗室飼養的昆蟲中得到證明。因為它能在整個物種中迅速傳播一種基因,從而激發了人們利用
關于遺傳性共濟失調臨床應用基因診斷的注意點介紹
第一:明確臨床診斷是關鍵,否則基因診斷無法進行下去。 第二:確定其遺傳方式,根據有無家族史確定其是家族性或散發性,家族性根據遺傳方式判斷是常染色體顯性還是隱性遺傳。 第三:根據臨床特點推斷最可能的SCA亞型,確定基因檢測的先后順序,節約資源和時間。雖然各亞型之間臨床表現重疊,但根據臨床實踐及
基因序列儀在遺傳性疾病診斷上的應用
由于基因突變而導致的疾病具有遺傳性和終身性的特點,一旦患上這種病,會給自身和整個家族帶來痛苦。通過對被檢人員進行基因測序,查看基因突變情況,判斷是否存在基因遺傳病,或者推斷后代患病的概率為婚育提供指導,減少遺傳性疾病的發病率。
幾小時即可完成基因檢測-遺傳疾病診斷速度大幅提升
孟德爾遺傳病患者通常要經過6年以上測試才能得到診斷結果。但現在,沙特阿卜杜拉國王科技大學研究人員開發出一種準確而快速的方法,名為NanoRanger,可在幾個小時內對這一類疾病進行基因檢測,從而改變傳統遺傳疾病診斷。研究成果發表在新一期《Med》雜志上。 新技術使用簡單的分子生物學策略來尋找疑
幾小時即可完成基因檢測-遺傳疾病診斷速度大幅提升
孟德爾遺傳病患者通常要經過6年以上測試才能得到診斷結果。但現在,沙特阿卜杜拉國王科技大學研究人員開發出一種準確而快速的方法,名為NanoRanger,可在幾個小時內對這一類疾病進行基因檢測,從而改變傳統遺傳疾病診斷。研究成果發表在新一期《Med》雜志上。新技術使用簡單的分子生物學策略來尋找疑似存在復
-瑞金醫院找到人體肥胖基因
小鼠去除LGR4基因后能量消耗和新陳代謝增加,體重減輕 未來,肥胖者可能不再需要為減肥煩惱。早報記者昨日從瑞金醫院獲悉,由寧光教授領銜的內分泌科團隊對肥胖有了新發現,通過調節小鼠體內LGR4基因開關,可以影響肥胖的發生。 調查了千余名肥胖者 隨著大眾對健康的關注度越來越高,肥胖
遺傳病的診斷分析
遺傳病的診斷(diagnosis of hereditary disease)可分為產前診斷、癥狀前診斷和現癥病人診斷三種類型。遺傳病的確診是開展遺傳咨詢和防治工作的基礎。遺傳病診斷方法有普遍性診斷原則,又有遺傳學的特殊診斷手段。普遍性診斷原則是與診斷一般疾病相同的方法,即通過對病史、癥狀、
基因診斷
? 醫生需要綜合患者的病史,癥狀,及各種檢查的結果作出臨床診斷。隨著人們對疾病的病因及發病機理的認識的不斷深入,臨床檢查的手段也在不斷進步。目前看來,絕大多數疾病的發生,發展都與患者遺傳背景或者其改變有關,所以臨床上越來越有必要檢查這種變化。這種用分子生物學方法檢測患者體內遺傳物質的水平或結構變化而
關于醫院性敗血癥的診斷與鑒別診斷
反急性發熱患者,白細胞及中性粒細胞明顯增高,而無局限于某一系統急性感染時,都應考慮敗血癥的可能。病史詢問和詳細體檢對協助診斷有推測病原有一定意義。凡新近有皮膚感染、外傷,特別有擠壓瘡癤者;或有尿路、膽道、呼吸道等感染病灶;或各種局病感染雖經有效抗菌藥物治療,而體溫能未能控制者,均應高度懷疑有敗血
關于醫院獲得性肺炎的診斷和鑒別診斷
1、診斷標準 HAP臨床診斷與CAP相同,但臨床表現、實驗室和影像學所見對HAP的診斷特異性甚低。2005年ATS關于HAP臨床診斷包括X線胸片提示新出現的或漸進性滲出灶,結合3項臨床表現(體溫>38℃,WBC增多或減少,膿性痰)中的2項,是開始抗菌藥物經驗治療的指證。粒細胞缺乏、嚴重脫水患者并
基因與性狀的遺傳
生物體的各種性狀是由基因控制的。性狀的遺傳實質上是親代通過生殖過程把基因傳遞給了子代。在有性生殖過程中,精子和卵細胞就是基因在親子間傳遞的“橋梁”。在生物的體細胞(除生殖細胞外的細胞)中,染色體是成對存在的。如人的體細胞中染色體為23對。基因也是成對存在的,分別位于成對的染色體上,如人的體細胞中23
遺傳重組熱點基因研究
??????? 遺傳重組(它涉及DNA股的斷開和重接以產生新的基因組合)是真核細胞生物中的一種基本的生物學過程。在哺乳動物減數分裂的時候,在這一專門化的細胞分裂過程中,來自母系和父系的染色體被一分為二并產生出精子細胞和卵子細胞,而重組過程則將同源染色體的不同部分連接在了一起,從而導致了后代中的基