昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系,其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進化研究的主題。 中國科學院昆明動物研究所科研團隊在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其近緣種柑橘鳳蝶兩種鳳蝶基因組(Li et al., 2015, Nature Communications)的基礎上,對廣泛分布在東亞、南亞以及東南亞并對體色進化及物種分化具有重要研究意義的碧鳳蝶Papilio bianor Cramer, 1777進行了基因組研究。運用三代長讀長測序技術(PacBio),結合高通量染色體構象捕獲(Hi-C)技術,成功地組裝了碧鳳蝶染色體(29條常染色體和1條性染色體)水平的基因組,這是首個利用Hi-C技術完成的......閱讀全文
研究發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系,其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
昆明動物所發布碧鳳蝶染色體水平基因組
蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。鳳蝶科是具有重要進化地位的蝴蝶支系,其豐富的色彩和形態等多樣性是昆蟲生態與進
鳳蝶的五彩斑斕或源于基因快速進化
科技日報記者 趙漢斌蝴蝶因其豐富的色彩和形態等多樣性,長期以來是昆蟲生態與進化研究的重要主題。近日,中國科學院昆明動物研究所進化基因組學與基因起源學科組在蝴蝶顏色進化方面取得新進展,為了解鳳蝶色素的起源提供了新見解,同時為探索蝴蝶的進化、生態學和保護提供了重要的理論基礎。蝴蝶是鳳蝶總科的物種統稱,因
染色體水平冬瓜參考基因組發布
近日,廣東省農業科學院蔬菜研究所發布了染色體水平冬瓜參考基因組。相關研究發表于Scientific Data,廣東省農業科學院蔬菜研究所副研究員羅文龍和副研究員閆晉強為該論文共同第一作者,廣東省農業科學院蔬菜研究所研究員江彪為通訊作者。廣東省農業科學院蔬菜研究所于2019年對黑皮大冬瓜B227進行基
研究從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜,但這些研究的分辨率比較低,尚沒有深入到精細的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
“六谷”豐登?——首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ? ??中國菰 (Zizania latifolia) 原產于中國,屬于禾本科稻族菰屬,主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米,在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日,中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水稻研
首個豆科綠肥作物染色體水平基因組組裝完成
?紫云英? ? ? ?中國農科院供圖近日,中國農業科學院農業資源與農業區劃研究所肥料及施肥技術團隊完成了首個豆科綠肥作物——紫云英的染色體水平參考基因組組裝,并利用比較基因組學解析了紫云英共生結瘤的遺傳基礎。該研究填補了豆科綠肥作物基因組學研究的空白,為豆科植物與根瘤菌共生提供了新的見解。相關研究成
學者發表紫苞芭蕉和朝天蕉首個染色體水平基因組
近日,中國科學院華南植物園副研究員黃慧潤、研究員王崢峰團隊在國家自然科學基金項目的資助下,研究結合Oxford Nanopore和Hi-C測序技術成功組裝并發表了紫苞芭蕉和朝天蕉的首個染色體水平基因組。相關成果在線發表于《園藝研究》(Horticulture Research)。紫苞芭蕉和朝天蕉的花
“六谷”之一菰米首個染色體水平基因組組裝完成
中國菰? ? 中國農科院供圖? ? ??? ? 中國菰 (Zizania latifolia) 原產于中國,屬于禾本科稻族菰屬,主要分布于中國、韓國、日本和印度等國家。中國菰的穎果為菰米,在我國古代是重要的“六谷”之一。? ? 近日,中國農業科學院煙草研究所煙草功能成分與綜合利用創新團隊與中國水
