遺傳發育所植物組蛋白H3K27me3去甲基化酶研究獲進展
PcG介導的組蛋白H3第27位賴氨酸上三甲基化(H3K27me3)在基因沉默和發育調控中起著至關重要的作用。小鼠胚胎干細胞中超過10%的基因受該種修飾調控,擬南芥中超過7,000個基因受該修飾調控。擬南芥中H3K27me3主要由CLF和SWN兩個甲基轉移酶催化,并招募LHP1結合以有效抑制基因表達。在哺乳動物中H3K27me3修飾是可逆的,但植物中并不存在哺乳動物中H3K27me3去甲基化酶KDM6的直系同源物。此前有研究表明,擬南芥中H3K27me3甲基化也是可以被主動去除的,因此揭示H3K27me3去甲基化的分子機制是植物表觀遺傳學研究中的一個重要科學問題。 中國科學院遺傳與發育生物學研究所曹曉風研究組對植物組蛋白去甲基化酶基因家族進行了系統鑒定和功能分析。該研究組首先建立了植物細胞內組蛋白去甲基化酶活性檢測體系,通過該體系發現擬南芥REF6/JMJ12可以特異性地去除H3K27雙甲基化和三甲基化修飾。過表達REF......閱讀全文
研究揭示擬南芥組蛋白去甲基化酶JMJ13的結構功能
3月21日,《自然-通訊》(Nature Communications)雜志在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所上海植物逆境生物學研究中心杜嘉木研究組、中科院遺傳與發育生物學研究所曹曉風研究組和河北師范大學孫大業研究組合作完成的題為The Arabidopsis H3
“RNA-甲基化”研究匯總——擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育
DNA甲基化與擬南芥的免疫力
DNA甲基化有助于擬南芥的免疫力,它動態調控了某些基因的表達,讓植物能夠抵御細菌感染。近日,一篇在線發表于《PNAS》上的文章闡述了以上研究成果。 美國加州索爾克生物學研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人員利用MethylC測序鑒
組蛋白甲基化修飾研究再獲突破
日前,復旦大學徐彥輝課題組在組蛋白甲基化修飾研究領域獲得新進展,相關成果發布在《分子細胞》上,該項研究得到了國家自然科學基金面上項目的資助。 組蛋白甲基化修飾是一種非常重要的表觀遺傳修飾,參與調節異染色質形成、X染色體失活、基因印記及DNA的損傷修復等多種生命過程。關于組蛋白去甲基化酶的研究是
擬南芥RNA核糖甲基化修飾研究方面獲進展
3月30日,中國科學院生物物理研究所研究員葉克窮課題組、北京大學現代農學院博士王玉秋和中科院遺傳與發育研究所研究員李家洋課題組合作在Nucleic Acids Research上發表了題為Profiling of RNA ribose methylation in Arabidopsis tha
云序生物最新“RNA-甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期,
云序生物最新“RNA-甲基化”研究匯總擬南芥篇
關于RNA甲基化修飾的研究成果在Nature,Science,Cell等高分期刊上頻頻亮相,并一次次刷新人們對生命科學的認知。擬南芥作為植物界中研究RNA甲基化修飾的先行者,許多學者將它作為研究對象,并與最新m6A、m5C RNA甲基化測序技術結合,證實到RNA甲基化廣泛存在于擬南芥各個發育期,
組蛋白修飾與DNA甲基化之間的關系
在引起基因沉默的過程中,沉默信號(DNA甲基化、組蛋白修飾、染色質重新裝配)是如何進行的?誰先誰后?這是一個“雞和蛋”的問題,目前仍處于研究階段,還沒有定論。研究發現DNA甲基化和組蛋白乙酰化是一個相互促進、加強的過程,如許多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG結合蛋白—
何新建等擬南芥葉酸多聚谷氨酰基化研究獲進展
2013年7月23日,北京生命科學研究所何新建實驗室在《The Plant Cell》雜志在線發表題為“Folate polyglutamylation is involved in chromatin silencing by maintaining global DNA methyl
