Cell:不讓基因沉默的RNAi途徑
“這項研究的獨特之處在于――之前,我們知道RNAi能用于調控基因,或者完全關閉基因。而這項研究中,我們發現的是一種通過piRNA途徑,保護基因不被沉默的RNAi機制,這種機制能作為一種保護形式,讓基因得以表達。” ――Darryl Conte Jr.博士 生物機體采用了多種戰略方法來識別,阻擊外來入侵DNA片段,像是病毒中帶有DNA片段。比如許多病毒都會在其生命周期中生成雙鏈RNA,而RNA干擾(RNAi)機制被認為是識別這種結構,啟動沉默應答的方法之一。 來自麻省醫學院的研究人員近期發現了一種與RNAi相關,能偵查到入侵者的新機制,這種機制與之前通過識別dsRNA,或者一些外來序列其他異常特征的方法不同,新方法是通過將外來序列和之前表達的RNA記憶進行比較,一旦識別出差異來,一種稱為外來DNA片段的“表觀記憶”就會產生,并且一代傳給一代,永久沉默這一基因。 這種與RNAi相關的現象被稱為RNAe(R......閱讀全文
科學家鑒別出可抑制致死性腦瘤癌基因表達的小RNA分子
近日,刊登在國際雜志Genes & Development上的一篇研究論文中,來自美國西北大學的研究人員通過研究發現,一種名為miR-182的小RNA分子可以抑制多形性膠質母細胞瘤(GBM)小鼠機體中的促癌基因的表達,而GBM是一類致死性難以治愈的腦瘤。 目前標準療法藥物主要是通過損傷DNA來
研究稱環境影響基因表達
隨環境改變“脾氣”的小蜜蜂 幾年前,美國伊利諾斯大學阿巴納香檳分校昆蟲學系的吉恩·E·魯濱遜教授,請墨西哥南部的伙伴幫他捕獲了1000只新生的小蜜蜂——500只性情溫和的意大利蜜蜂和500只生性兇猛的非洲蜜蜂。這兩個蜜蜂亞種在基因上相似得幾乎難以分辨,但后者卻在領地防御上厲害很多。 魯濱遜
Science開發創新基因表達研究方法
來自卡羅林斯卡學院和瑞典皇家理工學院(KTH)的科學家們,開發出了一種高分辨率的新方法來研究組織中活化的基因。這種方法可用于所有的組織類型,對于臨床前研究和癌癥診斷均具有價值。他們的研究結果發布在7月1日的《科學》(Science)雜志上。 疾病會改變組織中一些RNA分子和蛋白質的表達。在實驗
原核生物基因表達調控模式及其分子機制
原核生物基因的表達調控最重要的特點是操縱子模式,從調控水平來看主要在轉錄水平,即對RNA合成的調控,翻譯水平次之。通常有兩種方式:①起始調控,即啟動子調控;②終止調控,即衰減子調控。原核基因組的調控機制:通過負調控和正調控因子所進行的復合調控,阻遏蛋白與操縱基因結合,妨礙RNApol與P結合形成開放
PNAS:小分子讓癌細胞停工研究
德克薩斯大學西南醫學中心的科學家們,鑒定了一個能關閉前列腺癌細胞生長的重要步驟。 ERG蛋白會促使正常前列腺細胞轉變為癌細胞,人們發現去除ERG會破壞一個關鍵的致癌轉錄回路,這一策略有望成為前列腺癌的新治療方式。 助理教授Dr. Ralf Kittler對 ERG蛋白進行了深入研
Nature子刊:RNA測序鑒定小膠質細胞獨特表達基因
馬薩諸塞州綜合醫院(MGH)的研究者采用一種新的測序方法,鑒定了一組被腦免疫細胞——稱為小膠質細胞—— 用來感知需要其做出反應的致病組織、毒素或損傷細胞的基因。這些基因的鑒定,能使我們更好地理解小膠質細胞在正常大腦和神經退行性疾病中的作用,為保護諸如阿爾茨海默氏病和帕金森氏綜合癥引起的損傷帶
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式。轉
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
植物葉綠體基因組基因表達調控的研究
葉綠體基因組的特點是具相同或相關功能的基因組成復合操縱子結構。這一特點有利于葉綠體基因的表達與調控,例如rpoB-rpoC-rpoC 2操縱子是由編碼RNA聚合酶各個亞基的基因聚合在一起而形成的,而psbI-psbK-psbD-psbC操縱子則編碼PSⅡ的部分蛋白質。葉綠體基因組基因表達調控方式