科學家首次發布銀鯧高質量染色體水平參考基因組
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519516.shtm近日,中國科學院海洋研究所在銀鯧基因組學研究方面取得新進展,首次發布了我國重要名貴經濟魚類——銀鯧的高質量染色體水平參考基因組,相關研究成果在《自然》子刊《科學數據》在線發表。銀鯧隸屬
研究人員從從基因組水平揭示食肉目染色體進化規律
染色體進化是物種形成和演化的重要驅動因素。具有顯著核型差異的食肉目動物為染色體進化研究提供了很好的研究素材。雖然前人通過比較染色體涂色法建立了食肉目內許多物種的染色體比較圖譜,但這些研究的分辨率比較低,尚沒有深入到精細的核苷酸水平,也不能在核苷酸水平研究不同食肉目物種間的共線性區塊、染色體重排以
Cell:染色體水平油松基因組組裝和甲基化研究取得進展
近期,北京林業大學生物科學與技術學院聯合安諾優達在國際知名期刊Cell(IF:41.582)在線發表了題為“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者對油松進行了
我國科學家發布海帶高質量染色體水平參考基因組
近日,中國科學院海洋研究所海藻種質庫團隊在大型海藻基因組學研究方面取得重要突破,成功構建了海帶的高質量染色體水平參考基因組。該成果發表在國際期刊《科學數據》。這是該團隊在海洋經濟藻類基因組研究領域取得的又一重要成果,為海帶的遺傳改良和基因組學研究提供了關鍵資源。海帶孤雌生殖孢子體基因組組裝 海洋
破解了香氣之謎-蠟梅的染色體水平精細基因組圖譜公布
“一花香十里,更值滿枝開。”凌寒怒放的蠟梅,是萬花凋零的寒冬里一道亮麗的風景,其香味濃郁而獨特,成為歷代文人墨客揮筆高歌的對象。蠟梅為何冬季開花?其獨特香味由何而來?蠟梅 華中農大供圖 近日,華中農業大學劉秀群、趙凱歌研究組和金雙俠研究組聯合西南林業大學陳龍清研究組,在《基因組生物學》在線發表
太平洋潛泥蛤染色體水平基因組研究獲新進展
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516537.shtm
研究發布首個高質量染色體水平的哀牢髭蟾參考基因組
哀牢髭蟾(Vibrissaphora ailaonica)[Amphibiaweb(2019),Frost(2019)和中國兩棲類(2019)將其歸為Leptobrachium ailaonicum的同物異名] 俗稱“胡子蛙”、“深山角怪”,屬兩棲綱、無尾目、角蟾科,是中國特有種。該物種具有多個
日科學家發現鳳蝶產卵機理
日本JT生命志研究館和大阪大學、九州大學的一個聯合研究小組發現了鳳蝶的母親只選擇在幼蟲能夠食用的柑橘科葉片上產卵的機理和產卵時選擇可食用葉片的遺傳基因。這是科學家首次從遺傳基因角度了解到昆蟲選擇在幼蟲食物上產卵的本能。該發現加深了對昆蟲如何隨環境的變化改變食物種類以及昆蟲如何進化的理解。
我國科學家公布世界首個藏羚染色體水平高質量基因組
14日,記者從中國科學院西北高原生物研究所獲悉,該研究所張同作研究員聯合青海大學魏青副教授等團隊,成功組裝了藏羚染色體級別的基因組,首次獲得藏羚染色體水平的高質量基因組和注釋信息,為藏羚的適應進化遺傳機制、保護遺傳學研究及進一步探索物種遷徙行為的遺傳機制提供了重要基因組資源。相關結果發表在《自然》旗
昆明動物所首個高質量染色體水平的哀牢髭蟾參考基因組
哀牢髭蟾(Vibrissaphora ailaonica)[Amphibiaweb(2019),Frost(2019)和中國兩棲類(2019)將其歸為Leptobrachium ailaonicum的同物異名] 俗稱“胡子蛙”、“深山角怪”,屬兩棲綱、無尾目、角蟾科,是中國特有種。該物種具有多個
Nature解析基因組的水平轉移
在自然界中,兩種不同的植物偶爾會發生雜交。這可能會引發一些問題,因為父本和母本的遺傳信息并不相配。不過這個問題很容易解決。 只要親本植物將完整的遺傳信息傳遞給下一代(而不是一半),這樣染色體就能夠在減數分裂中正確配對,減數分裂是生殖細胞的形成途徑。在這種情況下,雜交形成的植物仍有繁殖能力,并形成
Nature:功能強大的“超級基因”
