科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日,中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作,破譯了褐牙鲆全基因組序列,通過與半滑舌鰨全基因組比較分析,初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組比較,研究發現褐牙鲆和半滑舌鰨兩者的基因組存在高達85%的相似性。比較其基因組學后,篩選到153個比目魚類特異的基因家族以及12個比目魚擴張的基因家族與細胞分裂和凋亡、眼睛大小調控、視網膜神經遞質、軟骨重構等比目魚變態過程中的生物學現象密切相關。 值得一提的是,hipk基因家族的擴張可能參與了比目魚變態過程中眼睛的移動。此外,研究還鑒定出106個比目魚的正選擇基因,這些基因與體軸發育、神經模式、骨骼肌重建、甲狀腺激素、視黃酸信號通路等密切相關。 研究揭示的甲狀腺激素和視黃酸信號通路在比目魚變態中的協同調控作用與昆蟲變態發育過程中的蛻......閱讀全文
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日,中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作,破譯了褐牙鲆全基因組序列,通過與半滑舌鰨全基因組比較分析,初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
科學家繪制褐牙鲆全基因組精細圖譜
近日,中國水產研究院黃海水產研究所研究員陳松林領導的研究組與上海海洋大學、德國維爾茨堡大學、葡萄牙阿爾加夫大學、深圳華大基因研究院等單位合作,破譯了褐牙鲆全基因組序列,通過與半滑舌鰨全基因組比較分析,初步揭示了比目魚變態發育的分子機制。該研究成果發表于《自然—遺傳學》。 通過與半滑舌鰨全基因組
云南怒江草果全基因組精細圖譜繪制成功
??從20世紀70年代開始,云南省怒江州就開始種植草果,到2020年,種植面積已達111萬畝,不僅是全國草果的核心產區,也是當地群眾脫貧致富的重要經濟作物。 為了加快提高草果遺傳改良效率,培育高產、抗病、優質、安全新品種,對從源頭創新保障草果產業健康可持續發展,2019年9月,怒江州聯合華南農業
科研人員首繪小黃魚全基因組精細圖譜
17日,記者從浙江省農科院獲悉,該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與美國奧本大學、廈門大學合作,首次完成小黃魚全基因組組裝注釋與精細圖譜繪制,為建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產抗病優質良種提供了基因資源和技術手段,相關研究論文近日在線發表于學術期刊《分子生態學資源》上。 小黃魚是中國重要的海產經
解開花鱸的基因密碼
“破譯魚類基因組序列,完成其基因組精細圖譜的繪制意義重大,可以為開展魚類重要經濟性狀的遺傳解析、基因組選擇育種以及良種培育提供基因組資源和技術支撐,使魚類遺傳育種研究進入一個全新的階段。”中國水產科學研究院黃海水產研究所(以下簡稱黃海所)研究員陳松林在接受采訪時表示。花鱸基因家族分析 陳松林供圖
科學家完成糜子全基因組精細圖譜
1月25日,《自然-通訊》(Nature Communications)雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心張蘅研究組和朱健康研究組題為The genome of broomcorn millet 的研究論文。該研究完成了糜子基因組精細圖
研究團隊合作發布白木香基因組精細圖譜
近日,中國熱帶農業科學院熱帶生物技術研究所和中國農業科學院深圳農業基因組研究所崔鵬團隊合作發布了白木香基因組精細圖譜,相關研究結果已發表在GigaScience期刊。該基因組精細圖譜的發布將為野生白木香種群保護生物學、沉香結香機制和香味基因及樹種的進化研究奠定良好基礎,也為進一步基于基因組的白木
OPGEN全基因組圖譜應用系列——鞭蟲全基因組測序
鞭蟲是一種常見的土壤傳播寄生蟲,地理分布廣,感染率高,寄生于人體盲腸,導致人體慢性感染,對人類危害巨大。鞭蟲的全基因組測序研究由著名的桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)完成,發表在世界頂級期刊《Nature Genetics》上。該研究通過對2種不同