專家指南:如何開展基因表達研究(二)
Q2:您采取哪些質量控制步驟? Gary Hardiman(加州大學圣地亞哥分校) 對于涉及RNA的應用,利用安捷倫的生物分析儀或類似產品對RNA樣品進行質量控制是必需的,可確保RNA是完整的,沒有降解。對于芯片,cRNA 的生物分析儀分析也很有用,可確保雜交之前均一的轉錄本擴增
專家指南:如何開展基因表達研究(三)
Q4:您在分析基因表達數據時通常借助哪些生物信息學工具? Gary Hardiman(加州大學圣地亞哥分校) ? 利用內部腳本對讀取進行QC ? 定位到參考基因組(Bowtie 2) ? 新的剪接檢測(Cufflinks) ? 轉錄本定量(FPKM) ? 差異
專家指南:如何開展基因表達研究(一)
眾所周知,在不同的情況下,在不同的組織中,基因表達的水平也不同。如今,研究人員可利用多種技術來追蹤基因表達水平的差異,如定量 PCR、芯片或測序。《Genome Technology》雜志這一次請來了幾位科學家,讓他們分享一下應如何選擇這些技術。此外,研究人員也談到了解決質量控制和數據分
小分子RNA
RNA一度被認為僅僅是DNA和蛋白質之間的“過渡”,但越來越多的證據清楚的表明,RNA在生命的進程中扮演的角色遠比我們早前設想的更為重要。RNA 干擾(RNA interference)的發現使得人們對RNA調控基因表達的功能有了全新的認識,更因為可以簡化/替代基因敲除而成為研究基因功能的有力工具,
小分子療法
小分子療法 15日,PTC Therapeutics公布了一項針對DMD和貝克肌營養不良(BMD)患者的最新研究結果,顯示從常規療法轉為Emflaza(deflazacort)治療后6個月的平均隨訪期內,大部分患者顯示病情改善。>>閱讀更多 16日,羅氏(Roche)旗下基因泰克(Genet
細胞內的分子聚集有利于基因表達
活細胞內部是個擁擠的場所,各種及其他大分子緊緊擠在一起。據物理學家組織網7月14日報道,最近,美國卡內基·梅隆大學一個研究小組利用人造細胞系統,對這些聚集在一起的分子進行了近似研究,發現這種緊密聚集有利于基因表達過程,尤其是在其他條件不理想的情況下。這一發現有助于合成生物學家將來開發出人造細胞,
小桐子花芽中響應細胞分裂素的基因表達模式
能源植物小桐子(Jatropha curcas L.)為大戟科多年生木本植物,其種子含油量約40%,被認為是一種很有應用潛力的能源植物。然而,由于小桐子的雄花多、雌花少、產量低,生產成本高,阻礙了小桐子的產業化種植。因此,進行小桐子花發育調控機制的研究,有助于改良小桐子農藝性狀、培育高產品種。
國外研究發現細胞基因表達新機制
捷克馬薩里克大學中歐技術研究所的科研團隊發現了一種新的細胞分化基因表達機制。該研究項目名為“植物減數分裂的調控及其操作技術的發展”,相關成果發表在《科學》上。 該團隊開發了一種獨特的方法,使用特殊顯微鏡實時連續成像觀察植物細胞減數分裂,并掌握原生質體技術,成為目前全球僅有的兩個可實時觀察植物減
研究發現人類基因表達新機制
一項新研究有可能會改變科學家們對于人類蛋白質生成過程的認識。來自芝加哥大學的研究人員發現單基因可以借由同一條信使RNA序列,編碼生成兩種不同的蛋白質。他們的研究結果在線發布在7月3日的《細胞》(Cell)雜志上,闡明了從前未知的一種人類基因表達機制,并為開發出新的治療策略來對抗迄今無法治愈的神經
數字PCR在基因表達差異研究的應用
數字PCR由于檢測時完全不依賴傳統的Ct值即可實現真正意義上的絕對定量,因而可以提供比實時熒光定量PCR更精確的基因差異表達研究,尤其對于那些靶基因表達差異微小的情況,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表達分析;等位基因的不平衡表達;單細胞基因表達分析;外泌體核酸分子定量分析等。
