我國科學家繪制出世界首個石斑魚類基因組序列圖譜
3月18日,中山大學和深圳華大基因研究院召開新聞發布會,宣布石斑魚基因組序列圖譜繪制完成。這是中國完成的第三個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜,也是世界上首個鱸形目鮨科石斑魚類基因組序列圖譜。圖譜的建立,對建立魚類性別控制的生物技術途徑和揭示整個脊椎動物性別決定機制的形成及進化途徑具有重要的理論價值。 石斑魚是知名的海水養殖魚類,經濟價值很高,廣泛分布于印度洋和太平洋的熱帶、亞熱帶海域。 中山大學生命科學學院林浩然院士介紹,石斑魚過去主要依靠天然捕撈,而人工養殖困難。從基因組水平進行研究,成為全面解讀石斑魚的重要突破口,基因圖譜的完成,為建立石斑魚基因組輔助育種技術,快速培育抗病、抗逆、優質、高產的優良品種奠定重要基礎。 林浩然表示,魚類的性別決定方式多種多樣,存在雌雄同體和雌雄一體等現象,性別轉化在魚類中較為常見,石斑魚屬于雌雄同體魚類,首次性成熟時全部為雌性,之后再轉換成雄性。“全基因組序列圖譜繪制完......閱讀全文
我國科學家繪制出世界首個石斑魚類基因組序列圖譜
3月18日,中山大學和深圳華大基因研究院召開新聞發布會,宣布石斑魚基因組序列圖譜繪制完成。這是中國完成的第三個魚類基因組測序項目和全基因組序列圖譜,也是世界上首個鱸形目鮨科石斑魚類基因組序列圖譜。圖譜的建立,對建立魚類性別控制的生物技術途徑和揭示整個脊椎動物性別決定機制的形成及進化途徑
大道致遠:林浩然院士學術成長資料采集感悟
林浩然,漢族,出生于海南省文昌縣白延鎮邁洲村。魚類生殖內分泌學家。1950年入讀嶺南大學理學院生物學系,1954年畢業于院系調整后的中山大學。1979年作為改革開放后第一批公派出國的訪問學者,先后在加拿大不列顛哥倫比亞大學和阿爾伯塔大學深造,并與阿爾伯塔大學魚類學家彼得(R.E.Peter)教
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
“石斑魚”院士林浩然設立教育基金
日前,中國工程院院士林浩然出資50萬元在海南大學設立“林浩然教育基金”,該獎學基金旨在關心青年學者、年輕學子的成長,鼓勵品學兼優的學生學者潛心科研。 2005年,林浩然成為海南大學特聘教授,主要開展水產養殖學科建設和人才培養。他利用海南地處熱帶的天然優勢成功培育出石斑魚苗種,目前海南石斑魚苗種
大道致遠:林浩然院士學術成長資料采集感悟
■李劍 林浩然(1934年11月29日—) 林浩然,漢族,出生于海南省文昌縣白延鎮邁洲村。魚類生殖內分泌學家。1950年入讀嶺南大學理學院生物學系,1954年畢業于院系調整后的中山大學。1979年作為改革開放后第一批公派出國的訪問學者,先后在加拿大不列顛哥倫比亞大學和阿爾伯塔大學深造,并與
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃,那時用的方法叫做雙脫氧終止法,也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中,DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸)來作為原料,但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的,但與普通PCR不同,它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前,由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
最新測序的完整的人類基因組圖譜
最新測序的完整的人類基因組圖譜。 圖片來源:英國《新科學家》網站 20年前,科學家宣布讀取了一個人的全部脫氧核糖核酸(DNA),其實,他們漏掉了少許。現在,由于讀取DNA方法的改進,科學家終于可以從頭到尾讀取人類的全部基因組了!據生物預印本網站(biorxiv)近日報道,美國科學家對全部
羅氏454測序用于野生雙峰駝基因組圖譜繪制
中國及中亞細亞溫帶荒漠地區的駱駝均為雙峰駱駝(Bactrian camel),中國的雙峰駝集中分布于內蒙古西部、寧夏、新疆、甘肅的溫帶荒漠和荒漠草原區,占全國總駝數的95%。且中國尚有數量比大熊貓還少的世界珍稀瀕危動物―野生雙峰駝存在。內蒙古阿拉善盟是中國駱駝最多的地區,擁有雙峰駝10萬峰以
Nature公布大麥基因組圖譜
