微生物所發表中國微生物組數據平臺
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心馬俊才團隊題為gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the archiving, standardization and analysisof microbiome data 的研究論文。gcMeta平臺是一個微生物基因組及微生物組數據的管理、分析和發布平臺，為國內外用戶提供一站式的從數據存儲、數據分析到數據發布的服務，目前已經整合了來自中科院微生物組計劃及國內外多個重要項目的數據。該平臺的發布將有效支撐我國微生物組研究并為未來我國國家微生物組計劃的實施提供重要的支持。 近年來，美國、歐盟都陸續啟動了微生物組相關的研究項目。但微生物組大數據的收集、存儲、功能挖掘和開發利用一直是制約微生物組發展的......閱讀全文
世界微生物數據中心落戶微生物所
在近日召開的第12屆國際菌種保藏大會上，經過大會專家委員會評審并經世界菌種保藏聯合會理事會審議通過，中國科學院微生物研究所在眾多的競爭者中脫穎而出，成為世界微生物數據中心（World Data Center for Microorganisms, WDCM）新的主持單位。 W
微生物所發表中國微生物組數據平臺
10月26日，《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心馬俊才團隊題為gcMeta: a Global Catalogueof Metagenomics platform to support the ar
全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的
我國微生物大數據平臺建設獲進展
近日，中國科學院微生物研究所微生物資源與大數據中心、世界微生物數據中心團隊題為World Data Centre for Microorganisms: an information infrastructure to explore and utilize preserved microbia
首個國際ISO微生物數據標準正式發布
微生物資源是國家的重要戰略資源，微生物數據資源則是微生物資源共享和開發的關鍵環節，數據資源的豐富性、準確性和共享水平，決定著微生物學領域研究和應用的綜合能力。 2020年11月9日，國際標準化組織生物技術委員會（ISO/TC 276）正式發布微生物資源中心數據管理和數據發布標準（ISO 217
全球微生物組大數據搜索引擎上線
日前，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心正式發布首個微生物組大數據搜索引擎——MSE（Microbiome Search Engine； http://mse.single-cell.cn），使得以整個微生物組為分析單元的智能搜索和大數據挖掘成為現實。 微生物組，又稱“菌群”。
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日，《自然》在線發表中外科學家的合作成果，該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者，助理研究員劉琨為文章共同第一作者。該成果在《自然》報道? ?山東大學供圖微生物已在生物制造、
全球最大的海洋微生物組數據庫建立
9月4日，《自然》在線發表中外科學家的合作成果，該成果建立了全球最大的海洋微生物組數據庫，從中發掘塑料降解酶、基因編輯工具、抗菌肽等重要基因資源。山東大學微生物技術國家重點實驗室教授李盛英為文章共同通訊作者，助理研究員劉琨為文章共同第一作者。 微生物已在生物制造、生物醫藥、生物農業、環境治理等
全球最大數字微生物數據庫建成
來自愛爾蘭、法國和意大利的科學家攜手，成功構建了全球最大的數字微生物庫——“阿波羅”（APOLLO）。“阿波羅”囊括了247092個計算模型，其中包含迄今為止最全面的人體微生物組計算模型，有望增進科學家對人體微生物組及其對健康影響的理解。相關論文發表于最新一期《細胞系統》雜志。 研究團隊重點關