rhpPC基因協同調節III型分泌系統基因表達的分子機制
III型分泌系統是大多數革蘭氏陰性病原細菌(包括植物病原菌和動物病原菌)感染宿主的重要“武器”,是由蛋白復合體構成的跨膜分子裝置。病原菌通過III型分泌系統將一系列效應蛋白注入宿主細胞內,從而逃避宿主細胞的免疫防御并建立感染。III型分泌系統基因的表達受各種環境因素和宿主因素的影響,在豐富培養基
抗原變異基因家族相互排斥性表達的分子機制
2月6日,國際學術期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)在線發表了中國科學院上海巴斯德研究所江陸斌課題組題為DNA helicase RecQ1 regulates mutually exclusive expression of virulence genes in Plasmodium fa
研究揭示基因表達調控核心復合物LDB1/SSBP2的分子機制
12月31日,《美國國家科學院院刊》(PNAS)在線發表了題為Crystal structure of human LDB1 in complex with SSBP2 的論文,該項工作由中國科學院生物物理研究所許文青/梁棟材課題組和美國國立衛生研究院Ann Dean課題組合作完成。 增強子是
分子植物卓越中心揭示細胞分裂素快速激活基因表達的分子機制
細胞分裂素(cytokinin)是一種重要的植物激素,在植物的生長發育中扮演著多種角色,包括維持分生組織、促進維管組織分化、調控葉片衰老和促進再生等。以往研究表明,細胞分裂素的信號傳遞類似于細菌的雙組分系統,通過磷酸中轉系統將信號從細胞膜傳遞到細胞核內,進而激活特定的下游基因表達。此磷酸中轉系統
新研究揭示非小細胞肺癌發展分子機制
近日,暨南大學基礎醫學與公共衛生學院研究員范駿、暨南大學中醫學院教授戴勇團隊和南京市第一醫院副主任醫師周丹陽團隊合作,研究探討了非小細胞肺癌中,八聚體結合蛋白3(POU3F3)異常高表達通過促進非小細胞肺癌細胞三磷酸腺苷生成,進而推動非小細胞肺癌進展的具體分子機制。相關成果發表于《尖端科學》(Adv
基因改造后的酶能用多種糖基修飾小分子
經過基因工程的改造,酶能夠用更多種類的糖基來修飾小分子,這是研究人員在9月號在線出版的《自然—化學生物學》(Nature??Chemical??Biology)期刊上報告的。???自然界的小分子是許多天然藥物的基礎,而許多天然小分子的活性會因附加其上的糖分子而改變。因此,如何改變糖分子是新藥發現的關
分子遺傳學詞匯等位基因特異的寡核苷酸
中文名稱:等位基因特異的寡核苷酸英文名稱:allele specific oligonucleotide;ASO定 義:與基因點突變熱點區互補的人工合成的寡核苷酸序列。應用學科:遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)
什么是基因表達調控?基因表達調控有什么意義
意義:1.適應環境、維持生長和增殖:生物體賴以生存的外環境是在不斷變化的,為了生存,所有活細胞都必須對外環境變化作出適當反應,調節代謝,以適應環境變化。生物體適應環境、調節代謝的能力與蛋白質分子的生物學功能有關。而蛋白質的水平又受基因表達的調控。2.維持個體發育與分化:多細胞生物調節基因的表達除為適
中科院植物所闡明重復基因表達分化分子機制
中國科學院植物研究所孔宏智研究組對重復基因表達分化的模式、過程和機制進行了研究,并取得重要突破。相關論文日前在線發表于《植物生理學》。 研究人員以擬南芥中的APETALA1(AP1)和CAULIFLOWER(CAL)基因為例進行了研究,這兩種基因在表達的時、空、量上均有差異,且差異與其調控區一