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  • circRNA機制研究匯總(二)

    結合蛋白:(2)CircNfix與Ybx1結合并促進其降解:circNfix和對照組的蛋白質譜分析(A)。采用Ybx1、Nedd4l或陰性IgG抗體進行RIP實驗(云序生物提供該服務)(B)。P0 CMs中過表達circNfix后Ybx1蛋白表達水平(C-D)。qRT-PCR檢測P0 CMs中Ybx1 mRNA表達水平(E)。RNA FISH在P0 CMs中過表達和不表達circNfix時, circNfix和Ybx1的亞細胞共定位(F)。分餾實驗表明,circNfix過表達促進了Ybx1在細胞質中的易位,增加了Ybx1在細胞質中的降解(G)。在circNfix和Ybx1干擾后,細胞周期蛋白A2和細胞周期蛋白B1的表達水平(H)。ChIP-qPCR(云序生物提供該服務)檢測顯示,cyclin A2和cyclin B1啟動子中Ybx1結合位點擴增(I)。細胞裂解物用抗Ybx1抗體免疫沉淀,用泛素(Ub)特異性抗......閱讀全文

    circRNA再發IF=18.88高分文章circRNA機制研究匯總

    超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調節因子,但其在心臟再生中的作用仍然未知。鑒于此,作者與他的團隊探究了與超增強子(SEs)相關的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生過程中的功能,并探究了其調節心臟重塑的分子機制

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    circRNA機制研究匯總(一)

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    circRNA在胃癌海綿調控機制的應用(一)

    環狀RNA (circRNA)作為新型非編碼RNA,具有比線性RNA更加穩定的環狀結構,可通過多種機制調控靶基因。近年來,circRNA被發現在多種腫瘤組織和細胞中異常表達,作為腫瘤的診斷生物標志物或治療靶點,具有巨大的價值,受到廣泛的關注。癌癥新的證據表明,circRNAs在癌癥的發生發展中起

    circRNA在胃癌海綿調控機制的應用(二)

    3. hsa_circ_0004872作為分子海綿吸附miR-224作者首先通過FISH實驗觀測到hsa_circ_0004872主要分布在細胞質。然后通過RIP-qPCR驗證到hsa_circ_0004872與AGO2蛋白結合,pull down實驗顯示hsa_circ_0004872與miR-2

    circRNA在膀胱癌中的作用機制

    研究背景膀胱癌(Bladder cancer)是一種常見的泌尿系統腫瘤,由于易轉移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的發病機制,有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA,是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發,深入闡述

    circRNA在胃癌海綿調控機制的應用(三)

    6. 體內實驗驗證hsa_circ_0004872抑制腫瘤發生和轉移通過皮下注射過表達hsa_circ_0004872的BGC-823細胞和對照組BGC-823細胞發現,過表達hsa_circ_0004872組生成的腫瘤明顯小于對照組,并且腫瘤中Smad4和p21表達升高。尾靜脈注射實驗也發現過表達

    全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(二)

    3. 環狀RNA的差異表達與前列腺癌的進展有關研究者對144個前列腺癌進行了聚類分析,與線性RNA相比,環狀RNA最強模式與它們在每個樣本中的總體豐度相一致。另外,極端circRNA分布的患者的預后明顯較circRNA分布穩定的患者差,同時極端circRNA index組也與更高的轉移發生率

    全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(一)

    2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Circ

    circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究

      在全球范圍內原發性肝癌是造成癌癥相關死亡的三大原因之一。肝細胞癌(HCC)是最常見的原發性肝臟癌癥。由于缺乏高特異性和敏感性的早期診斷生物標志物,HCC患者往往得不到及時有效的治療。相比于長鏈非編碼RNA和miRNA,circRNA作為一種新型環狀RNA,具有共價閉合環狀結構,在組織和血液中具有

    circRNA研究新成果

    研究背景放射治療是肝癌治療的有效手段之一,然而放射性肝纖維化是肝癌放射治療的常見并發癥,制約肝癌放療效果。放射性肝纖維化的發病機制仍未明晰,有待進一步研究。環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類廣泛參與多種生物學進程的非編碼RNA,在人類多種疾病的發生和發展中發揮重要作

    circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究(二)