國際微生物大數據聯合研究中心在京掛牌
近日，國家“863”計劃“微生物數字化信息系統集成關鍵技術研發”項目推進會在京舉行。其間，由中科院微生物所、中科院上海生命科學研究院、上海生物信息技術研究中心等單位組成的國際微生物大數據聯合研究中心掛牌。 隨著信息技術的發展，我國微生物大數據研究步入世界前列。據主持“微生物數字化信息系統集成關
世界微生物數據中心與泰國國家微生物資源保藏中心合作
9月11日至15日，世界微生物數據中心（World Data Center for Microorganisms，簡稱WDCM）主任、中科院微生物研究所信息中心主任馬俊才研究員赴泰國國家基因工程及生物技術中心（National Center for Genetic Enginee
微生物所舉辦第二屆世界微生物數據中心研討會
6月7日至8日，在中科院國際合作局和中科院生物局的支持下，由世界微生物數據中心（WDCM）、世界菌種保藏中心聯合會（WFCC）、聯合國教科文組織（UNESCO）、中科院應用微生物研究網絡（RNAM）、中科院微生物研究所、國際科技數據委員會（CODATA）、亞洲微生物資源保藏和可持
人類腸道微生物基因集－為研究提供精準數據支持
7月7日，由華南理工大學生物科學與工程學院博士研究生李俊樺為第一作者，與深圳華大基因研究院、丹麥哥本哈根大學等單位共同合作完成的《人腸道微生物組參考基因集》研究成果在《自然—生物技術》上發表。這是“華工—華大”基因組科學創新班學子在國際頂級學術期刊上以第一作者身份發表的第二篇文章。 據介紹，人
基于微生物組大數據的疾病檢測方法來了
微生物組具有服務疾病診治與生態監控的巨大潛力，但是其影響因素錯綜復雜。如何通過菌群檢測實現快速精準的疾病診斷呢？中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心發明了基于菌群大數據搜索的疾病檢測方法，為此共性問題提供了原創的解決方案。該工作于3月17日在線發表于mSystems（美國微生物學會會刊）
揚州環保局公布上半年微生物監測數據
昨天，我市環保局環境監測中心站公布了我市上半年度主要河流、重點湖泊、城市飲用水源地和市區空氣微生物監測工作，并編制完成《2015年上半年揚州市生物監測報告》（下簡稱《報告》）。記者昨天了解到，我市上半年空氣微生物輕微污染，主要由于濕度較大，今年霉菌總數比去年增加6.5倍。 最新發布 上半
國家微生物科學數據中心：保障主權，推動共享
細菌、病毒、真菌、支原體、衣原體…… 談及它們，你定會避之不及。但是，你知道嗎？在地球生物圈，它們占據著重要位置——環境、食品、醫藥、健康、工業、農業、化學化工、材料、生物安全，與人類存續相關的所有環節，幾乎都與它們有關。其家族成員還包括放線菌、立克次氏體、螺旋體……它們，都是微生物。 微生
中國科學家建立全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的全球首個青藏高原冰川微生物
中國科學家建立全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的
WDCM亞洲微生物數據資源管理與應用培訓班
5月27日至6月12日，由中科院國際合作局“發展中國家科技培訓班”項目支持，世界微生物數據中心（WDCM）、世界菌種保藏中心聯合會（WFCC）、聯合國教科文組織（UNESCO）、亞洲微生物資源保藏和可持續利用聯盟（ACM）、亞洲資源中心研究網絡（ANRRC）、中科院應用
科學家如何還原和挖掘海洋微生物基因數據？
·GOMC數據庫為未來的研究提供了豐富的資源，包括開發新型生物技術產品、探索微生物的生態功能、研究微生物與環境變化的關系、開發新的疾病治療方法等。基因是生命的“源代碼”，其中不僅蘊藏著自然演化的奧秘，也囊括了數之不盡的生物工程資源。如何獲取、分析和應用基因數據，是現代生物學的核心議題之一。近日，一支
微生物領域數據庫及其分析系統建設研究取得進展