遺傳發育所植物組蛋白H3K27me3去甲基化酶研究獲進展
PcG介導的組蛋白H3第27位賴氨酸上三甲基化(H3K27me3)在基因沉默和發育調控中起著至關重要的作用。小鼠胚胎干細胞中超過10%的基因受該種修飾調控,擬南芥中超過7,000個基因受該修飾調控。擬南芥中H3K27me3主要由CLF和SWN兩個甲基轉移酶催化,并招募LHP1結合以有效抑制基因表
著名學者朱健康院士Cell-Research發表表觀遺傳學研究成果
生物通報道:轉座子通常是通過表觀遺傳學機制(包括DNA甲基化)保持沉默的。12月9日,在《Cell Research》雜志上發表的一項研究中,來自中科院上海生命科學研究院、美國普渡大學以及中科院遺傳與發育生物學研究所的研究人員,在擬南芥中將一對Harbinger轉座子衍生蛋白(HDPs)——HD
揭露CG甲基化的遺傳性和相互作用
將表觀遺傳標記(例如DNA甲基化)靶向特定位點的能力在基礎研究和作物植物工程中都很重要。但是,靶向DNA甲基化的遺傳性,其如何影響基因表達以及正確建立所需的表觀遺傳特征尚不清楚。 2021年5月25日,浙江大學劉琬璐及加利福尼亞大學洛杉磯分校Steven E. Jacobsen共同通訊在Nat
華南植物園表觀遺傳相關研究取得新進展
近年來,隨著大量表觀遺傳現象的發現與報道,植物表觀遺傳學已經成為植物分子生物學的研究熱點。表觀遺傳修飾不改變生物體DNA的序列,通過DNA的甲基化、組蛋白修飾和染色質重塑等途徑調節基因的表達。其中,組蛋白修飾方式包括組蛋白的乙酰化、甲基化、磷酸化和泛素化等。組蛋白甲基化水平受組蛋白甲基轉移酶和組
研究發現去甲基化酶REF6是基因組中靶向的重要因素
核小體是真核生物染色質的基本單位,由DNA纏繞組蛋白八聚體構成。組蛋白翻譯后共價修飾是表觀遺傳調控的重要方式之一,通過影響染色質的狀態而調控基因表達等過程。組蛋白H3第27位賴氨酸的三甲基化修飾(H3K27me3)通過維持基因的沉默狀態,在動植物細胞命運決定以及生長發育中發揮重要的調控作用。基因
上海生科院揭示擬南芥DNA主動去甲基化調控新機制
12月9日,《細胞研究》(Cell Research)雜志在線發表了中國科學院上海生命科學研究院上海植物逆境生物學研究中心朱健康研究組題為A pair of transposon-derived proteins function in a histone acetyltransferase c
PLoS-Genet:何新建等模式植物擬南芥研究獲進展
2014年1月22日,北京生命科學研究所何新建實驗室在《PLOS Genetics》雜志在線發表題為“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
中科大破譯植物組蛋白特有修飾位點調節擬南芥開花時間
中國科學技術大學生命科學學院及中國科學院分子卓越中心教授丁勇課題組,發現植物組蛋白H2A第95絲氨酸磷酸化修飾位點,該位點系植物特有的位點,經磷酸化的95絲氨酸,能夠調節擬南芥的開花時間,以及組蛋白變化H2A.Z的富集。相關結果以Phosphorylation of histone H2A se
擬南芥精氨酸甲基轉移酶AtPRMT5功能研究獲新進展
蛋白質是生物體結構與功能的基本單位,是所有生命活動的物質基礎和生理功能的重要執行者。蛋白質翻譯后修飾是調節蛋白質生物學功能的關鍵步驟之一。作為基因產物,幾乎所有的蛋白質都要經過翻譯后的剪切修飾才能成為成熟蛋白質。目前已發現的蛋白質翻譯后修飾形式已經多達100種以上,其中蛋白質精氨酸
新研究揭示水稻組蛋白甲基化調控根系核心菌群
根系微生物組與植物的養分吸收、抗病抗逆等生長發育過程密切相關,其在植物根系的定殖和組裝受環境和植物遺傳途徑等因素的影響。表觀遺傳調控是調節染色體行為和基因表達的重要機制,探究表觀遺傳途徑與植物根系微生物的關系能夠更系統地揭示植物生長發育過程。表觀遺傳調控與宿主微生物組的關系已在動物模型中得到研究
關于組蛋白修飾的方式—甲基化的基本信息介紹
組蛋白甲基化是由組蛋白甲基化轉移酶(histonemethyl transferase,HMT)完成的。甲基化可發生在組蛋白的賴氨酸和精氨酸殘基上,而且賴氨酸殘基能夠發生單、雙、三甲基化,而精氨酸殘基能夠單、雙甲基化,這些不同程度的甲基化極大地增加了組蛋白修飾和調節基因表達的復雜性。甲基化的作用