    5. circ_104075可以結合miR-582-3p作者首先想到circRNA通過海綿作用吸附miRNA,直接調控靶蛋白的表達,作者利用miRanda數據庫預測了circ_104075最有可能結合的5個miRNA,接著通過RNA pull down技術(云序生物提供此項實驗)捕獲復合物后RT-q

    《EMBO-reports》上闡述circRNA在膀胱癌中的作用機制

      研究背景   膀胱癌(Bladder cancer)是一種常見的泌尿系統腫瘤,由于易轉移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的發病機制,有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA,是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發,

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    Cell》重磅!全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制!

      2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci

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    前列腺癌circRNA研究

    circRNA研究是現在科研領域的大紅人,作為熱點領域,circRNA的研究成果猶如雨后春筍,層出不窮。我們也可以看到,雖然circRNA很熱,但是目前對circRNA的理解還處于社會主義初級階段,有大把大把的空間值得探索。伯豪作為國內第一批科研服務公司,在circRNA領域也是緊隨時代潮流,致力于

    伯豪客戶《EMBO-reports》上闡述circRNA在膀胱癌中的作用機制

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    Arraystar-CircRNA芯片應用于肝癌研究

    第二軍醫大學免疫所所長、中國醫學科學院院長曹雪濤院士課題組主要從事天然免疫與免疫調節基礎研究、免疫治療應用研究。近期其實驗室用Arraystar CircRNA芯片研究發現circMTO1可以作為microRNA的吸附海綿結合癌基因miR-9從而上調p21的表達從而抑制肝細胞癌(hepatocell

    環狀RNA(circRNA)主要有哪些類型

    目前發現的circRNA主要來源于基因外顯子,但多項研究也表明circRNA的類型比想象的要復雜,可以來自基因組上多種基因結構。?同一基因位置可以產生不同類型的環狀RNA

    Nature子刊:circRNA促進口腔鱗狀細胞癌的發生發展

      中南大學湘雅二醫院陳林老師長期從事口腔癌的發生發展機制及治療。近期,其實驗室通過Arraystar circRNA芯片發現一種調控口腔鱗狀細胞癌發生發展的circRNA分子—circRNA_100290。CircRNA_100290通過內源競爭結合miR-29,從而解除miR-29對CDK6的抑

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    非編碼RNA(ncRNA)在前列腺癌發生發展中的作用機制

      人類基因組計劃的研究結果顯示, 僅有2.5萬~3萬個蛋白質編碼基因, 占總基因組序列不到3%, 其余基因組序列轉錄產生的RNA都是非編碼RNA(non-coding RNA, ncRNA). ncRNA與惡性腫瘤發生發展關系密切. 近年來, 關于ncRNA中的長鏈非編碼RN(lncRNA)以及環

    環狀RNAs帽獨立的翻譯蛋白及其在癌中的作用

      環狀RNA是一種共價封閉RNA,在真核生物中廣泛表達。circRNA參與多種生理和病理過程,但其調控機制尚不完全清楚。隨著RNA深度測序技術的發展和算法的改進,發現了一些circRNA通過cap-independent機制編碼蛋白質,參與腫瘤發生發展的重要過程。本文在概述CircRNAs的基礎上

    雄激素受體通過上調ADAR1抑制circRNA表達,促進肝細胞癌

    浙江大學醫學院附屬邵逸夫醫院蔡秀軍教授在腹部外科、肝膽胰外科、微創外科、移植外科等研究方面有豐富的經驗,近期其團隊利用Arraystar circRNA芯片研究了肝細胞癌(HCC)中雄激素受體(AR)對circRNA表達的影響。研究發現AR可以結合到RNA編輯酶ADAR1的啟動子區上調ADAR1

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    研究人員揭示環狀RNA或可成為阿爾茲海默癥的臨床新指標

      2019年10月7日,來自美國華盛頓大學醫學院的Carlos Cruchaga教授研究團隊在Nature Neuroscience上在線發表題為“An atlas of cortical circular RNA expression in Alzheimer disease brains de

    環狀RNA研究深度剖析(一)

    1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀青年基金,兩

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