中國科學院計算機網絡信息中心大數據技術與應用發展部與中科院微生物研究所等，在微生物領域數據庫及其分析系統建設方面取得新進展，提出了一種利用語義網技術構建知識圖譜的方法，可將冠狀病毒相關的毒株、基因組、蛋白序列、蛋白結構、抗體、文獻和ZL等多源異構數據映射至資源描述框架（RDF），并構建了基于語義網框
青島能源所微生物組大數據分析工具開發獲進展
元基因組是當前微生物組大數據最主要的存在形式之一。由于元基因組數據的復雜性、異質性以及指數級增長的體量，從中深度且快速發掘微生物群落結構和功能上的變化規律，一直是業界的一個重要技術瓶頸。近日，中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞研究中心發表了元基因組高性能計算分析軟件Parallel-MET
升級換代“加速跑”－走進國家微生物科學數據中心
“人家憑什么給你交數據？”作為國家微生物科學數據中心和中國科學院微生物科學數據中心主任，馬俊才時常這樣問自己。 “數據中心不是檔案庫，我們也不是‘官老爺’，一定要給對方提供所需的增值服務。”從事數據庫建設多年，這是他的深切體會。 國家微生物科學數據中心和中國科學院微生物科學數據中心的前身可追
解碼“基因寶藏”：最全海洋微生物基因數據庫出爐
9月4日晚，華大生命科學研究院（簡稱“華大”）聯合山東大學、英國東安格利亞大學、中國海洋大學、廈門大學、丹麥哥本哈根大學等機構，在《自然》上發表研究成果。他們通過對目前已公開的海洋微生物宏基因組數據進行分析和深度挖掘，構建了迄今為止最完整的海洋微生物基因數據庫，并從中發現了大量具有應用潛力的基因資源
微生物數據分析云平臺上線，人人都能做生信分析
GeneDock與中國疾病預防控制中心（中國CDC）傳染病預防控制所合作開發的微生物數據分析云平臺已于今日正式上線開放（https://analysis.mypathogen.org/）。這一項目由中國疾控中心傳染病預防控制所發起，主要是為了提升傳染病領域大數據的利用效率，實現高通量測序技術在
最大的海洋微生物基因數據庫有助于藥物發現
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516176.shtm迄今對包括細菌、病毒和真菌在內的海洋微生物基因進行的最全面分析，可為研究人員發現抗生素、追蹤氣候變化影響和保護瀕危物種奠定基礎。1月16日，相關成果發表于《科學前沿》。據《自然》報道，
蘇曉泉團隊開發出基于微生物組大數據的疾病檢測方法
微生物組具有服務疾病診治與生態監控的巨大潛力，但是其影響因素錯綜復雜。如何通過菌群檢測實現快速精準的疾病診斷呢？中國科學院青島生物能源與過程研究所單細胞中心發明了基于菌群大數據搜索的疾病檢測方法，為此共性問題提供了原創的解決方案。該工作于3月17日在線發表于mSystems（美國微生物學會會刊）
若斌生物參展CBIFS：微生物培養中提供可追溯、可視化數據
2023年3月17日，第十五屆中國國際食品安全技術論壇（CBIFS 2023）在重慶開幕，來自國內外的100多家知名廠商，在本次論壇上集中展出食品安全分析、微生物和快速檢測最新產品與解決方案。第十五屆中國國際食品安全技術論壇 本屆CBIFS 2023上，分析測試百科網邀請四川若斌生物科技有限責
最大的海洋微生物基因數據庫有助于藥物發現
迄今對包括細菌、病毒和真菌在內的海洋微生物基因進行的最全面分析，可為研究人員發現抗生素、追蹤氣候變化影響和保護瀕危物種奠定基礎。1月16日，相關成果發表于《科學前沿》。據《自然》報道，2021年，研究人員構建了一個目錄，其中包含約3億組陸地微生物和海洋微生物的基因。現在，沙特阿拉伯阿卜杜拉國王科技大
“百萬微生態”計劃將構建全球最大人體微生物組數據庫
2019年10月26日，“百萬微生態”國際合作計劃（MMHP）在深圳第14屆國際基因組學大會（ICG-14）上正式啟動，來自中國、瑞典、丹麥、法國、拉托維亞等多國科學家將合作開展微生物宏基因組研究，致力于在未來三至五年內對100萬份來自腸道、口腔、皮膚、生殖道等器官的微生物組樣品進行測序分析，繪