我國科學家完成扇貝基因組精細圖譜繪制
日前,中國海洋大學教授包振民團隊完成了扇貝基因組精細圖譜繪制,探究原始動物祖先染色體核型進化、軀體結構多樣性產生、眼睛起源及其調控機制等,在動物宏觀進化研究領域取得重要進展。相關成果日前發布于《自然.生態學與進化》。 動物界99%的物種隸屬于雙側對稱動物,進化學家推測這些雙側對稱動物可能起
世界首個杜仲全基因組精細圖繪出
記者從位于鄭州的中國林科院經濟林研究開發中心了解到,該研究中心副主任杜紅巖研究員主持的項目“杜仲育種群體建立與綜合利用技術研究”取得重大突破,日前通過國家林業局驗收。項目選育出的10個杜仲良種通過國家林木良種審定,獲得國家發明ZL14項,榮獲國家和省部級科技進步獎5項;繪制完成杜仲全基因組精細圖
小須鯨全基因組圖譜獲破譯
11月25日,韓國海洋科學技術研究所、深圳華大基因研究院等宣布成功破譯了小須鯨全基因組圖譜,并對鯨類獨特生理習性的遺傳學機制進行了分析。相關成果在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 人們一直癡迷于海洋生物是如何演化為陸生生物的。鯨類的進化卻反其道而行之,由陸生向水生演化,和陸生偶蹄動物如牛、豬等
中國啟動十萬人基因組計劃:繪制國人精細基因組圖譜
科學家們希望通過繪制中國人精細基因組圖譜,來研究疾病健康和基因遺傳的關系。 此次啟動的“中國十萬人基因組計劃”覆蓋地域包含我國主要地區,涉及人群除漢族外,還將選擇人口數量在500萬以上的壯族、回族等9個少數民族。 基因是DNA上有遺傳效應的片斷,人類的生、老、病、死等都與基因有關。而基因組和
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日,記者從中國科學院水生生物研究所獲悉,該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成,相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹,該研究采用鳥槍法測序策略,分別對一
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃(OGP)團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日,牡蠣基因組計劃(Oyster Genome Project,OGP)項目組宣布,
我國完成朱鹮全基因組序列圖譜繪制
?????? 4月15日,深圳華大基因研究院與西安交通大學聯合在西安公布了瀕危野生動物朱鹮的全基因組序列圖譜,這是繼雞基因組、珍珠鳥基因組、火雞基因組之后,我國完成 的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列圖譜。朱鹮這種被稱為“東方寶石”的珍稀鳥類目前世界僅存千余只,這一研究成果將對于挽救和保護朱
首張非洲人全基因組圖譜問世
據《自然》雜志報道,2月6日,美國加州Illumina生物技術公司宣布,他們首次對一位非洲男子進行了完整的基因組測序。?在此之前,科學家已經對兩位白人男性(James Watson和Craig Venter)和一位中國男性進行了全基因組測序,但從未對非洲人進行研究。因此,這位匿名的尼日利亞約魯巴人男
我國學者成功完成小麥A基因組的測序和精細圖譜繪制
小麥是全球最重要的糧食作物,養活了世界上40%的人口,提供了人類所需熱能和蛋白質的20%。我國是世界上小麥生產和消費大國,常年種植面積為2,400萬公頃左右,年產量近1.3億噸。生產上廣泛種植的普通小麥是一個經兩次自然雜交而形成異源六倍體,含有A、B和D三個亞基因組,其基因組大(約17 Gb,是
斜紋夜蛾精細基因圖譜繪出
28日,記者從西南大學獲悉,該校家蠶基因組生物學國家重點實驗室聯合法國、日本、美國等多國研究機構,在全球首次繪制出斜紋夜蛾精細基因圖譜,并于25日發表于國際權威期刊《自然·生態學與進化》上。該研究成果揭示了斜紋夜蛾的高質量基因組精細圖譜,以及群體變異圖譜和基因表達圖譜,可為其防治提供科學依據。
香港中大破解鼻咽癌全基因組圖譜
香港中文大學7日宣布,該校醫學院研究人員成功破解鼻咽癌的全基因組圖譜,這一突破性發現有助評估鼻咽癌病人的預后情況,并向鼻咽癌的個人化治療邁出一大步。 鼻咽癌是華南地區常見的癌癥,也是一種極具侵略性的頭頸癌。據介紹,鼻咽癌大多與感染EB病毒相關。由于缺乏早期病征,60%至70%患者于確診時已屆晚