燕尾蝶通過翅膀的復雜圖案、顏色和結構進行擬態。日前,芝加哥大學的科學家們指出,這一復雜的機制受到doublesex的單基因調控,文章于三月五日發表在Nature雜志上。眾所周知,doublesex是控制昆蟲性別分化的關鍵基因,而這項研究表明該基因還具有控制擬態的強大功能。 “傳統觀點認為
昆明動物所研究團隊在蝴蝶基因組大小進化方面獲進展
蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。 中國科學院昆明動物研究所科研團隊在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其
蝴蝶基因組大小進化進展-發現表型多樣性進化遺傳基礎
蝴蝶因其豐富的形態多樣性,自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一,近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型,已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。 中國科學院昆明動物研究所科研團隊在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其
小葉茶染色體級別基因組圖譜聯合研究成果首次完成
近日,生物學預印本服務器(www.biorxiv.org)在線發表了中美科學家聯合研究團隊的最新成果,該團隊采用單分子實時測序(SMRT)和 Hi-C技術,在20多個代表性小葉茶品種中選用雜合度較低的小葉茶良種“碧云”,將組裝獲得的約2.85Gb 的基因組序列掛載到了15 條假染色體上,在國際上
“蠶姑娘”性染色體基因組密碼破解
7月8日,記者從西南大學獲悉,該校教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列,并揭示了鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化新機制。相關研究成果近日發表于期刊《科學進展》。家蠶性別的決定機制一直受到科學界關注。以家蠶為代表的鱗翅目昆蟲性染色體在昆蟲界獨樹一幟。不同于大多數昆蟲性染色體組為XX/XY系統
染色體級別的銀杏參考基因組公開
銀杏果實 曹福亮供圖 作為裸子植物銀杏綱唯一的孑遺物種,銀杏不僅具有特殊的科學研究價值,而且具有重要的應用價值。 近日,南京林業大學聯合中國農業科學院農業基因組研究所在《自然—植物》在線發表了染色體級別的銀杏參考基因組,是目前已發表的組裝質量最高的裸子植物參考基因組。 論文共同通訊作者、中國工
“蠶姑娘”性染色體基因組密碼破解
7月8日,西南大學教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列,并揭示了鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化新機制。相關研究成果近日發表于期刊《科學進展》。 家蠶性別的決定機制一直受到科學界關注。以家蠶為代表的鱗翅目昆蟲性染色體在昆蟲界獨樹一幟。不同于大多數昆蟲性染色體組為XX/XY系統,其性染
《Nature-Genetics》染色體外DNA會改變癌基因擴增水平
惡性膠質瘤(glioblastoma,GBM)是最常見且最具攻擊性的腦癌,標準治療反應很差,兩年生存率僅為15%。最近,《Nature Genetics》的一篇文章發現了GBM腫瘤耐藥的一個關鍵密碼。 為了靶向遏制GBM的攻擊性,杰克遜實驗室(Jackson Laboratory,JAX)教授
從全基因組水平構建鳥類物種生命樹
近日,“第一屆萬種鳥類基因組(B10K)項目國際研討會——鳥類復雜性狀的進化解析與調控”在北京召開。會議由中國科學院昆明動物研究所主辦,中國科學院動物研究所協辦。會議組織委員會主席由昆明動物所特聘講座研究員張國捷和動物所研究員雷富民擔任。 據悉,由中國科學院昆明動物研究所、中國科學院動物研究所
微核實驗在染色體水平檢測DN-A損傷實驗
實驗步驟 一、材料 1. 胞質分裂阻滯微核試驗 2. 微核的著絲點檢測 (1)從硬皮病 C R E S T 亞型的患者中取得的血清樣本。 (2) F I T C 標記的兔抗人 I g G 二抗。 (3) 過氧化物酶