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾,這些修飾可以調控基因的表達,由此決定細胞的狀態,影響細胞的分化和發育。近年來人們發現,mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控,比如m6A(N6-methyladenosine)。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
中國學者發表RNA甲基化重要成果
基因組DNA和組蛋白上存在可逆的表觀遺傳學修飾,這些修飾可以調控基因的表達,由此決定細胞的狀態,影響細胞的分化和發育。近年來人們發現,mRNA和其他RNA也存在類似的表觀遺傳學調控,比如m6A(N6-methyladenosine)。 西北農林科技大學、中科院上海植物逆境生物學研究中心和美國普
擬南芥轉化
實驗概要本實驗以擬南芥為試材介紹了轉化及篩選的過程。主要試劑1. 滲透培養基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH調至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%瓊脂PNS或水溶液2. 篩選培
染色質修飾如何調控基因表達?-中國學者提出新見解
中科院分子植物科學卓越創新中心/植物生理生態研究所植物逆境生物學研究中心的研究人員最新發表兩篇Nature Genetics文章,利用生化、分子、遺傳、組學及結構生物學等研究方法,分別揭示了植物特有染色質凝縮蛋白EMF1與含BAH結構域的SHL和EBS形成BAH-EMF1復合體而介導植物基因沉默
Polycomb組蛋白與染色質相互作用的關鍵機制
2021年6月,Genome Research雜志在線發表了法國巴黎薩克雷大學植物科學研究所Moussa Benhamed教授為通訊作者題為“Polycomb-dependent differential chromatin compartmentalization determines gen
我國揭示KDM5亞家族組蛋白去甲基化酶的底物識別機制
12月12日,中國科學院植物逆境生物學研究中心杜嘉木課題組,中科院院士、中科院遺傳與發育生物學研究所曹曉風課題組合作完成的論文,以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substr
廣州生物院研制出速測組蛋白甲基化試紙條
近日,中科院廣州生物醫藥與健康院曾令文研究組,研制出一種快速靈敏檢測組蛋白甲基化的試紙條。相關成果發表在《分析化學》上? ? ? ? 近日,中科院廣州生物醫藥與健康院曾令文研究組,研制出一種快速靈敏檢測組蛋白甲基化的試紙條。相關成果發表在《分析化學》上。 據介紹,組蛋白甲基化是一種重要的表觀遺
植物DNA去甲基化的機理和功能
10月19日,Journal of Integrative Plant Biology(JIPB)在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心上海植物逆境生物學研究中心郎曌博研究組題為The mechanism and function of active DNA demethylation i
遺傳發育所發現植物組蛋白去甲基化酶招募的新機制
核小體作為真核生物染色質的基本單位,由DNA纏繞組蛋白八聚體構成。組蛋白N端存在多種共價修飾,這些翻譯后修飾通過影響染色質的狀態而調控基因表達等過程。組蛋白H3第27位賴氨酸的三甲基化修飾(H3K27me3)通過維持基因的沉默狀態,在動植物細胞命運決定以及發育中起著重要的調控作用。實驗室前期研究
H3K27me3調控植物熱記憶新機制
2021年6月9日,日本奈良科學技術研究所科研團隊,在著名學術期刊Nature communications發表題為“H3K27me3 demethylases alter HSP22 and HSP17.6C expression in response to recurring heat i