大麥是世界上最重要的糧食作物之一,17日Nature公布了目前為止最完善的大麥基因組測序圖譜。這項由美國農業部主導的大工程,在德國、日本、芬蘭、澳大利亞、英國、美國和中國科學家們的共同努力下,歷經六年終于取得了重大進展。大麥基因組圖譜將成為人們提高大麥產量、增強大麥抗蟲抗病能力、增加大麥營養價值
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器,于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫,從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道,以節約試劑用量。
PNAS:甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值,日前西班牙的九個研究中心通力合作,利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組,科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組,文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
認識泛基因組測序
什么是泛基因組?2005年,Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念(pangenome,pan源自希臘語‘παν’,全部的意思),泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年,Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接,發現了個體獨有的DNA序列和功能基因,并首次提出了“
絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜完成
絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜已經由中國煙草完成。這是全球第一套煙草全基因組序列圖譜,也是繼馬鈴薯和番茄基因組之后全球完成的第三種茄科植物全基因組序列圖譜。該絨毛狀煙草和林煙草全基因組序列圖譜是目前已知植物基因組序列圖譜中基因組最大、組裝精度最高、組裝結果最好的2個圖譜。絨毛
南林大聯合多家單位完成簸箕柳全基因組測序
近日,南京林業大學長江學者尹佟明教授團隊聯合國內外多家單位完成了簸箕柳的全基因組測序。通過基因組比較研究顯示,楊樹和柳樹起源于共同的古四倍體祖先,這一古四倍化事件發生在距今約5800萬年前,比迄今發現的化石記錄早了約1300萬年。 楊樹和柳樹是重要的造林綠化和用材樹種,在全球分布極為廣泛。化
我國學者成功完成小麥A基因組的測序和精細圖譜繪制
小麥是全球最重要的糧食作物,養活了世界上40%的人口,提供了人類所需熱能和蛋白質的20%。我國是世界上小麥生產和消費大國,常年種植面積為2,400萬公頃左右,年產量近1.3億噸。生產上廣泛種植的普通小麥是一個經兩次自然雜交而形成異源六倍體,含有A、B和D三個亞基因組,其基因組大(約17 Gb,是
北京林大等完成世界首張梅花全基因組變異圖譜
北京林業大學教授張啟翔領銜的國家花卉工程技術研究中心與青島華大基因研究院、深圳華大生命科學研究院及美國賓夕法尼亞州立大學等單位合作,完成了首個梅花全基因組重測序研究,構建了世界首張梅花全基因組變異圖譜。該成果對梅花重要觀賞性狀的遺傳解析具有里程碑的作用。既為其分子標記輔助育種研究提供了重要的理論
由德林等破譯DNA磷硫酰化修飾基因組分布圖譜
記者日前從上海交通大學獲悉,該校微生物代謝國家重點實驗室由德林研究小組在DNA磷硫酰化修飾方面取得突破。相關成果在線發表于《自然—通訊》雜志。 DNA是生命的遺傳物質,由碳、氫、氧、氮、磷五種元素組成。中科院院士鄧子新領銜的團隊在前期工作中發現了DNA上存在一種全新的修飾——磷硫酰化
首次繪制小麥表觀基因組圖譜
最近,英國利物浦大學的科學家們,對小麥中調節基因活性的遺傳性分子變化,進行了首次全基因組范圍的調查,這可能成為提高作物育種技術的一種新工具。相關研究結果發表在最新一期的《Genome Biology》。延伸閱讀:權威期刊發布首個小麥單體型圖譜。 表觀遺傳標記是一種化學標簽,將自己附著在DNA上
首個家雞基因組圖譜繪制完成
西南大學教授徐洛浩課題組以中國特有家雞品系胡須雞為材料,在國際上率先繪制出首個家雞全基因組圖譜。2月13日,相關研究成果以《家雞基因組完成圖的演化分析》為題,發表在美國《國家科學院院刊》上。這是繼去年人類基因組完成圖公布以來,首個發表的脊椎動物基因組完成圖,也是基因組完成圖譜繪制技術首次在經濟動物中