中國學者最新Nature-Genetics文章:破譯又一關鍵基因組
生物通報道:來自中國水產科學研究院黃海水產研究所等處的研究人員發表了題為“The genome and transcriptome of Japanese flounder provide insights into flatfish asymmetry”的文章,破譯了日本牙鲆(Japanese
多國科學家破解硬粒小麥全基因組圖譜
近日,來自意大利、加拿大、德國等多國科研機構的科學家共同在Nature Genetics上發表了題為“Durum wheat genome highlights past domestication signatures and future improvement targets”的文章,繪制
首張拓撲異構酶II全基因組剪切圖譜
DNA切割酶對基因結構調節起著關鍵作用。研究人員發現,它在導致癌癥的(如白血病和實體瘤)易位(translocations)異常重排中表現活躍。 II型拓撲異構酶(type II topoisomerase, TOP2)通過斷裂DNA雙鏈磷酸二酯鍵,來更正DNA連環數,使細胞DNA正常轉錄、復
我國完成首部高原瀕危物種全基因組序列圖譜
12月25日,由青海大學和深圳華大基因研究院共同發起并承擔的藏羚羊基因組序列圖譜在青海大學醫學院宣告繪制完成,這是世界上第一部繪制完成的高原瀕危物種全基因組序列圖譜,也是中國科學家對全球基因組科學的又一重大貢獻。 藏羚羊是我國青藏高原特有的物種,其生存環境高寒、缺氧,自然條件極為嚴酷。在喜
我國科學家發布大黃魚全基因組圖譜
由浙江海洋學院、上海交通大學、復旦大學等高校研究機構聯合破譯的大黃魚全基因組圖譜,日前在世界權威期刊——《自然》周刊發表。這是繼半滑舌鰨之后,我國公布的第二個海水魚類的基因組圖譜,也是世界上第一個石首科魚類基因組圖譜,標志著我國海洋生物學的研究真正進入基因組時代。 自1985年大黃魚人工養殖
破解了香氣之謎-蠟梅的染色體水平精細基因組圖譜公布
“一花香十里,更值滿枝開。”凌寒怒放的蠟梅,是萬花凋零的寒冬里一道亮麗的風景,其香味濃郁而獨特,成為歷代文人墨客揮筆高歌的對象。蠟梅為何冬季開花?其獨特香味由何而來?蠟梅 華中農大供圖 近日,華中農業大學劉秀群、趙凱歌研究組和金雙俠研究組聯合西南林業大學陳龍清研究組,在《基因組生物學》在線發表
我國科研機構聯合破譯白公式豚全基因組圖譜
南京師范大學、華大基因等單位的科研人員成功破譯了白鱀豚全基因組圖譜,為解析白鱀豚獨特的生活習性及進化歷程奠定了重要的遺傳學基礎,同時也為哺乳動物尤其是鯨類的研究與保護提供了寶貴資源。最新研究成果今天在《自然·通訊》雜志發表。 科研人員對一只雄性白鱀豚進行了全基因組測序,并構建了高質量基因組
科學家首次繪制小鼠全基因組沉默子圖譜
近日,中國農業科學院農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊構建了小鼠全基因組沉默子圖譜,闡明了其基本特征,并發現了影響細胞重編程效率的重要沉默子。相關研究成果發表在《先進科學》(Advanced Science)上。轉錄調控在生物體發育和細胞分化中至關重要,而沉默子作為關鍵的順式調控元件,通過結合
我國繪制完成世界首個鵝全基因組序列圖譜
6月3日,深圳華大基因研究院和浙江省農業科學院、象山縣浙東白鵝研究所聯合召開新聞發布會,宣布“鵝全基因組序列圖譜繪制完成”。這是我國獨立研究完成的全世界首個鵝全基因組序列圖譜,這一研究成果對于揭示家鵝繁殖、抗逆、生長、肉質、羽色等性狀的遺傳基礎,鵝的馴化、不同鵝種的生物學分類、中國家鵝
我國科學家完成鯉魚全基因組序列圖譜繪制
近日,由中國水產科學研究院首席科學家孫效文牽頭,中國水產科學研究院聯合黑龍江水產研究所、中科院基因組研究所、哈佛大學、奧本大學等單位組建的國際合作研究團隊,完成了鯉魚全基因組序列圖譜繪制,在國際上首個完成全面解析的異源四倍體硬骨魚類基因組圖譜。該研究成果于9月21日在國際生物學權威期刊《自然—
科學家首次繪制小鼠全基因組沉默子圖譜
近日,中國農業科學院農業基因組研究所豬基因組設計育種創新團隊構建了小鼠全基因組沉默子圖譜,闡明了其基本特征,并發現了影響細胞重編程效率的重要沉默子。相關研究成果發表在《先進科學》(Advanced Science)上。轉錄調控在生物體發育和細胞分化中至關重要,而沉默子作為關鍵的順式調控元件,通過結合