基因組圖譜的方法和意義
中文名稱基因組圖譜英文名稱genomic map定 義展示一種生物全基因組結構的圖譜。按建立圖譜的研究目的方法和精細程度,可以有不同的形式,包括以遺傳學方法建立的遺傳連鎖圖譜,按距離繪出基因位置分布的物理圖譜,經測定核酸序列建立的核苷酸序列圖譜,以及標記出可表達序列的轉錄圖譜等。應用學科生物化學與
揭秘:帝王蟹的基因組圖譜
科學家成功獲得高質量帝王蟹基因組圖譜 帝王蟹 唐伯平供圖 帝王蟹基因組染色體圖譜 唐伯平供圖 帝王蟹和其他泛甲殼動物的系統演化關系 唐伯平供圖 近日,《分子生態資源》發表了首個歪尾類螃蟹的高質量基因組圖譜,即一種重要經濟蟹類藍帝王蟹(Paralithodes platypus)的基因組
我國完成小麥A基因組測序
本報訊(記者丁佳)5月10日,《自然》雜志刊發了中國科學院的一項最新成果,該項研究完成了小麥A基因組的測序和染色體精細圖譜的繪制。 這項由中科院遺傳與發育生物學研究所植物細胞與染色體工程國家重點實驗室、中科院種子創新研究院和遺傳發育所基因組分析平臺等合作完成的研究,全面揭示了小麥A基因組的結構和
測序解讀基因組,真的好嗎?
測序解讀基因組,真的好嗎? “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire,在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說,“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年,但
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中,PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而,PCR也帶來一些問題,包括不均勻擴增,導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序(NGS)平臺而言,測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上,Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-
基因組測序的具體過程
講起來很復雜哈,簡單來說,就是邊合成邊測序,把所要測序的序列通過各種手段來建庫,然后加上5‘和3’都加上接頭,放在一個小玻璃片一樣的芯片上,上面一般是8個lane,把樣品加入到lane上之后和上面長好的接頭序列相結合(之前的建庫時加的接頭與之反向互補),然后再經過PCR擴增的過程形成一個DNA簇,然
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日,中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉,這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3:基因,基因組,遺傳學》(G3-Genes Genomes Genet
基因組測序拯救鸮鸚鵡
為了保護極度瀕危的新西蘭鸮鸚鵡kakapo,幾乎所有剩余個體的基因組都已被測序,這為其保護管理提供了重要信息。 新西蘭鸮鸚鵡kakapo(Strigops habroptila)有幾個特性。它是世界上最重的鸚鵡,有的雄性甚至超過3公斤,被認為有達90年的最長壽命。它是唯一一種不會飛的鸚鵡,通過
簡化基因組測序好做嗎
簡化基因組方法是一種利用酶切技術、序列捕獲芯片技術或其他實驗手段降低物種基因組復雜程度,進而研究基因組各類遺傳結構性變異的技術手段。目前常見的簡化基因組技術包括RAD(Restriction site Associated DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing)。這些技
454用于西紅柿基因組測序
最近,西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜,以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜,并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較,尋找與水果有些特性相關的基因,相關文獻在Nature雜志作為封面文章發